Perbedaan utama antara isoschizomer dan isocaudomers adalah bahwa isoschizomer mengenali dan membelah situs restriksi atau pengenalan yang sama sementara isocaudomers mengenali situs restriksi yang sedikit berbeda dan membelah di situs yang sama.
Enzim restriksi atau endonuklease restriksi adalah jenis nuklease yang membelah DNA untai ganda. Mereka mampu mengenali urutan spesifik yang disebut situs restriksi, yang asalnya palindromik. Bakteri menghasilkan enzim restriksi terhadap patogen asing, terutama terhadap virus. Ini adalah bentuk mekanisme pertahanan yang ditunjukkan oleh bakteri. Tergantung pada struktur enzim dan sifat pemotongan, ada tiga jenis enzim restriksi sebagai enzim restriksi tipe I, enzim restriksi tipe II, dan enzim restriksi tipe II. Selain itu, tergantung pada aktivitas biokimia dan sumber isolasi, ada tiga jenis enzim restriksi sebagai isoschizomers, neoschizomers dan isocaudomers.
Apa itu Isoschizomer?
Isoschizomers adalah jenis enzim restriksi yang berasal dari sumber yang berbeda tetapi mengenali dan membelah situs restriksi yang sama dalam DNA. Oleh karena itu, dua isoschizomer memiliki situs pengenalan yang sama. Mereka membelah di situs yang sama, sehingga mereka spesifik untuk urutan pengenalan yang sama. Sebagai contoh, enzim restriksi SphI dan BbuI adalah dua isoschizomer yang mengenali dan membelah pada CGTAC/G.
Gambar 01: Enzim Pembatasan
Pasangan isoschizomer lainnya adalah HpaII dan MspI. Mereka berdua mengenali urutan 5′-CCGG-3′ dan membelah DNA. Selain itu, Bsp EI dan Acc III juga merupakan isoschizomer yang masing-masing berasal dari spesies Bacillus dan Acinetobacter calcoaceticus. Isolasi isoschizomer dapat dilakukan dari bakteri yang berbeda. Karena mereka berasal dari bakteri yang berbeda, kondisi pembatasannya mungkin berbeda satu sama lain.
Apa itu Isocaudomers?
Isocaudomers adalah jenis enzim restriksi yang mengenali urutan yang sedikit berbeda, tetapi mereka membelah di tempat yang sama untuk menghasilkan ujung yang sama. Isocaudomers juga berasal dari bakteri yang berbeda. Sau3a dan BamHI adalah sepasang isocaudomer. Mereka menghasilkan ujung lengket 5'-GATC-3' setelah pembelahan situs yang sama. Sepasang isocaudomers lainnya adalah NcoI dari Nocardia corallina dan PagI dari Pseudomonas alcaligenes. Kedua enzim ini juga mengikat pada urutan pengenalan yang berbeda tetapi dipotong di tempat yang sama dan menghasilkan ujung lengket yang sama. Oleh karena itu, menghasilkan ujung pemotongan yang kompatibel satu sama lain, dan mereka dapat diikat satu sama lain. XhoI, PspXI dan SalI juga merupakan isocaudomers.
Apa Persamaan Antara Isoschizomer dan Isocaudomers?
- Isoschizomers dan isocaudomers adalah dua jenis enzim restriksi.
- Dua isoschizomer memiliki tempat pencernaan yang sama, mirip dengan dua isocaudomer yang memiliki tempat pencernaan yang sama.
- Mereka berasal dari prokariotik.
- Keduanya memiliki situs pengenalan pembatasan serta situs pencernaan.
- Mereka menghasilkan ujung yang kompatibel satu sama lain.
- Selain itu, enzim ini adalah alat yang berguna dalam teknologi DNA rekombinan.
Apa Perbedaan Antara Isoschizomer dan Isocaudomers?
Isoschizomer adalah enzim restriksi yang mengenali urutan DNA yang sama dan membelah pada tempat restriksi yang sama, sedangkan isocaudomers adalah enzim restriksi yang mengenali urutan DNA yang sedikit berbeda tetapi menghasilkan ujung lengket yang sama dengan memotong pada tempat yang sama. Jadi, inilah perbedaan utama antara isoschizomer dan isocaudomers.
Infografik di bawah ini menjelaskan perbedaan antara isoschizomer dan isocaudomers.
Ringkasan – Isoschizomers vs Isocaudomers
Isoschizomer adalah enzim restriksi yang mengenali urutan DNA yang sama dan membelah di tempat yang sama. Di sisi lain, isocaudomers adalah enzim restriksi yang mengenali urutan yang sedikit berbeda dan membelah di tempat yang sama menghasilkan ujung yang sama. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara isoschizomer dan isocaudomers. SphI, BbuI, HpaII dan MspI adalah beberapa contoh isoschizomer sedangkan Sau3a dan BamHI adalah dua contoh isocaudomers. Baik isoschizomer maupun isocaudomers secara alami diproduksi oleh bakteri.
