Perbedaan utama antara urutan yang dilestarikan dan konsensus adalah bahwa urutan yang dilestarikan mengacu pada urutan asam nukleat atau asam amino yang serupa yang terjadi pada spesies yang berbeda atau sama dari generasi ke generasi sedangkan urutan konsensus adalah urutan nukleotida yang umum ditemui atau urutan asam amino yang ditemukan di wilayah DNA atau RNA atau protein yang sangat terkonservasi.
Organisme memiliki karakteristik yang sama dan berbeda. Ketika mempelajari hubungan antara organisme dan mengklasifikasikannya, genom atau susunan genetik organisme sangat penting. Ada beberapa urutan nukleotida atau asam amino yang umum di antara organisme yang berbeda. Urutan yang dilestarikan adalah urutan asam nukleat atau asam amino yang konsisten di antara spesies. Oleh karena itu, mereka penting secara filogenetik ketika menghasilkan pohon filogenetik. Dalam sekuens yang dilestarikan, ada sekuens nukleotida spesifik yang lebih umum ditemukan. Mereka dikenal sebagai urutan konsensus.
Apa itu Barisan Konservasi?
Sekuens yang dilestarikan adalah sekuens asam nukleat atau sekuens asam amino yang serupa antar spesies. Oleh karena itu, ini konsisten di seluruh spesies sepanjang evolusi. Umumnya, urutan ini dipertahankan oleh seleksi alam. Mereka tetap tidak berubah jauh ke belakang pohon filogenetik. Oleh karena itu, urutan yang dilestarikan penting dalam membangun pohon filogenetik. Diyakini bahwa sekuens yang sangat terkonservasi seringkali memiliki nilai fungsional yang penting. Mereka berguna dalam mengidentifikasi penyakit genetik juga. Namun, urutan yang dilestarikan dapat berupa urutan asam nukleat pengkode atau non-pengkode. Selain itu, urutan yang dilestarikan menunjukkan tingkat mutasi yang lebih lambat. Oleh karena itu, mereka menunjukkan perubahan yang sangat minim dalam komposisi mereka; terkadang, mereka tidak menunjukkan perubahan dari generasi ke generasi.
Gambar 01: Barisan Konservasi
Komponen RNA ribosom terdapat di semua domain kehidupan, sekuens homeoboks pada eukariota, dan tmRNA pada bakteri adalah beberapa contoh sekuens yang sangat terkonservasi. Identifikasi sekuens yang dilestarikan menjadi mudah ketika pendekatan bioinformatika, terutama alat penyelarasan sekuens, digunakan. Selain itu, penyelarasan beberapa urutan memfasilitasi visualisasi urutan yang dilestarikan.
Apa itu Urutan Konsensus?
Sekuens konsensus adalah sekuens yang umumnya ditemukan di wilayah DNA atau RNA tertentu yang dilestarikan. Ini adalah urutan nukleotida yang sangat spesifik. Sebagai contoh, ada urutan konsensus di -10 sebagai TATAAT (kotak Pribnow) dalam promotor E. coli, yang merupakan urutan yang sangat terkonservasi. Demikian pula, ada urutan konsensus lain: TTGACA di promotor E. coli di -35 juga. Urutan konsensus juga dikenal sebagai "kotak".
Gambar 02: Urutan Konsensus
Selain DNA dan RNA, protein juga memiliki urutan konsensus asam amino. Situs pengikatan protein sering diwakili oleh urutan konsensus. Enzim restriksi juga memiliki urutan konsensus. Selain itu, situs sambungan juga merupakan urutan konsensus. Mirip dengan urutan yang dilestarikan, urutan konsensus dapat dihitung dan divisualisasikan dengan alat bioinformatika.
Apa Persamaan Antara Urutan Konservasi dan Konsensus?
- Sekuens Konservasi dan Konsensus adalah sekuens asam nukleat atau asam amino yang umum di seluruh spesies.
- Sekuens yang dilestarikan dan konsensus dapat divisualisasikan dengan alat bioinformatika.
- Mereka banyak digunakan dalam biologi molekuler.
Apa Perbedaan Urutan Konservasi dan Konsensus?
Sekuens terkonservasi adalah sekuens asam nukleat atau asam amino yang konsisten antar spesies sedangkan sekuens konsensus sangat spesifik dan umumnya ditemukan basa atau asam amino di wilayah konservasi tertentu. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara urutan yang dilestarikan dan konsensus. Selain itu, perbedaan lain antara urutan yang dilestarikan dan konsensus adalah bahwa urutan yang dilestarikan secara filogenetik penting sementara urutan konsensus sering kali merupakan situs pengikatan protein, situs splice, situs pemotongan enzim restriksi, dll.
Ringkasan – Urutan Konservasi vs Konsensus
Sekuens terkonservasi adalah sekuens asam nukleat atau protein yang serupa di antara spesies hidup. Sebuah promotor, situs pengikatan ribosom, asal replikasi dan urutan asam amino dari protein histon adalah beberapa contoh dari urutan yang dilestarikan. Sebaliknya, urutan konsensus adalah basa atau asam amino spesifik yang lebih umum ditemukan dalam urutan yang dilestarikan. -10 kotak, -35 kotak promotor E. coli, situs pengikatan protein, situs sambatan dan situs yang mengenali enzim restriksi adalah beberapa contoh urutan konsensus. Jadi, ini adalah ringkasan perbedaan antara urutan yang dilestarikan dan konsensus.
