Perbedaan utama antara isoschizomer dan neoschizomer adalah isoschizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama dan membelah DNA pada posisi yang sama, sedangkan neoschizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda.
Enzim restriksi atau endonuklease restriksi adalah enzim yang memecah DNA menjadi fragmen di atau dekat tempat pengenalan spesifik. Mereka memotong DNA di situs restriksi. Enzim restriksi biasanya diklasifikasikan menjadi lima kelompok berdasarkan struktur, apakah mereka memotong substrat DNA mereka di situs pengenalan mereka, dan apakah situs pengenalan dan pembelahan terpisah satu sama lain. Lebih dari 3600 restriksi endonuklease telah diidentifikasi. Sekitar 800 enzim restriksi tersedia secara komersial. Isoschizomers dan neoschizomers adalah dua jenis enzim restriksi berdasarkan situs pengenalan dan spesifisitas pembelahan.
Apa itu Isoschizomer?
Isoschizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama dan membelah DNA pada posisi yang sama. Enzim restriksi ini memiliki spesifisitas yang sama. Enzim restriksi pertama yang ditemukan yang mengenali urutan yang diberikan dikenal sebagai prototipe, sementara semua enzim restriksi yang diidentifikasi selanjutnya yang mengenali urutan yang sama disebut isoschizomer. Namun, isoschizomer mungkin berbeda dalam preferensi lokasi, kondisi reaksi, sensitivitas metilasi, dan aktivitas bintang. Isoschizomer diisolasi dari strain bakteri yang berbeda. Oleh karena itu, mereka mungkin memerlukan kondisi reaksi yang berbeda. Dalam beberapa kasus, hanya satu dari sepasang isoschizomer yang dapat mengenali bentuk situs restriksi yang termetilasi dan tidak termetilasi. Di sisi lain, enzim restriksi lainnya hanya dapat mengenali bentuk situs restriksi yang tidak termetilasi. Fitur khusus dari isoschizomer ini membantu identifikasi keadaan metilasi situs restriksi sambil mengisolasinya dari keadaan bakteri.
Misalnya, AgeI dan BshT1 mengenali dan membelah 5'-A↓CCGGT dalam pola yang sama. HpaII dan MSPI adalah pasangan isoschizomer lainnya. Mereka berdua mengenali urutan 5'-C↓CGG-3' ketika tidak termetilasi. Tetapi ketika urutan C kedua dimetilasi, hanya MSPI yang dapat mengenali urutan ini sedangkan HpaII tidak dapat mengenalinya.
Apa itu Neoschizomer?
Neoschizomers adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda. Dalam beberapa aplikasi biologi molekuler khusus, ini adalah fitur yang sangat membantu. Neoschizomer adalah subset dari isoschizomer. Contoh terkenal untuk neoschizomer adalah SmaI (5'-CCC↓GGG-3') dan XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); keduanya mengenali urutan 5'-CCCGGG-3' tetapi membelahnya pada posisi yang berbeda. Dengan demikian, kedua enzim restriksi ini menghasilkan jenis ujung yang berbeda. Dalam hal ini, SmaI menghasilkan ujung yang tumpul, dan XmaI menghasilkan ujung yang menonjol 5'.
Gambar 01: Neoschizomers
Contoh lain adalah pasangan enzim restriksi MaeII dan Tail. Prototipe MaeII (A↓CGT) menghasilkan fragmen DNA dengan ekstensi 2 basa 5’, dan Neoschizomer Tail (ACGT↓) menghasilkan fragmen DNA dengan ekstensi 4 basa3’.
Apa Persamaan Antara Isoschizomer dan Neoschizomer?
- Isoschizomers dan neoschizomers adalah dua jenis enzim restriksi.
- Mereka sebagian besar ditemukan pada prokariota.
- Mereka adalah bagian dari sistem restriksi-modifikasi (RM) yang ditemukan pada bakteri dan archaea.
- Keduanya adalah molekul protein.
- Keduanya membelah DNA menjadi fragmen.
Apa Perbedaan Isoschizomer dan Neoschizomer?
Isoschizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama dan membelah DNA pada posisi yang sama, sedangkan neoschizomer adalah enzim restriksi yang memiliki urutan pengenalan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda. Jadi, inilah perbedaan utama antara isoschizomer dan neoschizomer. Selanjutnya, isoschizomer memiliki kekhususan yang sama sedangkan neoschizomer memiliki kekhususan yang berbeda.
Infografis berikut mencantumkan perbedaan antara isoschizomer dan neoschizomer dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Isoschizomers vs Neoschizomers
Enzim restriksi adalah enzim pemotong DNA. Mereka juga disebut gunting molekuler. Ada berbagai jenis enzim restriksi. Berdasarkan tempat pengenalan dan spesifisitas pembelahan, enzim restriksi dibedakan menjadi dua jenis yaitu isoschizomer dan neoschizomer. Isoschizomer memiliki urutan pengenalan yang sama dan membelah DNA pada posisi yang sama sedangkan neoschizomer memiliki urutan pengenalan yang sama tetapi membelah DNA pada posisi yang berbeda. Jadi, inilah perbedaan utama antara isoschizomer dan neoschizomer.
