Perbedaan utama antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan adalah bahwa dalam ekstraksi DNA tumbuhan, dinding sel perlu dihancurkan dengan menggiling jaringan dalam es kering atau nitrogen cair untuk melepaskan konten seluler saat dalam ekstraksi DNA hewan, langkah ini tidak perlu dilakukan karena sel hewan tidak memiliki dinding sel.
DNA genomik adalah materi genetik sel tumbuhan dan hewan. DNA genom adalah unik untuk setiap individu tumbuhan atau hewan. Ekstraksi DNA dari DNA berkualitas baik merupakan prasyarat untuk penelitian molekuler. DNA organisme diekstraksi untuk identifikasi, diagnosis penyakit, deteksi gen dan sekuens spesifik, tujuan forensik, pengujian paternitas, pengurutan genom, dan pengembangan obat, dll. Metode ekstraksi DNA bervariasi tergantung pada jenis sel – apakah itu sel hewan atau sel tumbuhan.
Apa itu Ekstraksi DNA Tumbuhan?
DNA dalam sel tumbuhan diekstraksi untuk berbagai studi molekuler. Diperlukan untuk mengekstraksi DNA genomik murni yang utuh. Oleh karena itu, ada berbagai jenis protokol ekstraksi DNA yang berbeda dari protokol ekstraksi DNA dari sel hewan. Ini karena sel tumbuhan memiliki dinding sel yang harus dipecah untuk mengeluarkan isi sel.
Ekstraksi biasanya dilakukan dengan menggiling jaringan tanaman dalam es kering atau nitrogen cair menggunakan lesung dan alu. Kemudian membran sel terganggu, dan konten seluler dibawa keluar ke buffer ekstraksi. Ini biasanya dilakukan dengan menggunakan deterjen; SDS (sodium dodecyl sulfate) atau CTAB (cetyltrimethylammonium bromide) buffer. DNA yang dilepaskan dilindungi dari nuklease endogen menggunakan agen pengkelat seperti EDTA. Selain itu, protein dipisahkan dari DNA menggunakan kloroform atau fenol.
Gambar 01: Ekstraksi DNA Tanaman
Tanaman mensintesis polisakarida dan polifenol, termasuk flavonoid dan metabolit sekunder lainnya. Senyawa ini mengganggu ekstraksi DNA genomik murni. Oleh karena itu, sebagian besar protokol ekstraksi DNA tanaman melibatkan langkah lain, seperti teknik gradien densitas cesium klorida untuk menghilangkan senyawa ini.
Sebagian besar protokol ekstraksi DNA merekomendasikan penggunaan sampel daun segar untuk ekstraksi DNA. Beberapa metode tidak termasuk bahan kimia berbahaya seperti nitrogen cair dan fenol. Protokol CTAB (Cetyl trimetilamonium bromida) adalah protokol ekstraksi DNA tanaman populer yang memfasilitasi ekstraksi DNA genom tanaman berkualitas tinggi. Ini adalah metode yang sederhana, aman, andal, dan hemat biaya untuk ekstraksi DNA tanaman. Sebagian besar metode lain adalah versi modifikasi dari metode CTAB.
Apa itu Ekstraksi DNA Hewan?
Ekstraksi DNA hewan adalah ekstraksi DNA genom dari sel hewan untuk analisis molekuler. Tidak seperti ekstraksi DNA tumbuhan, pemecahan dinding sel tidak diperlukan untuk sel hewan karena mereka tidak memiliki dinding sel. Sel darah adalah jenis sel hewan yang paling umum digunakan untuk berbagai keperluan.
Gambar 02: Ekstraksi DNA
Metode fenol-kloroform adalah salah satu pilihan terbaik untuk sel darah. Hasil dan kualitas DNA tinggi ketika mengekstraksi DNA dari metode ini. Ini adalah protokol ekstraksi DNA cair-cair, dan metode ini memisahkan molekul DNA berdasarkan kelarutannya dalam larutan yang tidak dapat bercampur. Fenol, kloroform, dan isoamil alkohol adalah tiga bahan teratas dari metode ini.
Apa Persamaan Ekstraksi DNA Tumbuhan dan Hewan?
- Selama ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan, membran sel harus terganggu.
- DNA harus dilindungi dari nuklease endogen.
- Selain itu, pemotongan DNA harus dicegah.
- Kit komersial tersedia untuk ekstraksi DNA tumbuhan dan DNA hewan.
- Kebanyakan metode ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan memerlukan modifikasi dan standarisasi yang berkelanjutan.
Apa Perbedaan Ekstraksi DNA Tumbuhan dan Hewan?
Perbedaan utama antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan adalah ekstraksi DNA tanaman memerlukan penggilingan jaringan tanaman dalam es kering atau nitrogen cair untuk memecahkan dinding sel sementara ekstraksi DNA hewan tidak memerlukan langkah ini karena mereka hewan sel tidak memiliki dinding sel. Metode CTAB adalah salah satu metode terbaik untuk ekstraksi DNA tanaman sedangkan metode fenol-kloroform adalah salah satu metode terbaik untuk ekstraksi DNA hewan.
Di bawah infografik tabulasi perbedaan antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan.
Ringkasan – Ekstraksi DNA Tumbuhan vs Hewan
Metode yang berbeda tersedia untuk ekstraksi DNA dari tipe sel yang berbeda. Oleh karena itu, protokol ekstraksi DNA tanaman berbeda dari protokol ekstraksi DNA sel hewan. Ekstraksi DNA tumbuhan memerlukan pemecahan dinding sel, membran sel dan membran inti sedangkan ekstraksi DNA hewan memerlukan pemecahan membran sel dan membran inti. Lebih penting lagi, ekstraksi DNA sel hewan tidak memerlukan gangguan dinding sel dengan menggiling dalam es kering atau nitrogen cair. Jadi, inilah perbedaan utama antara ekstraksi DNA tumbuhan dan hewan.
