Perbedaan utama antara CRISPR dan CRISPR Cas9 adalah bahwa CRISPR (pengulangan palindromik pendek berkerumun secara teratur) adalah mekanisme pertahanan kekebalan prokariotik yang terjadi secara alami sementara CRISPR cas9 adalah nuklease Cas9 yang dipandu RNA yang merupakan bagian dari adaptif CRISPR sistem kekebalan tubuh.
CRISPR adalah sistem kekebalan pertahanan antivirus yang ditemukan pada bakteri dan archaea. Ini adalah keluarga urutan DNA yang ditemukan dalam genom bakteri. Ini terdiri dari urutan spacer yang berasal dari fragmen DNA bakteriofag yang sebelumnya menginfeksi mereka. Pada infeksi virus berikutnya, bakteri menggunakan urutan ini untuk menghancurkan DNA virus. Urutan CRISPR memiliki pengulangan palindromik pendek dan urutan spacer. Selain itu, urutan spacer berulang CRISPR sering kali memiliki gen terkait yang mengkode protein Cas. Cas9 adalah endonuklease yang dipandu RNA. Bersama dengan sekuens CRISPR, protein Cas9 bertindak sebagai sistem imun adaptif pada bakteri terhadap bakteriofag.
Apa itu CRISPR?
CRISPR adalah singkatan dari Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Ini adalah sekelompok urutan DNA yang ditemukan dalam genom bakteri. Ia bekerja sebagai mekanisme pertahanan alami pada bakteri, dan pertama kali diidentifikasi pada E. coli. Pada bakteri, ia bertindak sebagai perlindungan kekebalan adaptif, terutama terhadap bakteriofag. Oleh karena itu, ini adalah mekanisme urutan-spesifik.
Gambar 01: CRISPR
Sistem CRISPR berisi beberapa urutan pengulangan DNA segmen pendek. Pengulangan ini adalah palindromik, memiliki urutan dasar yang sama ketika membaca dari 5 'ke 3' sementara yang lain memberikan urutan yang sama ketika membaca dari 3 'sampai 5'. Apalagi pengulangannya identik. Mereka terletak di antara sekuens DNA "pengatur jarak" pendek yang tidak identik. Tetapi urutan DNA spacer ini mirip atau cocok dengan DNA bakteriofag asing. Gen yang terkait dengan CRISPR dikenal sebagai gen terkait CRISPR atau gen Cas. Gen Cas mengkode protein Cas yang merupakan helikase atau nuklease. Helikase melepas DNA sementara nuklease memotong DNA. Secara keseluruhan, ketika mempertimbangkan CRISPR, ini adalah sistem kekebalan bakteri yang bekerja melawan bakteriofag (bakteri yang menginfeksi virus).
Apa itu CRISPR Cas9?
Cas9 atau CRISPR terkait protein 9 adalah endonuklease yang dipandu RNA bakteri. Oleh karena itu, ini adalah enzim yang mengenali dan memotong DNA target (terutama DNA bakteriofag) yang melengkapi RNA pemandu. Ini melakukan pembelahan untai-spesifik. Protein Cas9 dikodekan oleh gen terkait CRISPR. CRISPR cas9 adalah sistem nuklease CRISPR-Cas9 yang dipandu RNA yang dapat digunakan sebagai platform penargetan dan pengeditan DNA yang dapat diprogram RNA untuk pengeditan genom, gangguan transkripsi, modulasi epigenetik, dan pencitraan genom. Sistem CRISPR cas9 ini sangat populer di sistem pengeditan genom saat ini.
Gambar 02: CRISPR Cas9
Saat ini, sistem CRISPR/Cas9 digunakan untuk mengubah atau memodifikasi genom mamalia baik melalui represi atau aktivasi transkripsi. Sel-sel mamalia dapat merespons pemutusan DNA yang dimediasi CRISPR/Cas9 dengan mengadopsi mekanisme perbaikan. Ini dapat dilakukan dengan menggunakan metode penyambungan akhir non-homolog (NHEJ) atau perbaikan yang diarahkan pada homologi (HDR). Kedua mekanisme perbaikan ini berlangsung dengan memperkenalkan istirahat beruntai ganda. Ini menghasilkan pengeditan gen mamalia. NHEJ dapat menyebabkan ablasi mutasi gen dan dapat digunakan untuk menciptakan efek hilangnya fungsi. HDR dapat digunakan untuk memperkenalkan mutasi titik tertentu atau memperkenalkan segmen DNA dengan panjang yang bervariasi. Saat ini, sistem CRISPR/ Cas digunakan di bidang aplikasi terapeutik, biomedis, pertanian, dan penelitian.
Apa Persamaan Antara CRISPR dan CRISPR Cas9?
- Cas9 adalah bagian dari sistem CRISPR Cas.
- Sistem Crisper cas9 adalah sistem kekebalan yang secara alami ditemukan pada bakteri.
Apa Perbedaan Antara CRISPR dan CRISPR Cas9?
CRISPR adalah sekelompok sekuens DNA yang ditemukan dalam genom bakteri yang bekerja sebagai sistem pertahanan alami melawan bakteriofag. Ini terdiri dari pengulangan palindromik pendek yang diselingi secara teratur, spacer, dan gen terkait. Sebaliknya, cas9 adalah protein terkait CRISPR 9, yang merupakan enzim endonuklease yang dipandu RNA. Ia mengenali dan memotong untai ganda DNA virus. Bahkan, itu adalah bagian dari sistem pertahanan CRISPR. Jadi, inilah perbedaan utama antara CRISPR dan CRISPR cas9.
Ringkasan – CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Sistem Cas adalah sistem pertahanan mikroba. CRISPR adalah sekelompok sekuens DNA yang terdiri dari pengulangan pendek palindromik, sekuens spacer, dan gen terkait. Cas9 adalah salah satu protein Cas yang merupakan endonuklease terpandu RNA. Protein CRISPR dan Cas9 membuat sistem kekebalan yang bekerja melawan infeksi bakteriofag pada bakteri. Protein Cas9 mampu membelah DNA virus asing dan mengacaukannya. CrRNA memandu cas9 untuk mengenali DNA virus. Oleh karena itu, sistem CRISPR cas9 adalah sistem kekebalan alami yang ditemukan pada bakteri melawan virus. Jadi, ini adalah ringkasan perbedaan antara CRISPR dan CRISPR cas9.
