Perbedaan utama antara endonuklease restriksi dan eksonuklease adalah bahwa endonuklease restriksi adalah enzim nuklease yang mengenali urutan DNA tertentu dan memotong DNA di dalam atau di sebelahnya, sedangkan eksonuklease adalah enzim nuklease yang memotong nukleotida dalam polinukleotida dari ujung 5' atau ujung 3' satu per satu.
Nuklease adalah enzim yang memutus ikatan fosfodiester antara nukleotida asam nukleat. Dalam organisme hidup, mereka adalah alat penting untuk banyak aspek perbaikan DNA dalam sel. Cacat enzim ini dapat menyebabkan ketidakstabilan genetik dan imunodefisiensi. Nuklease restriksi adalah nuklease spesifik yang fungsinya bergantung pada urutan nukleotida tertentu. Contohnya adalah endonuklease restriksi. Ada klasifikasi dasar untuk nuklease berdasarkan tempat aktivitas, seperti endonuklease dan eksonuklease. Endonuklease mencerna daerah di tengah molekul DNA target. Exonuclease mencerna asam nukleat dari ujungnya. Oleh karena itu, restriksi endonuklease dan eksonuklease adalah dua jenis enzim nuklease.
Apa itu Endonuklease Restriksi?
Pembatasan endonuklease adalah enzim nuklease yang mengenali urutan DNA tertentu dan memotong DNA di dalam atau berdekatan dengan urutan itu. Urutan DNA spesifik dikenal sebagai situs restriksi. Ini juga disebut enzim restriksi atau restriksi. Endonuklease restriksi adalah enzim yang sangat spesifik. Ini adalah salah satu kelas dari kelompok enzim endonuklease yang lebih luas. Endonuklease restriksi umumnya diklasifikasikan menjadi lima jenis, yang berbeda dalam struktur dan kemampuannya untuk memotong substrat DNA di tempat pengenalan. Kelima tipe tersebut adalah tipe I, tipe II, tipe III, tipe IV dan tipe V.
Gambar 01: Endonuklease Restriksi
Endonuklease restriksi biasanya ditemukan pada bakteri dan archaea. Mereka menyediakan mekanisme pertahanan bakteri terhadap virus. Ada lebih dari 3600 endonuklease restriksi yang diketahui. Mereka mewakili lebih dari 250 kekhususan yang berbeda. Lebih dari 3000 di antaranya telah dipelajari secara rinci. Selain itu, lebih dari 800 di antaranya tersedia secara komersial.
Apa itu Exonuclease?
Exonuclease adalah enzim nuklease yang memotong nukleotida dalam polinukleotida dari ujung 5' atau 3' satu per satu. Ini terjadi melalui reaksi hidrolisis yang memutus ikatan fosfodiester antara nukleotida di ujungnya. Eukariota dan prokariota memiliki tiga jenis eksonuklease. Eksonuklease ini terlibat dalam pergantian normal mRNA. Mereka adalah 5' hingga 3' eksonuklease (Xrn1), 3' hingga 5' eksonuklease, dan poli-A spesifik 3' hingga 5' eksonuklease. 5 'sampai 3' exonuclease adalah protein decapping dependen. 3 'sampai 5' exonuclease adalah protein independen. Poli A spesifik 3' hingga 5' eksonuklease juga dikenal sebagai ribonuklease spesifik poli-A yang terlibat dalam degradasi eksonukleolitik ekor poli-A.
Gambar 02: Eksonuklease
Pada archaea dan eukariota, degradasi RNA dilakukan oleh kompleks eksosom multi-protein yang terdiri dari 3' hingga 5' eksoribonuklease.
Apa Persamaan Antara Endonuklease Restriksi dan Eksonuklease?
- Restriksi endonuklease dan eksonuklease adalah dua jenis enzim nuklease.
- Kedua enzim memotong molekul DNA.
- Enzim ini ditemukan pada prokariota.
- Mereka adalah protein.
Apa Perbedaan Antara Endonuklease Restriksi dan Eksonuklease?
Endonuklease restriksi adalah enzim nuklease yang mengenali urutan DNA tertentu dan memotong DNA di dalam atau di sebelahnya, sedangkan eksonuklease adalah enzim nuklease yang memotong nukleotida dalam polinukleotida dari ujung 5' atau 3' satu per satu. Jadi, inilah perbedaan utama antara endonuklease restriksi dan eksonuklease. Selain itu, endonuklease restriksi hanya ditemukan pada prokariota, sedangkan eksonuklease ditemukan pada prokariota dan eukariota.
Infografis berikut mencantumkan perbedaan antara endonuklease restriksi dan eksonuklease dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Pembatasan Endonuklease vs Eksonuklease
Nuklease adalah enzim yang memutuskan ikatan fosfodiester antara nukleotida asam nukleat. Endonuklease restriksi dan eksonuklease adalah dua jenis enzim nuklease. Endonuklease restriksi adalah enzim nuklease yang mengenali urutan DNA tertentu dan memotong DNA di dalam atau berdekatan dengan urutan itu. Exonuclease adalah enzim nuklease yang memotong nukleotida dalam polinukleotida baik dari ujung 5' atau 3' satu per satu. Jadi, ini merangkum perbedaan antara endonuklease restriksi dan eksonuklease.
