Perbedaan Kunci – DNA Hulu vs Hilir
Penting untuk memiliki pengetahuan umum tentang komposisi dan struktur DNA untuk memahami perbedaan antara DNA hulu dan hilir. DNA tersusun atas rantai polinukleotida. Nukleotida adalah blok bangunan yang membuat rantai polinukleotida dan setiap nukleotida terbuat dari tiga komponen: gula lima karbon, basa nitrogen, dan gugus fosfat. Gugus fosfat dan gugus OH masing-masing melekat pada karbon posisi 5' dan karbon posisi 3' dari molekul gula dalam nukleotida. Nukleotida disatukan oleh ikatan fosfodiester yang terbentuk antara gugus fosfat 5’ dari satu nukleotida dan gugus 3’OH dari nukleotida yang berdekatan. Jika rantai polinukleotida memiliki gugus fosfat 5’ bebas, rantai tersebut ditetapkan sebagai ujung 5’; jika memiliki gugus 3’ OH bebas, ia ditetapkan sebagai ujung 3’. Oleh karena itu, untai DNA biasanya memiliki ujung 5' dan 3' sesuai dengan posisi ujung rantai polinukleotida. DNA juga ada sebagai bentuk untai ganda. Dua untai antiparalel satu sama lain. Oleh karena itu, DNA memiliki dua untai yang berjalan menuju arah 5' ke 3' dan arah 3' ke 5'. DNA hulu dan hilir dirujuk dengan mengacu pada transkripsi dan sintesis untai mRNA 5' hingga 3'. Jika DNA dianggap menuju ujung 5 untai pengkodean dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hulu. Jika DNA dianggap menuju ujung 3 'dari untai pengkode dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hilir. Inilah perbedaan utama antara DNA hulu dan hilir.
Apa itu DNA Hulu?
Gen adalah hereditas unit struktural dan fungsional yang terletak pada DNA suatu organisme. Itu disimpan dengan instruksi untuk membangun protein. Gen memiliki wilayah spesifik dari molekul DNA. Bila diperlukan, ia mentranskripsi dan menerjemahkan menjadi protein melalui sintesis untai mRNA. Biasanya untai pengkode gen berjalan dari arah 5 'ke 3'. Ketika ditranskripsi, menghasilkan untai mRNA ke arah yang sama 5 'ke 3'. Selama transkripsi, untai antisense 3 'sampai 5' berfungsi sebagai untai cetakan dan memulai sintesis mRNA. Ada situs inisiasi transkripsi dalam gen. Dengan mengacu pada situs inisiasi transkripsi, wilayah DNA menuju ujung 5 'dari untai pengkodean dikenal sebagai DNA hulu. Sebuah promotor gen biasanya terletak di wilayah hulu DNA. Pada gen eukariotik, terdapat kotak TATA, elemen proksimal promotor, dan enhancer di daerah hulu gen. Wilayah hulu gen disebut dengan angka negatif. DNA hulu dari suatu gen sangat penting untuk transkripsi.
Apa itu DNA Hilir?
Situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai +1 titik gen. Wilayah DNA dari titik +1 menuju ujung 3 'dari untai pengkodean dikenal sebagai DNA hilir. Dengan kata lain, hilir gen adalah dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 5 ' dari untai template. Oleh karena itu, DNA hilir dari suatu wilayah gen mencakup unit transkripsi dan sekuens lain seperti sekuens terminator. Promotor dapat mempengaruhi urutan hilir gen. Bagian hilir gen disebut dengan angka positif. DNA hilir dari suatu gen adalah daerah sebenarnya yang memberikan produk protein.
Gambar 01: DNA Hulu dan Hilir
Apa perbedaan DNA Hulu dan DNA Hilir?
DNA Hulu vs Hilir |
|
| DNA wilayah menuju ujung 5' dari urutan pengkodean dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hulu. | Daerah DNA menuju ujung 3' untai pengkode dari situs inisiasi transkripsi dikenal sebagai DNA hilir. |
| Elemen | |
| Promotor dan enhancer terletak di DNA hulu | Unit transkripsi dan urutan terminator terletak di hilir DNA. |
| Penomoran | |
| Nukleotida di daerah hulu disebut dengan bilangan negatif | Nukleotida dirujuk dengan bilangan positif. |
| Fungsi | |
| Wilayah ini berisi elemen yang diperlukan untuk mengatur dan memulai transkripsi | Wilayah ini berisi instruksi untuk menghasilkan protein dan menghentikan transkripsi |
Ringkasan – DNA Hulu vs Hilir
Sangat mudah untuk mengidentifikasi hulu dan hilir untai RNA. Berkenaan dengan situs referensi, wilayah menuju ujung 5 'dari untai RNA dikenal sebagai RNA hulu sedangkan wilayah menuju ujung 3 dikenal sebagai RNA hilir. Namun, dalam DNA, ada dua untai yang berjalan di kedua arah 5' ke 3' dan 3' ke 5'. Oleh karena itu, perbedaan antara DNA hulu dan hilir rumit. Oleh karena itu, dibedakan dengan mengacu pada transkripsi gen. Dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 5 untai indera, wilayah DNA dikenal sebagai DNA hulu sedangkan dari situs inisiasi transkripsi menuju ujung 3 'dari untai rasa dikenal sebagai DNA hilir. Inilah perbedaan DNA hulu dan hilir.
