Perbedaan utama antara snRNA dan snoRNA adalah bahwa snRNA melibatkan penyambungan alternatif pra-mRNA sementara snoRNA melibatkan modifikasi rRNA dan tRNA, pengeditan mRNA, dan pencetakan genom.
RNA kecil adalah molekul RNA polimer yang terdiri dari kurang dari 200 nukleotida. Mereka biasanya non-coding. Mereka ada di antara RNA pembawa pesan untuk membawa sinyal. RNA kecil berasal dari RNA untai ganda sempurna, yang diproduksi oleh aksi RNA polimerase yang bergantung pada RNA. RNA kecil memainkan peran penting dalam diferensiasi sel, pertumbuhan dan proliferasi, apoptosis, metabolisme, migrasi, dan pertahanan. Oleh karena itu, RNA kecil adalah pengatur penting dan kritis dari perkembangan dan fisiologi. RNA nuklir kecil dan RNA nukleolar kecil adalah dua kelas molekul RNA kecil.
Apa itu snRNA?
RNA inti kecil atau snRNA adalah kelas molekul RNA kecil yang ditemukan dalam inti sel eukariotik. Panjang rata-rata snRNA adalah sekitar 150 nukleotida. RNA polimerase II atau RNA polimerase III mentranskripsi snRNA. Fungsi utama snRNA adalah pemrosesan RNA pra-pembawa pesan di dalam nukleus. Mereka juga membantu mengatur faktor transkripsi atau RNA polimerase II dan mempertahankan telomer.
Gambar 01: Mekanisme Kerja RNA Kecil
Ada dua kelas snRNA berdasarkan fitur sekuens umum dan faktor protein terkait seperti protein LSm pengikat RNA. Kedua kelas tersebut adalah snRNA kelas Sm dan snRNA kelas Lsm. SnRNA kelas sm terdiri dari kandungan uridin tinggi U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11, dan U12. RNA polimerase II mentranskripsi snRNA kelas SM. Setelah transkripsi pra-snRNA, mereka biasanya menerima tutup 7-metilguanosin 5 'di dalam nukleus. Kemudian mereka diekspor ke sitoplasma melalui pori-pori nuklir untuk diproses lebih lanjut. SnRNA kelas Lsm memiliki kandungan uridin U6 dan U6atac yang tinggi. RNA polimerase III mentranskripsi snRNA kelas Lsm, dan tidak meninggalkan nukleus. Komponen snRNA manusia yang paling umum adalah U1 spliceosomal RNA, U2 spliceosomal RNA, U4 spliceosomal RNA, U5 spliceosomal RNA, dan U6 spliceosomal RNA.
Apa itu snoRNA?
Small nucleolar RNA atau snoRNA adalah kelas molekul RNA kecil yang memandu modifikasi kimia pada RNA lain seperti RNA ribosom, RNA transfer, dan RNA nuklir kecil. Setiap molekul snoRNA dikaitkan dengan sekitar empat protein inti dalam kompleks RNA/protein selama proses modifikasi. SnoRNA mengandung elemen antisense yaitu sekitar 10-20 nukleotida. Basa-basa ini melengkapi urutan yang mengelilingi nukleotida yang menargetkan modifikasi pada molekul pra-RNA.
Gambar 02: RNA Nukleolar Kecil
Ada dua kelas snoRNA. Mereka adalah snoRNA kotak C/D dan snoRNA kotak H/ACA. snoRNA kotak C/D dikaitkan dengan metilasi, dan snoRNA kotak H/ACA dikaitkan dengan pseudo-uridilasi. Setiap molekul snoRNA bertindak sebagai panduan untuk satu atau dua modifikasi dalam RNA target. snoRNA kotak C / D berisi dua motif urutan pendek yang dilestarikan C dan D, masing-masing di dekat ujung 5 'dan 3' dari snoRNA. Daerah pendek yang terdiri dari 5 nukleotida menyusun hulu kotak C dan hilir kotak D dan membentuk struktur kotak batang. Ini mendekatkan motif kotak C dan D. Struktur kotak induk penting untuk sintesis snoRNA dan lokalisasi nukleolar yang benar. Kotak snoRNA H/ACA memiliki struktur sekunder yang terdiri dari dua jepit rambut dan dua daerah beruntai tunggal. Ini umumnya dikenal sebagai struktur jepit rambut-engsel-jepit rambut-ekor. SnoRNA kotak H/ACA juga terdiri dari dua motif yang dilestarikan H dan ACA. Keduanya terletak di daerah beruntai tunggal. Kotak H di engsel, dan ACA di daerah ekor. Tiga nukleotida membentuk ujung 3’ dari urutan.
Apa Persamaan Antara snRNA dan snoRNA?
- snRNA dan snoRNA adalah RNA kecil.
- Keduanya ada dalam sel eukariotik.
- Keduanya adalah molekul RNA non-coding.
- Selain itu, mereka berpartisipasi dalam memodifikasi RNA selama proses transkripsi.
Apa Perbedaan Antara snRNA dan snoRNA?
snRNA berpartisipasi dalam penyambungan alternatif pra-mRNA sementara snoRNA terutama memodifikasi molekul RNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara snRNA dan snoRNA. Selanjutnya, snRNA memiliki panjang sekitar 150 nukleotida dan sering ditemukan terkait dengan sekelompok protein dan kompleks yang disebut ribonukleoprotein nuklir kecil. snoRNA memiliki panjang sekitar 60-170 nukleotida dan terutama ditemukan di nukleolus.
Selain itu, snRNA ditranskripsi oleh RNA polimerase II atau RNA polimerase III sedangkan, snoRNA hanya ditranskripsi oleh RNA polimerase II.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara snRNA dan snoRNA dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – snRNA vs snoRNA
snRNA dan snoRNA adalah kelas molekul RNA kecil. snRNA berpartisipasi dalam splicing alternatif pra-mRNA sementara snoRNA terutama memodifikasi molekul RNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara snRNA dan snoRNA. RNA kecil adalah molekul RNA polimer yang terdiri dari kurang dari 200 nukleotida panjangnya dan biasanya non-coding. snRNA ditemukan dalam inti eukariota. snoRNA ditemukan di archaea dan eukariota. Transkripsi snRNA terjadi melalui RNA polimerase II dan II, sementara hanya RNA polimerase II yang terlibat dalam transkripsi snoRNA. Jadi, ini merangkum perbedaan antara snRNA dan snoRNA.
