Perbedaan Kunci – Proteomik vs Transkriptomik
Teknologi omic adalah tren saat ini, di mana biomolekul yang berbeda dari suatu organisme dipandang sebagai kumpulan keseluruhan sehubungan dengan sifat dan fungsinya. Teknologi omic memiliki beragam aplikasi. Omik yang berbeda dari sampel biologis termasuk genomik, proteomik, transkriptomik, dan metabolomik. Proteomik melibatkan studi lengkap semua protein dalam organisme hidup. Ini didefinisikan sebagai kumpulan semua protein yang diekspresikan dalam suatu organisme, sifat struktural dan fungsionalnya. Oleh karena itu, set lengkap protein membentuk proteom. Transcriptomik adalah studi lengkap tentang semua molekul messenger RNA (mRNA) yang ada dalam organisme hidup. Dengan demikian, transkriptomik berhubungan dengan gen yang secara aktif diekspresikan dalam organisme hidup. Himpunan total mRNA dalam organisme hidup disebut sebagai transkriptom. Perbedaan utama antara Proteomik dan Transkriptomik didasarkan pada jenis biomolekul. Dalam proteomik, set total protein yang diekspresikan dalam organisme hidup dipelajari sedangkan, dalam transkriptomik, total mRNA organisme hidup dipelajari.
Apa itu Proteomik?
Istilah proteomik diciptakan pada tahun 1995 dan awalnya didefinisikan sebagai pelengkap protein total dalam sel, jaringan, atau organisme. Dengan kemajuan dalam studi proteomik, kemudian dimodifikasi untuk dianggap sebagai istilah umum yang mencakup banyak bidang studi. Saat ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksinya, modifikasinya, aplikasinya, dan pentingnya protein dipelajari. Oleh karena itu, banyak penelitian dilakukan di bidang proteomik saat ini.
Studi proteomik pertama dilakukan untuk mengidentifikasi kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan dengan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah keberhasilan ini, para ilmuwan melanjutkan untuk mengkarakterisasi kandungan protein total pada hewan seperti marmut dan tikus. Saat ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.
Aplikasi Proteomik
Ada banyak keuntungan mempelajari proteomik, karena protein adalah molekul pengatur sebagian besar aktivitas karena sifat katalis protein. Dengan demikian, studi tentang protein utuh dapat memberikan informasi mengenai status kesehatan suatu organisme. Beberapa aplikasi adalah;
- Anotasi genom: Dengan mempelajari kandungan protein suatu organisme, genom yang tepat yang bertanggung jawab atas senyawa protein aktif dapat ditentukan. Dalam skenario ini hasil dari semua genomik, Transkriptomik dan proteomik adalah penting.
- Identifikasi Penyakit / Diagnostik: Proteomik digunakan dalam identifikasi kondisi penyakit, dengan membandingkan yang sehat dan yang sakit
- Untuk melakukan ekspresi protein yang dipelajari selama eksperimen.
- Modifikasi protein dan studi interaksi: Untuk menggunakan protein dalam kondisi in vitro atau dan kondisi in vivo, untuk memutuskan kondisi penyimpanan protein yang diekstraksi ini dan untuk mempelajari perilaku protein secara in vitro, in vivo dan in – metode silika.
Gambar 01: Proteomik
Ada berbagai teknik yang terlibat dalam proteomik
- Ekstraksi protein total dan pemisahan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga dapat dipisahkan menggunakan High-Performance Liquid Chromatography (HPLC).
- Pengurutan protein yang diekstraksi menggunakan metode seperti metode pengurutan Edmund atau spektrometri massa.
- Setelah urutan diidentifikasi, sifat struktural dan fungsional dari kandungan protein dianalisis menggunakan perangkat lunak berbasis komputer dan alat bioinformatika.
Apa Transkriptomik itu?
Istilah transkriptom diciptakan baru-baru ini. Transkriptomik adalah studi tentang total konten mRNA suatu organisme. Total mRNA adalah DNA yang diekspresikan dalam organisme hidup atau sel. Koleksi lengkap mRNA disebut sebagai transkriptom.
Langkah-langkah untuk menganalisis transkriptom meliputi,
- Ekstraksi RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi gel kolom dengan manik-manik poli DT.
- Pengurutan mRNA selesai.
Teknologi microarray adalah salah satu cara umum untuk mengidentifikasi transkriptom suatu organisme. Teknik microarray melibatkan pelat probe dengan untai komplementer dari transkriptom. Setelah hibridisasi, mRNA yang ada dalam organisme atau sel dapat dikarakterisasi.
Gambar 02: Teknik Transkriptomik
Transkriptomik sekarang banyak digunakan di bidang medis. Diagnostik penyakit dan profil penyakit adalah bidang utama di mana Transkriptomik digunakan. Dengan menganalisis transkriptom suatu organisme, mRNA asing dapat diidentifikasi, dan jika ada infeksi, dapat diidentifikasi. RNA non-coding dapat dipisahkan menggunakan teknologi transkriptomik. Dan juga ekspresi gen di bawah tekanan lingkungan yang berbeda dapat dipantau.
Apa Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?
- Keduanya merupakan bagian dari konsep teknologi omic.
- Keduanya digunakan dalam diagnosis penyakit dan karakterisasi penyakit suatu organisme.
- Kedua area studi melibatkan ekstraksi biomolekul, pemisahan biomolekul dan langkah-langkah pengurutan.
Apa Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?
Protemik vs Transkriptomik |
|
| Proteomik melibatkan studi lengkap semua protein dalam organisme hidup. | Transkriptomik adalah studi lengkap tentang semua molekul messenger RNA (mRNA) yang ada dalam organisme hidup. |
| Tipe Bio Molekul yang Dipelajari | |
| Protein dipelajari dalam proteomik. | mRNA dipelajari dalam transkriptomik. |
| Faktor yang Dipelajari | |
| Struktur, fungsi, interaksi, modifikasi, dan aplikasi protein dipelajari dalam proteomik. | Struktur urutan, interaksi dengan lingkungan dan aplikasi mRNA dipelajari dalam transkriptomik. |
Ringkasan – Proteomik vs Transkriptomik
Omics memainkan peran penting dalam bidang ilmu kehidupan. Proteomik mengacu pada studi tentang proteom yang membentuk koleksi lengkap protein dalam sel atau organisme. Transkriptomik mengacu pada studi tentang transkriptom yang merupakan set lengkap DNA yang diekspresikan dalam bentuk mRNA. Dua bidang studi, proteomik dan transkriptomik, diturunkan setelah pengenalan genomik dan saat ini digunakan secara luas dalam diagnosa medis dan dalam karakterisasi dan penyaringan organisme. Inilah perbedaan antara proteomik dan transkriptomik.
Unduh PDF Proteomik vs Transkriptomik
Anda dapat mengunduh versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini: Perbedaan Antara Proteomik dan Transkriptomik
