Perbedaan utama antara kotak TATA dan CAAT adalah bahwa kotak TATA adalah wilayah nukleotida yang dilestarikan yang memiliki urutan konsensus TATAWAW sedangkan kotak CAAT adalah wilayah nukleotida yang dilestarikan dengan urutan konsensus GGCCAATCT.
Kotak TATA dan kotak CAAT adalah dua wilayah nukleotida yang mempengaruhi transkripsi gen eukariotik. Mereka adalah urutan DNA non-coding yang ditemukan di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Bahkan, mereka ditemukan di wilayah regulasi, yang dikenal sebagai promotor. Baik kotak TATA dan kotak CAAT bertanggung jawab atas efisiensi transkripsi. Mereka adalah urutan konsensus yang tidak berubah selama proses evolusi.
Apa itu Kotak TATA?
Kotak TATA atau kotak Goldberg-Hogness adalah urutan konsensus yang ditemukan di wilayah promotor gen eukariotik. Kotak TATA adalah elemen inti dari promotor. Itu terletak 25 pasangan basa hulu dari situs inisiasi transkripsi. Itu dilestarikan sepanjang proses evolusi. Urutan konsensus kotak TATA adalah TATAWAW, di mana W adalah A atau T. Ini adalah urutan DNA non-coding. Namun, kotak TATA penting untuk transkripsi gen. Ini adalah situs pengikatan protein pengikat TATA (TBP) dan faktor transkripsi lainnya. Begitu mereka mengikat ke dalam kotak TATA, perekrutan RNA polimerase II dan regulasi transkripsi yang tepat terjadi pada gen eukariotik.
Gambar 01: Kotak TATA
Karena kotak TATA terlibat dalam regulasi transkripsi, mutasi kotak TATA dapat mengakibatkan perubahan fenotipik yang menyebabkan penyakit seperti kanker lambung, ataksia spinocerebellar, penyakit Huntington, kebutaan, -thalassemia, imunosupresi, sindrom Gilbert, dan HIV-1, dll.
Apa itu Kotak CAAT?
Kotak CAAT adalah wilayah nukleotida dengan urutan konsensus GGCCAATCT. Mirip dengan kotak TATA, kotak CAAT juga terletak di wilayah promotor gen. Oleh karena itu, terletak sekitar 75-80 pasangan basa hulu ke situs transkripsi.
Gambar 02: Kotak CAAT
Faktor transkripsi spesifik mengikat ke kotak CAAT. Pengikatan ini menstabilkan kompleks prainisiasi untuk pengikatan enzim RNA polimerase yang lebih mudah. Demikian juga, kotak CAAT berfungsi sebagai urutan pengaturan. Mutasi di wilayah kotak CAAT sangat mempengaruhi respon promotor dan regulasi transkripsi.
Apa Persamaan Kotak TATA dan CAAT?
- TATA dan CAAT adalah dua wilayah nukleotida yang ditemukan dalam urutan regulasi gen eukariotik.
- Mereka ditemukan di hulu ke situs inisiasi transkripsi.
- Keduanya adalah urutan DNA konsensus.
- Mereka penting untuk regulasi transkripsi, jadi mereka adalah urutan regulasi.
Apa Perbedaan Kotak TATA dan CAAT?
Kotak TATA adalah wilayah nukleotida yang dilestarikan yang ditemukan sekitar 25-30 pasangan basa di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Di sisi lain, kotak CAAT adalah wilayah nukleotida yang dilestarikan yang ditemukan sekitar 75-80 pasangan basa di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Jadi, inilah perbedaan utama antara kotak TATA dan CAAT. Selain itu, kotak TATA memiliki urutan konsensus TATAWAW sedangkan GGCCAATCT adalah urutan konsensus kotak CAAT.
Selain itu, perbedaan signifikan lainnya antara kotak TATA dan CAAT adalah bahwa kotak TATA menyediakan situs pengikatan untuk TBP dan faktor transkripsi dan berpartisipasi dalam regulasi transkripsi sementara kotak CAAT memberi sinyal situs pengikatan untuk faktor transkripsi RNA.
Di bawah infografis merangkum perbedaan antara kotak TATA dan CAAT.
Ringkasan – Kotak TATA vs CAAT
Kotak TATA dan kotak CAAT adalah dua bagian dari wilayah promotor gen eukariotik yang dilestarikan. Mereka terletak di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Keduanya mempengaruhi transkripsi gen dengan menyediakan situs untuk mengikat protein pengikat TATA dan faktor inisiasi transkripsi. Kotak TATA terletak 25-35 pasangan basa di hulu situs inisiasi transkripsi sedangkan kotak CAAT terletak 75-80 pasangan basa di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Urutan konsensus kotak TATA adalah TATAWAW sedangkan urutan konsensus kotak CAAT adalah GGCCAATCT. Demikian ringkasan perbedaan kotak TATA dan CAAT.
