Perbedaan utama antara probe DNA dan RNA adalah bahwa probe DNA adalah fragmen DNA yang melengkapi urutan nukleotida target, sedangkan probe RNA adalah rangkaian RNA untai tunggal yang merupakan urutan asam nukleat komplementer dari urutan target.
Sebuah probe adalah sekuens pendek DNA atau RNA yang disintesis secara artifisial yang dapat diberi label secara radioaktif atau dengan molekul nonradioaktif. Ini dapat memiliki panjang 100 hingga 1000 basis. Probe berguna dalam mendeteksi urutan nukleotida target yang melengkapi urutan probe. Setelah ditambahkan, probe dihibridisasi dengan urutan komplementer atau urutan target dan membuatnya terlihat untuk mengidentifikasi urutan target karena membawa radioaktivitas. Probe adalah alat molekuler yang penting untuk banyak bidang mikroba dan molekuler seperti deteksi penyakit genetik, dalam virologi, dalam patologi forensik, dalam pengujian paternitas, dalam sidik jari DNA, RFLP, sitogenetika molekuler, hibridisasi in situ, dll.
Apa itu Probe DNA?
Probe DNA adalah bentangan DNA beruntai tunggal. Mereka dapat digunakan untuk mendeteksi keberadaan urutan asam nukleat komplementer (urutan target) dengan hibridisasi. Setelah probe DNA hibridisasi dengan urutan komplementernya, ia membentuk hibrid untai ganda. Untuk mendeteksinya, probe DNA umumnya diberi label dengan radioisotop, biotin, epitop, atau fluorofor. Probe DNA berlabel biotin dapat dideteksi dengan alkaline phosphatase berlabel streptavidin dengan sejumlah metode enzimatik dan kimia.
Gambar 01: Pemeriksaan DNA
Urutan nukleotida dari probe DNA diketahui. Mereka adalah urutan pendek dengan panjang 100 hingga 1000 pasangan basa. Probe DNA panjang dapat dihasilkan dengan teknologi DNA rekombinan. Mereka juga dapat dihasilkan oleh PCR dan kloning. Di laboratorium mikrobiologi klinis, probe DNA tersedia untuk diagnosis cepat penyakit menular.
Apa itu Probe RNA?
RNA probe adalah bentangan RNA untai tunggal. Mereka adalah urutan pelengkap untuk menargetkan urutan dalam sampel. Mereka umumnya disintesis dengan RNA polimerase dari bakteriofag SP6, T7, atau T3 dengan transkripsi DNA in vitro. Probe RNA panjang dapat dihasilkan oleh transkripsi in vitro dari DNA plasmid linier. Umumnya, probe RNA mengikat kuat dan lebih erat ke urutan komplementer mereka daripada probe DNA. Mirip dengan probe DNA, probe RNA juga dapat diberi label saat sedang ditranskripsi.
Apa Persamaan Antara Probe DNA dan RNA?
- Probe DNA dan RNA keduanya merupakan sekuens nukleotida untai tunggal.
- Keduanya dirancang dan disintesis secara artifisial.
- Selain itu, mereka dapat diberi label dengan radioisotop, epitop, biotin atau fluorofor.
- Mereka memiliki afinitas yang kuat terhadap urutan target DNA atau RNA tertentu.
- Mereka digunakan dalam berbagai teknik blotting dan hibridisasi in situ untuk mendeteksi urutan asam nukleat target.
- Kedua jenis probe dapat dihibridisasi dengan urutan komplementernya.
- Mereka juga digunakan dalam identifikasi mikroorganisme dan diagnosis penyakit menular, warisan, dan penyakit lainnya.
Apa Perbedaan Antara Probe DNA dan RNA?
DNA probe adalah bentangan pendek DNA yang melengkapi urutan target. Di sisi lain, probe RNA adalah bentangan RNA untai tunggal pendek yang melengkapi urutan target. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara probe DNA dan RNA. Selanjutnya, probe DNA mengandung A, T, C dan G sedangkan probe RNA mengandung A, U, C dan G.
Selain itu, perbedaan lebih lanjut antara probe DNA dan RNA adalah stabilitas termodinamikanya. Probe RNA menunjukkan stabilitas termodinamika yang lebih besar dibandingkan probe DNA.
Di bawah infografik tabulasi perbedaan penting antara probe DNA dan RNA.
Ringkasan – Probe DNA vs RNA
Probe adalah fragmen kecil DNA atau RNA yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan urutan tertentu dalam sampel DNA atau RNA dengan hibridisasi molekuler. Probe DNA adalah fragmen DNA untai tunggal pendek sedangkan probe RNA adalah urutan RNA untai tunggal pendek. Mereka adalah urutan yang dikenal. Stabilitas termodinamika lebih besar pada probe RNA daripada probe DNA. Probe RNA mengikat erat ke urutan komplementer mereka daripada probe DNA mengikat. Jadi, ini merangkum perbedaan antara probe DNA dan RNA.
