Perbedaan utama antara FISH dan CGH adalah bahwa FISH adalah teknik molekuler yang mendeteksi urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluoresen, sedangkan CGH adalah teknik sitogenetik molekuler lain yang mendeteksi perubahan dalam DNA genom.
Analisis sitogenetik memainkan peran penting dalam kedokteran ketika mendeteksi kelainan kromosom seperti aneuploidi, penghapusan, duplikasi, dan penataan ulang, dll. Kelainan kromosom pada akhirnya menyebabkan penyakit genetik seperti kanker, infertilitas, sindrom Down, sindrom Klinefelter, Turner sindrom, leukemia, dll. Ada berbagai metode sitogenetik molekuler untuk mendeteksi cacat dan penyakit yang disebutkan di atas. Di antara mereka, FISH (hibridisasi in situ fluoresen) dan CGH (hibridisasi genomik komparatif) adalah dua teknik hibridisasi yang kuat. Namun, kedua metode tersebut memiliki pro dan kontra.
Apa itu IKAN?
FISH adalah teknik hibridisasi asam nukleat yang dilakukan pada sebagian atau bagian jaringan, di seluruh jaringan atau sel. Ini adalah metode berbasis probe. Teknik ini bergantung pada teori pasangan basa komplementer Watson Crick, yang menghasilkan DNA – DNA hibrid atau DNA – RNA hybrid, yang dengan demikian dapat mendeteksi gen yang bermutasi atau dapat mengidentifikasi gen yang diinginkan. Lebih lanjut, teknik ini menggunakan sekuens DNA untai tunggal, sekuens DNA untai ganda, sekuens RNA untai tunggal atau oligonukleotida sintetis yang disiapkan menggunakan terjemahan nick sebagai probe yang melengkapi urutan gen yang diinginkan. Selain itu, fitur yang paling penting dari teknik ini adalah pelabelan probe dengan pewarna fluoresensi. Dengan demikian, probe mengikat dengan bagian komplementer dari kromosom dan membuatnya mudah untuk dideteksi.
Selain itu, FISH adalah metode yang sangat sensitif dan spesifik. Oleh karena itu, ini adalah teknik umum dalam penelitian dan diagnosis keganasan hematologis dan tumor padat. Tapi, FISH menunjukkan resolusi rendah. Ini juga membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang abnormalitas target untuk merancang urutan probe.
Gambar 01: IKAN
Ada banyak aplikasi FISH, terutama dalam diagnostik molekuler penyakit menular untuk mengidentifikasi keberadaan patogen dan mengkonfirmasi patogen melalui diagnostik molekuler. Selain itu, IKAN adalah teknik yang umum digunakan di bidang biologi perkembangan, kariotipe dan analisis filogenetik serta pemetaan fisik kromosom.
Apa itu CGH?
Hibridisasi genomik komparatif (CGH) adalah teknik sitogenetik molekuler berbasis DNA lainnya yang dapat mendeteksi perubahan urutan DNA genom. Metode tersebut merupakan metode lanjutan yang dapat menganalisis modifikasi kromosom dan gen untuk mendeteksi perubahan atau perubahan pada sekuens DNA genom. Selanjutnya, CGH membutuhkan isolasi dan fragmentasi DNA dari sampel eksperimental dan sampel referensi. Kemudian, sampel harus diberi label menggunakan dua pewarna fluoresen yang berbeda (biasanya merah dan hijau). Kemudian, kedua sampel dicampur dan diizinkan untuk hibridisasi kompetitif. Langkah terakhir adalah analisis sampel untuk perubahan DNA seperti duplikasi gen, kehilangan gen, dll. Terutama, mengukur perbedaan jumlah salinan DNA antara sampel uji dan sampel kontrol.
Gambar 02: CGH
Versi lain dari CGH tersedia sekarang; ini adalah metode yang lebih maju daripada CGH normal. Ini adalah teknik yang disebut CGH berbasis array atau aCGH. aCGH memungkinkan identifikasi yang tepat dari penghapusan gen atau urutan dalam ribuan urutan dalam satu percobaan tunggal.
Apa Persamaan Antara IKAN dan CGH?
- FISH dan CGH adalah dua teknik molekuler.
- Baik IKAN dan CGH bergantung pada hibridisasi asam nukleat.
- Juga, kedua teknik membutuhkan probe yang dirancang untuk mendeteksi target DNA tertentu.
- Kami menggunakannya untuk diagnosis penyakit genetik sebelum dan sesudah melahirkan.
- Selanjutnya, FISH dan CGH adalah alat yang sangat ampuh untuk mempelajari perubahan genomik.
- Mereka menggunakan pewarna fluoresen untuk memberi label pada probe.
Apa Perbedaan Antara IKAN dan CGH?
FISH adalah prosedur hibridisasi in situ yang menggunakan probe fluoresen untuk mendeteksi sekuens DNA spesifik, sedangkan CGH adalah teknik hibridisasi molekuler yang mendeteksi perubahan sekuens DNA genom. Jadi, inilah perbedaan utama antara FISH dan CGH.
Selain itu, FISH membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang kelainan target untuk merancang urutan probe, sementara CGH tidak memerlukan pengetahuan sebelumnya. Juga, perbedaan lebih lanjut antara FISH dan CGH adalah FISH menunjukkan resolusi terbatas sementara aCGH menunjukkan resolusi tinggi.
Infografik di bawah ini merangkum perbedaan antara FISH dan CGH.
Ringkasan – IKAN vs CGH
FISH dan CGH adalah dua teknik sitogenetik molekuler yang memfasilitasi deteksi urutan gen yang diinginkan. FISH memfasilitasi deteksi urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluoresensi sementara CGH memfasilitasi deteksi perubahan dalam DNA genom. Jadi, inilah perbedaan utama antara FISH dan CGH.
