Perbedaan utama antara proteomik yang ditargetkan dan tidak ditargetkan adalah bahwa proteomik yang ditargetkan bertujuan untuk mengukur kelimpahan protein tertentu sementara proteomik yang tidak ditargetkan tidak menargetkan protein tertentu.
Proteomik adalah studi skala besar tentang protein, struktur, dan fungsinya. Ini mempelajari seluruh pelengkap protein dalam sel, jaringan atau organisme dalam kondisi tertentu. Ada dua jenis proteomik sebagai proteomik bertarget dan proteomik tidak bertarget.
Apa itu Proteomik Bertarget?
Seperti namanya, proteomik yang ditargetkan menargetkan protein atau peptida tertentu dalam campuran protein yang kompleks untuk dianalisis. Kemudian menganalisis keberadaan dan jumlah protein spesifik yang telah dipilih sebelumnya. Metode ini hanya mungkin untuk satu sampel atau beberapa sampel. Metode ini cocok bahkan untuk kelompok protein tertentu. Ini menghasilkan data yang lebih tepat, kuantitatif dan sensitif. Selain itu, spektrometri massa yang digabungkan dengan proteomik yang ditargetkan menghasilkan pengukuran andal yang lebih akurat. Metode ini menggunakan spektrometer massa triple quadrupole (QQQ) untuk analisisnya.
Gambar 01: Proteomik
Proteomik bertarget adalah metode yang cocok jika Anda ingin memverifikasi apakah target knockdown benar-benar dirobohkan atau ketika Anda ingin mengukur protein/peptida tertentu dalam serum darah, cairan otak atau dalam lisat sel, dll. Anda juga dapat gunakan jika Anda ingin memeriksa apakah protein tertentu diekspresikan secara berbeda di seluruh sampel atau selama percobaan kursus waktu.
Apa itu Proteomik Tidak Bertarget?
Proteomik yang tidak ditargetkan, seperti namanya, tidak menargetkan protein atau peptida tertentu untuk analisisnya. Proteomik penemuan adalah nama lain untuk proteomik yang tidak ditargetkan. Faktanya, ini adalah analisis yang lebih 'global'. Umumnya, melakukan proteomik yang tidak ditargetkan adalah untuk menjawab pertanyaan “protein atau protein apa yang ada dalam sampel ini atau beberapa sampel?”. Metode ini tidak sensitif sebagai proteomik yang ditargetkan. Tetapi dapat mengidentifikasi dan mengukur banyak protein termasuk protein baru. Proteomik yang tidak ditargetkan dapat menghasilkan pengukuran kuantitatif dan kualitatif.
Apa Persamaan Antara Proteomik Bertarget dan Tidak Bertarget?
- Proteomik bertarget dan tidak bertarget mengukur protein dalam sampel.
- Mereka penting dalam analisis proteome.
- Metode ini menggunakan spektrometri massa.
Apa Perbedaan Antara Proteomik Bertarget dan Tidak Bertarget?
Pertama, proteomik yang ditargetkan adalah penentuan keberadaan dan kuantitas protein atau peptida tertentu dalam campuran protein yang kompleks. Sebaliknya, proteomik yang tidak ditargetkan adalah studi kuantitatif dan kualitatif protein yang ada dalam sampel atau sampel tanpa menargetkan protein tertentu. Proteomik yang ditargetkan dilakukan dengan protein yang dipilih sebelumnya atau yang ditargetkan sementara proteomik yang tidak ditargetkan dilakukan untuk mengetahui jenis protein dalam sampel ini. Selain itu, proteomik yang ditargetkan lebih sensitif daripada proteomik yang tidak ditargetkan.
Ringkasan – Proteomik Bertarget vs Tidak Bertarget
Singkatnya, proteomik yang ditargetkan dan tidak ditargetkan adalah dua jenis studi protein. Seperti namanya, proteomik yang ditargetkan menargetkan protein tertentu sementara proteomik yang tidak ditargetkan tidak menargetkan protein tertentu. Inilah perbedaan antara proteomik yang ditargetkan dan tidak ditargetkan.
