Perbedaan utama antara proteomik dan metabolomik adalah bahwa proteomik adalah studi tentang semua protein suatu organisme sedangkan metabolomik adalah studi tentang semua metabolit suatu organisme.
Genomics adalah studi tentang susunan genetik suatu organisme. Proteomik dan metabolomik adalah dua ilmu omik yang terkait dengan genomik. Proteome mengacu pada semua protein dalam sel atau organisme. Metabolome, di sisi lain, mengacu pada semua metabolit suatu organisme. Dengan demikian, studi tentang proteom adalah proteomik sedangkan studi tentang metabolom adalah metabolomik. Baik proteomik dan metabolomik penting dalam diagnostik penyakit dan dalam karakterisasi dan skrining organisme. Selain itu, keduanya terhubung dalam banyak aspek biologi sel, terutama dalam pensinyalan sel, degradasi dan pembentukan protein, dan modifikasi pasca-translasi.
Apa itu Proteomik?
Proteome adalah pelengkap protein total dalam sel, jaringan atau organisme. Oleh karena itu, proteomik adalah studi tentang proteom suatu organisme. Dalam proteomik, karakteristik protein yang berbeda dianalisis. Oleh karena itu, proteomik terutama berfokus pada struktur, orientasi, fungsi, interaksi protein, modifikasi, aplikasi, dan pentingnya protein. Itulah sebabnya banyak proyek penelitian dilakukan di bidang proteomik saat ini.
Studi proteomik pertama dilakukan untuk mengidentifikasi kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein total dilakukan dengan menggunakan gel dua dimensi (2D). Setelah keberhasilan proyek ini, para ilmuwan melanjutkan untuk mengkarakterisasi kandungan protein total pada hewan seperti marmut dan tikus. Saat ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.
Ada banyak keuntungan mempelajari proteomik karena protein adalah molekul pengatur sebagian besar aktivitas karena sifat katalis protein. Dengan demikian, studi tentang protein utuh dapat memberikan informasi mengenai status kesehatan suatu organisme. Selain itu, proteomik memiliki banyak aplikasi dalam anotasi genom, identifikasi penyakit dan diagnostik, melakukan studi ekspresi protein selama eksperimen dan modifikasi protein dan studi interaksi, dll.
Gambar 01: Proteomik
Ada berbagai teknik yang terlibat dalam proteomik, termasuk ekstraksi protein total, pemisahannya menggunakan elektroforesis gel 2D, pengurutan protein yang diekstraksi menggunakan metode seperti metode pengurutan Edmund atau spektrometri massa dan analisis struktur dan fungsional sifat protein menggunakan perangkat lunak berbasis komputer dan alat bioinformatika.
Apa itu Metabolomik?
Metabolomik adalah studi tentang semua metabolit dalam sel, jaringan, atau organisme. Ini mencakup identifikasi dan kuantifikasi metabolit seluler menggunakan alat analisis dan statistik canggih yang berbeda. Metabolomik adalah studi penting karena mengungkapkan informasi mengenai metabolisme suatu organisme.
Gambar 02: Metabolomik
Untuk mempelajari substrat dan produk dari reaksi metabolisme, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis. Spektrometri massa menghasilkan metabolit dan konsentrasinya, yang mencerminkan keadaan biokimia sebenarnya dari sel atau jaringan. Oleh karena itu, metabolomik dapat dianggap sebagai representasi terbaik dari fenotipe molekuler suatu organisme. Selain itu, metabolomik dapat dianggap sebagai perpanjangan dari proteomik karena sebagian besar metabolit dihasilkan karena aktivitas enzim yang merupakan protein.
Apa Persamaan Antara Proteomik dan Metabolomik?
- Proteomik dan metabolomik adalah dua ilmu omik yang terkait dengan genomik.
- Metabolomik dapat dianggap sebagai perpanjangan dari proteomik.
- Proteome dan metabolome terkait erat dengan banyak penelitian.
Apa Perbedaan Antara Proteomik dan Metabolomik?
Proteomik adalah studi skala besar tentang protein termasuk struktur dan fungsinya, di dalam sel atau organisme. Sementara itu, metabolomik adalah studi tentang profil metabolit dalam sel, jaringan atau organisme di bawah serangkaian kondisi tertentu. Jadi, inilah perbedaan utama antara proteomik dan metabolomik. Selain itu, proteomik terutama menyangkut set lengkap protein sementara metabolomik terutama menyangkut set lengkap metabolit, termasuk beragam molekul kecil seperti peptida, karbohidrat, lipid, nukleosida, dan produk katabolik dari senyawa eksogen, dll. Oleh karena itu, ini adalah perbedaan lain antara proteomik dan metabolomik.
Infografik di bawah ini merangkum perbedaan antara proteomik dan metabolomik.
Ringkasan – Proteomik vs Metabolomik
Organisme hidup dapat dipelajari menggunakan genom, protein, dan metabolitnya. Genomik, proteomik, dan metabolomik adalah tiga bidang yang mempelajari susunan genetik, protein, dan metabolit masing-masing sel atau organisme. Proteomik penting karena merupakan refleksi dinamis dari gen dan lingkungan. Metabolomik sangat penting karena secara langsung mencerminkan status terkini dari reaksi biokimia sel atau status metabolisme suatu organisme. Jadi, ini merangkum perbedaan antara proteomik dan metabolomik.
