Perbedaan utama antara tes LAMP dan PCR adalah bahwa LAMP dilakukan pada suhu konstan (60-650C) untuk menghasilkan salinan DNA melalui amplifikasi, sedangkan PCR dilakukan menggunakan serangkaian perubahan suhu untuk menghasilkan salinan DNA melalui amplifikasi.
LAMP dan PCR keduanya merupakan teknik amplifikasi in-vitro yang digunakan untuk menghasilkan ribuan salinan DNA. Jumlah DNA yang dihasilkan dalam LAMP jauh lebih tinggi daripada jumlah yang dihasilkan dalam teknik PCR seperti RT-PCR. LAMP merupakan teknik yang lebih baru dibandingkan dengan teknik PCR. Tetapi secara teknis sederhana dan mudah bagi seorang ilmuwan terlatih untuk melakukan dalam kondisi laboratorium. Ini menjadikannya teknik yang berpotensi berguna untuk mendeteksi COVID-19. Namun, RT-PCR adalah tes standar saat ini untuk COVID-19. Teknik-teknik ini, meskipun dikenal oleh para peneliti dan dokter dengan latar belakang amplifikasi DNA, mungkin masih relatif tidak dikenal oleh komunitas yang lebih luas.
Apa itu Tes LAMP?
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) untuk tes COVID-19 dimulai dengan pengumpulan sampel dari hidung atau tenggorokan menggunakan swab. Sampel juga dapat dikumpulkan menggunakan metode lain seperti lendir dari batuk keras. Seperti teknik PCR seperti RT-PCR, RNA virus dalam sampel pertama-tama diubah menjadi DNA, yang memungkinkannya untuk disalin. Reaksi LAMP dilakukan pada suhu konstan (60-650C).
Amplifikasi DNA virus yang menggabungkan teknologi LAMP dan reagen dapat dideteksi ketika campuran reaksi menjadi keruh karena produksi "magnesium pirofosfat". Kekeruhan ini memungkinkan diagnosis COVID-19 dengan mudah oleh para ilmuwan dan dokter. Keakuratan hasil pengujian dapat ditingkatkan dengan menggunakan pewarna fluoresen khusus atau pewarna pengubah warna dalam campuran reaksi. Pewarna ini berinteraksi dengan DNA virus, dan intensitas cahaya atau perubahan warna dapat diukur untuk memberikan jumlah molekul RNA virus kira-kira yang awalnya ada dalam sampel.
Apa itu Tes PCR?
PCR adalah teknik ilmiah yang sangat umum yang telah digunakan secara luas dalam penelitian dan kedokteran selama 20-30 tahun untuk mendeteksi DNA. Tes PCR digunakan secara langsung untuk mendeteksi antigen dengan mendeteksi RNA virus. Umumnya, RNA virus ada di dalam tubuh sebelum mendeteksi antibodi atau mendapatkan gejala penyakit. Oleh karena itu, tes PCR dapat mengetahui apakah seseorang memiliki virus sejak dini. Saat ini, PCR adalah tes standar untuk mendeteksi COVID-19. Ada berbagai jenis teknik PCR seperti PCR real-time, PCR bersarang, PCR multipleks, PCR hot start dan PCR jarak jauh, dll. PCR menggunakan serangkaian perubahan suhu untuk menghasilkan salinan DNA melalui amplifikasi.
RT-PCR adalah versi khusus dari teknik PCR. Ini digunakan ketika RNA terdeteksi. Sekarang digunakan untuk menguji COVID-19. RT-PCR adalah teknik yang cukup sensitif dan dapat diandalkan. Dalam RT-PCR, setelah sampel dikumpulkan, bahan kimia digunakan untuk menghilangkan protein, lemak, dan molekul lain yang tidak diinginkan, meninggalkan RNA. Enzim test kit pertama-tama mengubah RNA menjadi DNA, yang kemudian mengamplifikasi DNA virus untuk mendeteksi virus. Pewarna fluoresen biasanya digunakan untuk mengikat DNA yang diamplifikasi dan menghasilkan cahaya. Ini dapat dibaca oleh mesin untuk menghasilkan hasil tes.
Apa Persamaan Antara Tes LAMP dan PCR?
- Itu adalah teknik amplifikasi.
- Keduanya menghasilkan DNA yang disalin.
- Ini adalah teknik yang sangat sensitif dan andal daripada teknik kekebalan seperti deteksi antibodi.
- Keduanya digunakan untuk tes COVID-19.
Apa Perbedaan Tes LAMP dan PCR?
Perbedaan utama antara tes LAMP dan PCR adalah, pada LAMP, amplifikasi dicapai dengan menggunakan suhu konstan (60-650C), sedangkan pada PCR, siklus suhu diperlukan. Beberapa jenis teknik LAMP tersedia saat ini. Tetapi yang paling penting untuk deteksi COVID-19 adalah teknik isotermal yang dimediasi loop transkripsi terbalik (RT-LAMP) dan amplifikasi yang dimediasi transkrip (TMA). Selain itu, berbagai jenis teknik PCR juga saat ini tersedia dalam praktik klinis untuk diagnosis penyakit seperti PCR waktu nyata, RT-PCR, PCR bersarang, PCR multipleks, PCR hot-start, PCR jarak jauh, dll.
Infografik di bawah ini mencantumkan perbedaan antara tes LAMP dan PCR dalam bentuk tabel.
Ringkasan – Tes LAMP vs PCR
Loop-mediated Isothermal Amplification adalah proses yang mirip dengan tes PCR seperti RT-PCR, tetapi menghasilkan lebih banyak salinan DNA virus pada suhu konstan. Tes reaksi berantai polimerase saat ini merupakan bentuk pengujian yang paling umum dan standar di dunia untuk diagnosis penyakit, seperti diagnosis COVID-19. Hal ini dianggap cukup dapat diandalkan. PCR menggunakan serangkaian perubahan suhu untuk menghasilkan salinan DNA melalui amplifikasi. Jadi, ini merangkum perbedaan antara tes LAMP dan PCR.