Perbedaan utama antara SF1 dan SF2 adalah kemampuannya untuk melepaskan asam nukleat. Sementara SF1 hanya melepaskan DNA, SF2 melepaskan DNA dan RNA.
Helicase adalah salah satu enzim kunci yang berperan dalam proses replikasi DNA serta dalam proses perbaikan DNA. Peran utama helikase adalah untuk mengambil bagian dalam proses pelepasan untuk memfasilitasi pemisahan molekul DNA untai ganda. Aktivitas enzim sangat penting selama fase inisiasi replikasi DNA. Helikase dibagi sebagai Super Family 1 dan Super Family 2 terutama berdasarkan perbedaan struktural mereka. Dalam setiap Keluarga Super, ada lebih banyak jenis helikase.
Apa itu SF1?
Super Family 1 helicase adalah jenis helicase yang terdiri dari struktur heksamerik di samping protein inti internal, yang menggambarkan aktivitas helikase. Helikase SF1 adalah salah satu kelas helikase terbesar dan dapat dikategorikan lebih lanjut sebagai helikase SF1A dan helikase SF1B. Protein seperti PcrA, Rep dan UvrD, termasuk dalam kelas helikase SF1A. Sebagai perbandingan, protein seperti RecA dan Dda termasuk dalam kelas helikase SF1B. Fungsi helikase SF1 sangat bervariasi. Beberapa fungsi vital helikase SF1 termasuk replikasi DNA, rekombinasi DNA, pemrosesan fragmen Okazaki, pembentukan telomer, dan perbaikan eksisi nukleotida dari kerusakan DNA. Pada beberapa spesies bakteri, helikase tipe SF1 juga berperan dalam membantu transfer gen horizontal melalui konjugasi. Selanjutnya, pada virus, helikase SF1 membantu replikasi virus.
Gambar 01: Aksi Helikase
Ada banyak motif berbeda yang terkait dengan struktur helikase SF1. Mereka mengandung setidaknya 7 motif yang dilestarikan di antara semua jenis helikase SF1 yang berbeda (Q, I, Ia, II, III, IV, V, dan VI). Struktur helikase SF1 adalah kristal, di mana motifnya dikelompokkan bersama. Ada kantong pengikat ATP yang khas antara motif dan tempat pengikatan DNA. Domain yang tidak terkonservasi didistribusikan untuk menjaga integritas struktural molekul helikase. Domain ini dapat bervariasi antara helikase SF1A dan helikase SF1B.
Apa itu SF2?
Super family 2 helicase adalah salah satu grup superfamili helicase yang paling beragam. Ada banyak jenis helikase SF2 seperti helikase mirip RecQ, helikase mirip RecG, helikase Rad3/XPD dan NS3. Beberapa enzim restriksi, seperti enzim restriksi tipe I, juga termasuk dalam kategori ini. Fungsi umum helikase SF2 adalah pelepasan DNA untai ganda. Namun, beberapa jenis helikase SF2 tidak memiliki kemampuan untuk sepenuhnya bertindak sebagai enzim helikase. Helikase SF2 juga banyak digunakan dalam pemrosesan RNA. Keluarga kotak-MATI dari helikase SF2 mengambil bagian dalam pemrosesan RNA, termasuk transkripsi, penyambungan, pemrosesan terjemahan, dan perakitan kompleks protein-RNA.
Gambar 02: Helikase
Struktur helikase SF2 juga mengandung motif yang dilestarikan. Namun, beberapa domain sedikit berbeda dari helikase SF1. Mereka juga mengandung domain pengikatan ATP selain dari domain pengikatan DNA.
Apa Persamaan Antara SF1 dan SF2?
- SF1 dan SF2 menunjukkan aktivitas helikase.
- Selain itu, keduanya mengambil bagian dalam replikasi dan rekombinasi DNA.
- SF1 dan SF2 terdiri dari motif yang dilestarikan.
- Keduanya memiliki domain pengikatan ATP dan domain pengikatan DNA.
- Bentuk ini adalah protein multi-domain.
- Selain itu, jika mutasi terjadi pada salah satu jenis, itu akan menghasilkan efek yang merusak.
- Baik SF1 dan SF2 sangat penting untuk memastikan kelangsungan siklus sel.
- SF1 dan SF2 ditemukan pada prokariota serta eukariota.
Apa Perbedaan Antara SF1 dan SF2?
SF1 dan SF2 adalah dua keluarga super helikase. Mereka menunjukkan keragaman yang luas. Perbedaan utama antara SF1 dan SF2 adalah bahwa SF1 terutama terlibat dalam pelepasan DNA, sementara SF2 juga mengambil bagian dalam pemrosesan RNA selama transkripsi dan translasi. Ketika membandingkan motif protein yang berbeda, SF1 dan SF2 terutama berbeda berdasarkan motif III dan motif IV. Meskipun memiliki kesamaan struktural, helikase SF1 membentuk struktur heksamerik toroidal sedangkan SF2 tidak membentuk susunan struktural tersebut.
Perbedaan lain antara SF1 dan SF2 adalah bahwa helikase SF1 lebih menyukai nukleotida adenin, sedangkan helikase SF2 lebih menyukai kelima nukleotida sebagai target pelepasan. Saat membandingkan arah pelepasan, helikase SF1 hanya mentranslokasi dalam arah 5’ ke 3’, sedangkan helikase SF2 memiliki kemampuan untuk mentranslokasi bersama dengan asam nukleat di kedua arah.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara SF1 dan SF2 dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – SF1 vs SF2
Helikase adalah kelompok enzim yang sangat penting dan beragam yang berperan dalam replikasi DNA. Namun, karena keragamannya yang tinggi, enzim dikategorikan ke dalam superfamili. SF1 dan SF2 adalah dua keluarga super terbesar dari helikase. Sementara SF1 terutama terkait dengan pemrosesan yang terkait dengan DNA, SF2 dikaitkan dengan pemrosesan DNA dan RNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara SF1 dan SF2. Selanjutnya, SF1 dan SF2 juga berbeda dalam susunan strukturalnya karena SF2 tidak membentuk struktur heksamerik. Mutasi pada helikase SF1 dan SF2 akan mengarah pada perkembangan kanker setelah disregulasi siklus sel dan mekanisme vital lainnya seperti perbaikan DNA.
