Perbedaan utama antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah bahwa DNA bebas sel adalah berbagai bentuk DNA yang beredar bebas dalam darah sedangkan DNA tumor yang bersirkulasi adalah DNA turunan tumor yang terfragmentasi yang beredar dalam darah.
DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah dua jenis asam nukleat yang bersirkulasi. Sirkulasi asam nukleat ditemukan oleh Mandel and Metal pada tahun 1948. Kemudian, ditemukan bahwa jumlah asam nukleat yang bersirkulasi pada pasien yang sakit sangat tinggi. Penemuan ini pertama kali dibuat dalam kaitannya dengan pasien lupus. Selain itu, asam nukleat yang beredar memiliki nilai prognostik yang lebih tinggi dan dapat digunakan sebagai biomarker untuk mendeteksi berbagai penyakit.
Apa itu DNA Bebas Sel?
DNA bebas sel (Cf DNA) mengacu pada berbagai bentuk DNA seperti DNA tumor yang beredar, DNA mitokondria bebas sel, dan DNA janin bebas sel, dll., yang beredar bebas dalam darah. Peningkatan kadar DNA bebas sel diamati pada penyakit lanjut seperti kanker, trauma, sepsis, infark miokard, diabetes, stroke, penyakit sel sabit, dll. Selain kanker dan kedokteran janin, DNA bebas sel adalah biomarker yang berguna untuk banyak penyakit. DNA ini dapat digunakan untuk mendeteksi penolakan cangkok transplantasi juga. Mereka juga digunakan dalam menentukan stres biasa, membedakan jenis kelamin prenatal, dan dalam pengujian paternitas.
Gambar 01: DNA Bebas Sel
DNA bebas sel biasanya merupakan molekul DNA ekstraseluler beruntai ganda. Ini terdiri dari fragmen kecil (50 hingga 200 bp) dan fragmen yang lebih besar (21 kb). Selain itu, telah diakui sebagai biomarker yang andal untuk diagnosis kanker prostat dan payudara. DNA bebas sel sebagian besar beredar dalam aliran darah sebagai nukleosom. Nukleosom adalah kompleks inti dari histon dan DNA. DNA Cf dapat dikuantifikasi menggunakan berbagai teknik seperti PCR, sekuensing paralel masif, spektrometri ultraviolet, pewarnaan PicoGreen, dan ELISA. Karena deteksi DNA Cf dalam aliran darah adalah metode yang cepat, mudah, non-invasif, berulang, di masa depan, ini akan menjadi biomarker potensial untuk mendiagnosis berbagai penyakit seperti penyakit rematik autoimun dan tumor.
Apa itu DNA Tumor yang Beredar?
Circulating tumor DNA (Ct DNA) adalah DNA turunan tumor terfragmentasi yang beredar dalam darah. Ini memiliki asal tumor. Karena tumor yang bersirkulasi dapat mencerminkan seluruh genom tumor, ia telah memperoleh daya tarik yang luas untuk kegunaan potensialnya dalam pengaturan klinis. Biopsi cair, yang mengambil darah, dapat digunakan untuk menguji tumor yang bersirkulasi.
Gambar 02: DNA Tumor yang Beredar
Proses biologis yang kemungkinan terlibat dalam pelepasan DNA Ct termasuk apoptosis dan nekrosis dari sel yang sekarat atau pelepasan aktif dari sel tumor. Dalam jaringan sehat, fagosit yang menginfiltrasi dapat membersihkan DNA Ct. Selanjutnya, berbagai teknik dapat digunakan dalam menganalisis DNA tumor yang bersirkulasi seperti droplet digital PCR, BEAMing, CAPP-Seq (deep sequencing), Safe-sequencing, dan duplex sequencing.
Apa Persamaan Antara DNA Bebas Sel dan DNA Tumor yang Beredar?
- DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah dua jenis asam nukleat yang bersirkulasi.
- Mereka terdiri dari nukleotida.
- Kedua tipe tersebut dapat digunakan sebagai penanda potensial untuk mendiagnosis berbagai penyakit dalam pengaturan klinis.
- Mereka ditemukan dalam aliran darah.
- Keduanya adalah bentuk molekul DNA ekstraseluler.
- Keduanya dibersihkan dengan menginfiltrasi fagosit.
Apa Perbedaan Antara DNA Bebas Sel dan DNA Tumor yang Beredar?
DNA bebas sel adalah berbagai bentuk DNA seperti DNA tumor yang bersirkulasi, DNA mitokondria bebas sel dan DNA janin bebas sel, dll., yang beredar bebas dalam darah, sedangkan DNA tumor yang bersirkulasi adalah DNA turunan tumor yang terfragmentasi yang beredar dalam darah. Jadi, inilah perbedaan utama antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi. Selanjutnya, DNA bebas sel bersirkulasi dalam fragmen-fragmen yang berkisar antara 50-220 bp sedangkan DNA tumor yang bersirkulasi bersirkulasi dalam fragmen-fragmen yang berkisar antara 134-144 bp.
Infografik berikut menyajikan perbedaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang beredar dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – DNA Bebas Sel vs DNA Tumor yang Beredar
Asam nukleat yang beredar dibuang ke aliran darah melalui mekanisme yang diatur atau kebetulan. DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi adalah dua jenis asam nukleat yang bersirkulasi. DNA bebas sel adalah berbagai bentuk DNA seperti DNA tumor yang bersirkulasi, DNA mitokondria bebas sel, DNA janin bebas sel yang beredar bebas dalam darah sedangkan DNA tumor yang bersirkulasi adalah DNA turunan tumor yang terfragmentasi yang beredar dalam darah. Jadi, ini merangkum perbedaan antara DNA bebas sel dan DNA tumor yang bersirkulasi.
