Perbedaan utama antara guanidin tiosianat dan guanidin hidroklorida adalah bahwa guanidin tiosianat adalah denaturan protein yang lebih kuat yang lebih umum digunakan dalam isolasi RNA, sedangkan guanidin hidroklorida adalah denaturan protein yang lebih lemah yang jarang digunakan dalam isolasi RNA.
Denaturasi adalah proses di mana protein kehilangan struktur kuartener, struktur tersier, dan struktur sekunder yang biasanya ada dalam keadaan aslinya. Ini dapat dilakukan dengan penerapan beberapa tekanan atau senyawa eksternal seperti asam atau basa kuat, garam anorganik pekat, pelarut organik (alkohol, kloroform), agitasi, radiasi, atau panas. Guanidine thiocyanate dan guanidine hydrochloride adalah dua jenis denaturan protein yang berbeda.
Apa itu Guanidine Thiocyanate?
Guanidine thiocyanate (GTC) adalah agen denaturasi protein yang lebih kuat yang lebih umum digunakan dalam isolasi RNA. Ia juga dikenal sebagai guanidinium isothiocyanate (GITC). Menjadi agen chaotropic, itu adalah senyawa kimia yang secara rutin digunakan sebagai denaturan protein umum. Agen chaotropic adalah molekul dalam larutan air yang dapat mengganggu jaringan ikatan hidrogen antar molekul air. Ini memiliki efek pada stabilitas keadaan asli molekul lain dalam larutan, seperti makromolekul seperti protein dan asam nukleat dengan melemahkan efek hidrofobik. Agen chaotropic seperti guanidin tiosianat mengurangi jumlah keteraturan dalam struktur protein yang dibentuk oleh molekul air baik dalam jumlah besar maupun cangkang hidrasi di sekitar asam amino hidrofobik. Hal ini dapat menyebabkan denaturasi protein.
Guanidine thiocyanate dapat digunakan untuk menonaktifkan virus seperti influenza yang menyebabkan penyakit seperti flu Spanyol pada tahun 1918. Oleh karena itu, dapat digunakan dalam pengaturan medis atau rumah sakit. Selanjutnya, Guanidine thiocyanate juga digunakan untuk melisiskan sel dan partikel virus dalam ekstraksi RNA dan DNA. Di sini, fungsi guanidin tiosianat adalah untuk membantu aksi lisis dan untuk mencegah aktivitas enzim RNase dan enzim DNase dengan mendenaturasi. Enzim ini akan merusak ekstrak (RNA atau DNA).
Apa itu Guanidine Hydrochloride?
Guanidine hydrochloride (GdnHCl) adalah denaturant protein yang lebih lemah yang kurang umum digunakan dalam isolasi RNA. Hal ini juga dikenal sebagai guanidinium klorida (GdmCl). Ini adalah garam hidroklorida guanidin. Guanidine hidroklorida bersifat chaotropic dan salah satu denaturan yang digunakan dalam studi fisikokimia protein folding.
Gambar 01: Guanidin Hidroklorida
Guanidine hidroklorida juga memiliki kemampuan untuk menurunkan aktivitas enzim dan meningkatkan kelarutan molekul hidrofobik. Biasanya, pada konsentrasi guanidin hidroklorida yang lebih tinggi, protein kehilangan strukturnya yang teratur. Protein cenderung menjadi melingkar secara acak pada konsentrasi guanidin hidroklorida ini. Dalam pengaturan medis atau rumah sakit, guanidine hidroklorida diindikasikan untuk mengurangi gejala kelemahan otot dan mudah lelah yang terkait dengan penyakit sindrom Eaton-Lambert. Selain itu, efek samping penggunaan guanidin hidroklorida mungkin termasuk perist altik, diare, dan penekanan sumsum tulang yang fatal.
Apa Persamaan Antara Guanidine Thiocyanate dan Guanidine Hydrochloride?
- Guanidine thiocyanate dan guanidine hydrochloride adalah dua jenis denaturan protein yang berbeda.
- Kedua denaturan memiliki guanidin dalam strukturnya.
- Mereka adalah agen chaotropic.
- Kedua denaturan dapat digunakan untuk isolasi RNA.
- Keduanya digunakan dalam pengaturan medis atau rumah sakit.
Apa Perbedaan Antara Guanidine Thiocyanate dan Guanidine Hydrochloride?
Guanidine thiocyanate adalah agen denaturan protein yang lebih kuat yang lebih umum digunakan dalam isolasi RNA, sedangkan guanidine hydrochloride adalah denaturant protein yang lebih lemah yang kurang umum digunakan dalam isolasi RNA. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara guanidin tiosianat dan guanidin hidroklorida. Selanjutnya, rumus kimia guanidin tiosianat adalah C2H6N4S, sedangkan rumus kimianya dari guanidin hidroklorida adalah CH5N3HCl.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara guanidin tiosianat dan guanidin hidroklorida dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Guanidine Thiocyanate vs Guanidine Hydrochloride
Guanidine thiocyanate dan guanidine hydrochloride adalah dua jenis denaturan protein yang berbeda. Kedua denaturan adalah chaotrop. Guanidine thiocyanate adalah agen denaturan protein yang lebih kuat yang lebih umum digunakan dalam isolasi RNA, sedangkan guanidine hydrochloride adalah denaturant protein yang lebih lemah yang kurang umum digunakan dalam isolasi RNA. Jadi, ini merangkum perbedaan antara guanidin tiosianat dan guanidin hidroklorida.
