Perbedaan utama antara knockout gen dan knockdown adalah bahwa knockout gen adalah teknik di mana gen yang diinginkan dihilangkan sepenuhnya (keadaan tidak beroperasi) untuk mempelajari fungsi gen sementara knockdown gen adalah teknik lain di mana gen minat dibungkam untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis.
Teknik genetik yang berbeda sedang digunakan untuk menyelidiki fungsi gen dalam sistem biologis yang hidup. Knockout gen dan knockdown adalah dua teknik tersebut. Teknik-teknik ini membantu para ilmuwan untuk mengidentifikasi aspek-aspek fungsional dari gen yang berbeda dalam organisme hidup.
Apa itu Gene Knockout?
Gene knockout adalah teknik genetik yang membuat satu atau lebih gen tidak berfungsi pada organisme hidup. Ini juga merupakan proses mematikan atau menghapus gen suatu organisme. Aplikasi utama dari teknik ini adalah untuk mempelajari fungsi gen. Proses ini mengevaluasi efek dari gen yang hilang atau dihilangkan. Proses knockout juga melibatkan enzim dan teknik penyambungan tertentu.
Gambar 01: Gen Knockout
Ada beberapa variasi dalam teknik knockout gen berdasarkan jumlah gen yang terlibat. Mereka adalah KO ganda (KO dua gen), KO tiga (KO tiga gen) dan KO empat kali lipat (KO empat gen). KO gen selanjutnya diklasifikasikan menjadi dua kelompok; KO heterozigot dan KO homozigot.
Apa itu Gene Knockdown?
Gene knockdown adalah prosedur eksperimental di mana prosedur ini menekan atau mengurangi ekspresi gen atau gen tertentu dari suatu organisme. Pembungkaman gen adalah definisi umum untuk gen knockdown. Selama prosedur ini, aktivasi atau degradasi mRNA yang dihasilkan melibatkan interferensi RNA (RNAi), RNA pengganggu kecil (siRNA) dan RNA jepit rambut pendek (shRNA).
Gambar 02: Pembungkaman Gen
Penggunaan utama knockdown gen adalah untuk menyelidiki peran gen tertentu dalam sistem biologis. Oleh karena itu, teknik ini menyelesaikan studi onkogen (Bcl-2 dan P53) dan gen yang menyebabkan penyakit saraf, infeksi virus, dan penyakit keturunan.
Apa Persamaan Antara Gen Knockout dan Knockdown?
- Kedua gen knockout dan knockdown gen adalah teknik genetik.
- Kedua teknik ini dapat mencegah ekspresi gen.
- Penggunaan utama kedua teknik ini adalah untuk menyelidiki fungsi gen yang diinginkan.
- Keduanya mampu mengidentifikasi kondisi penyakit yang berbeda (genetik).
- Keduanya dapat digunakan untuk satu atau lebih gen yang diinginkan.
Apa Perbedaan Gen Knockout dan Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gen knockout adalah operasi gen (penghapusan gen dari DNA) suatu organisme melalui teknik genetik yang berbeda. | Gene knockdown adalah prosedur eksperimental untuk menekan (mengurangi atau membungkam) ekspresi gen atau gen tertentu dari suatu organisme. |
| Fungsi | |
| Memfasilitasi studi fungsi gen dengan menganalisis hasil gen yang hilang. | Memfasilitasi studi onkogen, gen penyebab penyakit saraf, infeksi virus, dan penyakit keturunan. |
| Keterlibatan Agen RNA | |
| Keterlibatan agen RNA tidak signifikan dalam teknik ini. | Proses ini melibatkan agen seperti siRNA, shRNA, dan RNAi untuk menonaktifkan mRNA. |
| Penggunaan Agen Kimia | |
| Agen enzimatik digunakan. | Tidak ada bahan kimia seperti itu yang digunakan. |
| Efek pada Gen | |
| Menghapus gen sepenuhnya dari DNA. | Menekan atau membungkam gen. |
| Klasifikasi | |
| Double knockout, triple knockout dan quadruple knockout dan heterozigot dan homozigot knockout adalah berbagai jenis gen knockout. | Tidak ada sistem klasifikasi yang tersedia untuk pembungkaman gen. |
Ringkasan – Gene Knockout vs Gene Knockdown
Dua teknik yang kita bahas di sini; knockout gen dan knockdown, adalah metode untuk menyelidiki fungsi gen yang berbeda. Knockout gen sepenuhnya membuat gen tidak berfungsi sementara knockdown gen membungkam gen yang diinginkan. Namun, kedua prosedur tersebut mencegah ekspresi gen. Agen yang berbeda mampu menyelesaikan dua proses ini. Knock out gen adalah jenis penghapusan sedangkan knockdown gen adalah jenis inaktivasi. Inilah perbedaan antara gen knock out dan knockdown.
