Perbedaan utama antara enzim restriksi EcoRI dan HindIII adalah bahwa EcoRI adalah enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari E. coli, sedangkan HindIII adalah enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari Haemophilus influenza.
Enzim restriksi atau restriksi endonuklease adalah enzim yang memecah DNA menjadi fragmen-fragmen pada tempat pengenalan tertentu (situs restriksi) di dalam molekul DNA. Enzim restriksi ini ditemukan pada bakteri dan archaea. Mereka menyediakan mekanisme pertahanan terhadap virus yang menyerang. Enzim restriksi umumnya diklasifikasikan menjadi lima jenis: tipe I, tipe II, tipe III, IV, dan tipe V. EcoRI dan HindIII adalah dua enzim restriksi yang termasuk dalam kelompok enzim restriksi tipe II.
Apa itu Enzim Pembatasan EcoRI?
EcoRI adalah enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari spesies E.coli. Ini adalah enzim restriksi yang memotong heliks ganda DNA menjadi fragmen di situs tertentu. EcoRI juga merupakan bagian dari sistem pembatasan-modifikasi. EcoRI adalah enzim pertama yang diisolasi dari strain RY13 dari spesies E. coli. Ini digunakan sebagai enzim restriksi dalam biologi molekuler. EcoRI menciptakan 4 ujung lengket nukleotida dengan overhang ujung 5' dari AATT. EcoRI memotong DNA pada urutan pengenalan spesifik G↓AATTC. Ini memiliki urutan komplementer palindromik dari CTTAA↓G. Selain itu, enzim restriksi ini termasuk dalam subkelas tipe II P (spesifisitas palindromik). Dalam struktur utamanya, EcoRI mengandung motif PD. D/EXK di dalam situs aktifnya, seperti banyak enzim restriksi lainnya.
Gambar 01: EcoRI
Enzim restriksi EcoRI adalah homodimer dari 31 kDa. Ini berisi satu domain globular dari arsitektur /β. Setiap subunit berisi loop yang menonjol dari domain globular dan membungkus DNA ketika terikat. Enzim ini dapat dikokristalisasi dengan urutan yang biasanya dipotong. Selanjutnya, enzim restriksi EcoRI digunakan dalam berbagai teknik genetik molekuler, termasuk kloning, skrining DNA, dan bagian penghapusan DNA dalam kondisi in-vitro.
Apa itu Enzim Restriksi HindIII?
HindIII adalah enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari spesies Haemophilus influenza. Ini memotong urutan palindromik DNA AACCTT dengan adanya kofaktor Mg2+ melalui hidrolisis. Pembelahan urutan khusus ini antara AA'S (5'A↓ACCTT3' dan 3'TTCGA↓A5') menghasilkan 5' overhang pada molekul DNA yang disebut ujung lengket. Enzim ini ditemukan pada organisme prokariotik seperti bakteri. Bakteri menggunakan enzim ini sebagai mekanisme pertahanan terhadap virus seperti bakteriofag.
Gambar 02: HindIII
Secara struktural, HindIII adalah homodimer. Ini berisi inti struktural umum yang terdiri dari empat lembar dan satu heliks, seperti jenis enzim restriksi II lainnya. Massa molekul enzim ini adalah 34,9 kDa. Selain itu, HindIII sangat berguna dalam eksperimen ilmu biologi molekuler modern seperti pengurutan dan pemetaan DNA.
Apa Persamaan Antara Enzim Restriksi EcoRI dan HindIII?
- EcoRI dan HindIII adalah dua enzim restriksi yang termasuk dalam kelompok enzim restriksi tipe II.
- EcoRI dan HindIII ditemukan pada awal 1970-an.
- EcoRI dan HindIII keduanya mengandung motif urutan asam amino PD.. D/EXK.
- Kedua enzim restriksi melakukan pembelahan DNA yang sangat spesifik.
- Enzim restriksi ini membutuhkan Mg2+ sebagai kofaktor untuk aktivitas spesifiknya.
- Mereka menghasilkan ujung yang lengket setelah memotong DNA.
- Mereka adalah komponen yang sangat berguna dalam penelitian biologi molekuler modern.
Apa Perbedaan Enzim Restriksi EcoRI dan HindIII?
EcoRI adalah enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari spesies E.coli, sedangkan HindIII adalah enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari spesies Haemophilus influenza. Jadi, inilah perbedaan utama antara EcoRI dan HindIII. Selanjutnya, EcoRI memotong DNA pada urutan pengenalan spesifik G↓AATTC, sedangkan HindIII memotong DNA pada urutan pengenalan spesifik A↓ACCTT.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara EcoRI dan HindIII dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – EcoRI vs Enzim Pembatasan HindIII
EcoRI dan HindIII adalah dua enzim restriksi yang termasuk dalam subkelas p tipe II. Mereka melakukan pembelahan DNA yang sangat spesifik. EcoRI merupakan enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari spesies E.coli, sedangkan HindIII merupakan enzim restriksi tipe II yang diisolasi dari spesies Haemophilus influenza. Jadi, ini merangkum perbedaan antara EcoRI dan HindIII.
