siRNA vs miRNA
RNA adalah molekul yang sangat penting, yang membantu membangun kehidupan organisme. Baru-baru ini para ilmuwan telah menemukan RNA kecil yang disebut interferensi RNA atau RNAi, yang bertindak setelah transkripsi untuk mengontrol ekspresi gen. Dua jenis utama RNA kecil adalah RNA mikro atau miRNA dan RNA atau siRNA pengganggu kecil. Molekul-molekul ini pada dasarnya mengatur ekspresi gen dengan menekan gen target. Baik miRNA dan siRNA memiliki jalur biogenesis yang sangat mirip, meskipun ada beberapa perbedaan di antara keduanya. Asal miRNA dan siRNA berasal dari molekul dsRNA. MiRNA matang secara struktural mirip dengan molekul siRNA.
miRNA
Micro RNAs atau miRNAs adalah molekul RNA kecil yang memediasi pemeriksaan terakhir dalam regulasi gen translasi. Deregulasi miRNA dapat menyebabkan kanker dan perkembangan penyakit lainnya. Oleh karena itu, regulasi yang tepat dari informasi yang dikodekan di wilayah non-coding miRNA sangat penting dalam banyak proses seluler mendasar.
siRNA
siRNA juga disebut sebagai RNA pengganggu pendek atau pembungkaman dan terdiri dari RNA untai ganda dengan 20 hingga 25 pasangan basa. Peran utama siRNA adalah untuk mengganggu ekspresi gen tertentu dengan urutan nukleotida komplementer. siRNA terdiri dari RNA untai ganda pendek dengan ujung 5' terfosforilasi dan ujung 3' terhidroksilasi dengan dua nukleotida yang menjorok.
Apa perbedaan siRNA dan miRNA?
• miRNA berasal dari lokus genom tertentu, sedangkan siRNA berasal dari mRNA, transposon, virus atau DNA heterokromatik.
• Sintesis miRNA diproses dari transkrip jepit rambut prekursor yang lebih panjang (urutan miRNA inti primer oleh endonuklease RNase III), sedangkan siRNA diproses dari dupleks RNA bimolekuler panjang.
• Setiap molekul prekursor jepit rambut miRNA menghasilkan dupleks miRNA tunggal, sedangkan setiap molekul prekursor siRNA menghasilkan banyak dupleks siRNA.
• Sekuens siRNA jarang terkonservasi, sedangkan sekuens miRNA terkonservasi dengan baik.
• Semua basa dalam siRNA berkontribusi pada spesifisitas targetnya, sedangkan hanya 5' setengah miRNA yang berkontribusi pada spesifisitas targetnya.
• miRNA sering mengikat ke daerah 3' transkrip target yang tidak diterjemahkan, sedangkan siRNA membentuk dupleks komplementer di mana saja di sepanjang mRNA target.
• miRNA menentukan 'hetero-silencing' sedangkan siRNA digunakan untuk 'auto silencing'.
• miRNA bertindak sebagai sinyal untuk mencegah translasi, sedangkan siRNA secara fisik mencegah translasi.
