Perbedaan Kunci – Ekstraksi DNA vs RNA
Studi tentang DNA dan RNA merupakan aspek vital untuk memahami konsep dasar biologi molekuler, bioteknologi, dan genetika. Ekstraksi sampel DNA dan RNA murni diperlukan untuk melakukan prosedur eksperimental selama studi ini. Perbedaan utama antara ekstraksi DNA dan RNA adalah bahwa proses ekstraksi DNA memurnikan DNA sementara ekstraksi RNA memurnikan RNA. Proses ekstraksi DNA memiliki tiga langkah berbeda: lisis sel dan katabolisme lipid dan protein membran, penggumpalan katabolit oleh larutan garam pekat dan pengendapan DNA dengan etanol. Prosedur tiga langkah dapat terdiri dari dua langkah opsional. Proses pemurnian RNA terdiri dari empat langkah berbeda: penambahan guanidium tiosianat untuk lisis sel, denaturasi protein termasuk ribonuklease, pemisahan RNA dengan penambahan kloroform dan fenol dan pencucian endapan menggunakan etanol.
Apa itu Ekstraksi DNA?
Ekstraksi DNA adalah proses fisik dan kimia yang digunakan untuk memurnikan DNA dari sampel. Ekstraksi DNA merupakan aspek penting dalam konteks biologi molekuler dan ilmu forensik. Prosesnya terdiri dari tiga langkah dasar. Awalnya, sel-sel bunga harus diperoleh. Selanjutnya, lisis sel difasilitasi untuk memecahkan membran sel, yang membuka sel dan memperlihatkan sitoplasma bersama dengan DNA. Surfaktan atau deterjen lain dapat digunakan untuk melisiskan lipid dari membran sel sementara protein yang ada dikatabolisme oleh protease. Ini merupakan langkah opsional. Setelah sel dilisiskan, penggumpalan molekul yang dikatabolisme difasilitasi oleh larutan garam pekat. Ini diikuti oleh sentrifugasi larutan yang memisahkan gumpalan puing-puing dari DNA. Pada tahap ini, DNA yang terdiferensiasi dicampur dengan reagen dan garam yang digunakan selama siklus sel.
Gambar 01: Ekstraksi DNA
Untuk memurnikannya lebih lanjut, langkah-langkah berikut dapat digunakan. Salah satu metodenya adalah presipitasi etanol, yang melibatkan pencampuran etanol dingin dengan sampel DNA yang dipisahkan. DNA tidak larut dalam alkohol dan dengan demikian menghasilkan pelet karena agregasi molekul DNA bersama-sama. Natrium asetat ditambahkan dalam proses ini untuk meningkatkan derajat pengendapan dengan meningkatkan kekuatan ionik. Selain proses pengendapan etanol, proses ekstraksi fenol-kloroform juga dapat diinduksi untuk ini. Dalam metode ini, fenol mendenaturasi protein yang ada dalam sampel. Setelah disentrifugasi, protein terdenaturasi akan tetap berada dalam fase organik sedangkan molekul DNA yang dicampur dengan kloroform akan berada dalam fase air. Kloroform akan menghilangkan residu fenol. Setelah ekstraksi selesai, DNA dilarutkan dalam buffer TE atau air ultra murni.
Apa itu Ekstraksi RNA?
Pemurnian RNA adalah proses pemurnian RNA dari sampel biologis. Karena adanya ribonuklease dalam sel dan jaringan, proses ini menjadi rumit. Enzim ribonuklease memiliki kemampuan untuk mendegradasi RNA dengan cepat. Sifat kimia ribonuklease sangat stabil, dan sulit untuk menonaktifkannya. Menetralisir ribonuklease adalah pilihan. Karena enzim ini ada di mana-mana dalam sel dan jaringan, teknik khusus dikembangkan untuk ekstraksi RNA. Dari sekian banyak metode, metode yang umum digunakan adalah ekstraksi Guanidinium thiocynate-phenol-chloroform.
Gambar 02: Ekstraksi RNA
Metode ekstraksi Guanidinium thiocynate-phenol-chloroform bergantung pada sentrifugasi dan pemisahan fase. Campuran yang akan disentrifugasi terdiri dari sampel air dan larutan jenuh air yang terdiri dari fenol dan kloroform. Setelah disentrifugasi, larutan terdiri dari fasa air atas dan fasa organik bawah pada kondisi pH netral (pH 7-8). RNA hadir dalam fase air. Fase organik biasanya terdiri dari protein yang dilarutkan dalam fenol dan lipid yang dilarutkan dalam kloroform. Agen chaotropic (molekul yang memiliki kemampuan untuk memutuskan ikatan hidrogen antara molekul air) ditambahkan; ini dikenal sebagai, guanidinium tiosianat. Agen ini memiliki kemampuan untuk mendenaturasi protein yang meliputi ribonuklease yang dapat mendegradasi RNA dan terlibat dalam lisis sel. Ini juga memisahkan rRNA dari protein ribosom. Langkah terakhir pemurnian RNA adalah mencuci presipitasi fase air dengan etanol. RNA juga dapat dimurnikan menggunakan nitrogen cair.
Apa Persamaan Ekstraksi DNA dan RNA?
- Kedua proses ekstraksi menggunakan bahan kimia berbahaya seperti fenol dan kloroform.
- Sentrifugasi adalah teknik penting untuk kedua proses.
- Etanol digunakan untuk mencuci endapan dan untuk mendapatkan DNA atau RNA yang dimurnikan.
Apa Perbedaan Ekstraksi DNA dan RNA?
Ekstraksi DNA vs RNA |
|
| Ekstraksi DNA adalah proses mengekstraksi DNA dari suatu organisme atau sampel. | RNA ekstraksi adalah proses yang mengekstrak RNA dari sampel. |
| Langkah | |
| Proses ekstraksi DNA terdiri dari tiga langkah berbeda dengan dua langkah opsional. | Proses ekstraksi RNA terdiri dari empat langkah berbeda. |
| Reagen | |
| Surfaktan, protease (opsional), alkohol, kloroform, fenol, natrium asetat digunakan untuk ekstraksi DNA. | Guanidium tiosianat, kloroform, fenol, etanol digunakan untuk ekstraksi RNA. |
Ringkasan – Ekstraksi DNA vs RNA
Ekstraksi DNA dan RNA adalah aspek penting dari prosedur eksperimental untuk studi biologi molekuler, genetika, dan bioteknologi. Kedua proses tersebut melibatkan reagen yang serupa, tetapi ekstraksi RNA menggunakan reagen khusus yang dikenal sebagai Guanidium tiosianat yang mengurangi aktivitas ribonuklease. Inilah perbedaan utama antara ekstraksi DNA dan RNA.
Unduh Ekstraksi DNA vs RNA Versi PDF
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara Ekstraksi DNA dan RNA
