Perbedaan utama antara T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase adalah bahwa T4 DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteriofag T4 sedangkan E. coli DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteri E. coli.
DNA ligase adalah jenis enzim spesifik yang memfasilitasi penggabungan untaian DNA bersama-sama melalui pembentukan ikatan fosfodiester. Ini memainkan peran penting dengan memperbaiki kerusakan untai tunggal dan untai ganda dalam DNA organisme hidup. Selain itu, DNA ligase digunakan dalam perbaikan DNA dan replikasi DNA. Terlepas dari kegunaan di atas, DNA ligase juga digunakan secara luas dalam eksperimen biologi molekuler seperti teknologi DNA rekombinan. T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase adalah dua jenis enzim DNA ligase.
Apa itu T4 DNA Ligase?
T4 ligase adalah enzim pengikat DNA yang diisolasi dari bakteriofag T4. Bakteriofag T4 adalah virus yang menginfeksi Escherichia coli. Enzim ligase T4 adalah ligase DNA yang paling umum digunakan dalam penelitian laboratorium biologi molekuler. Biasanya, T4 ligase mengkatalisis penggabungan dua untai DNA untai ganda yang kohesif atau tumpul antara gugus hidroksil 5' fosfat dan 3' nukleotida yang berdekatan. Ini juga dapat mengkatalisis penggabungan RNA ke untai DNA atau RNA dalam molekul dupleks. Namun, enzim ini tidak akan bergabung dengan asam nukleat untai tunggal. Selain itu, ia juga dapat mengikat DNA ujung tumpul dengan efisiensi yang jauh lebih besar daripada DNA ligase E. coli.
Gambar 01: T4 DNA Ligase
Enzim ini membutuhkan ATP sebagai kofaktor. Beberapa percobaan penelitian rekayasa genetika telah menghasilkan lebih banyak enzim DNA ligase aktif daripada ligase DNA T4 tipe liar. Dalam salah satu pendekatan, mereka menciptakan molekul enzim fusi dengan menyisir T4 DNA ligase ke molekul p50 atau NF-kB. Enzim ligase T4 baru ini 160% lebih aktif dalam ligasi ujung tumpul untuk tujuan kloning daripada ligase DNA T4 tipe liar. Selanjutnya, suhu optimal T4 DNA ligase untuk mengkatalis reaksi ligasi secara lebih tepat adalah 16 °C.
Apa itu DNA Ligase E Coli?
E. coli DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteri E. coli. Gen yang bertanggung jawab untuk membuat DNA ligase E. coli adalah gen lig. DNA E. coli, ligase serta sebagian besar ligase DNA prokariota, menggunakan energi yang diperoleh oleh NAD (nicotinamide adenine dinucleotide) untuk membuat ikatan fosfodiester.
Gambar 02: E. Coli DNA Ligase
E. E. coli DNA ligase merupakan enzim ligasi yang dapat menggabungkan fragmen DNA dengan mengkatalisis pembentukan ikatan fosfodiester antara fragmen DNA untai ganda yang mengandung 5’ fosfat termini dan 3’ hidroksil termini. Selain itu, ia tidak mengikat DNA ujung tumpul kecuali dalam kondisi khusus seperti kepadatan molekuler dengan polietilen glikol. Itu juga tidak dapat menggabungkan RNA ke DNA secara efisien. Selanjutnya, aktivitas E. coli DNA ligase dapat ditingkatkan dengan adanya DNA polimerase 1 pada konsentrasi yang tepat. Namun, ketika konsentrasi enzim DNA polimerase 1 lebih tinggi, hal itu memiliki efek buruk pada aktivitas DNA ligase E. coli.
Apa Persamaan Antara T4 DNA Ligase dan E Coli DNA Ligase?
- T4 DNA ligase dan E-coli DNA ligase adalah dua jenis enzim DNA ligase.
- Keduanya adalah protein yang terdiri dari asam amino.
- Enzim-enzim ini mengkatalisis pembentukan ikatan fosfodiester antara 5' fosfat yang disandingkan dan 3' hidroksil termini dalam DNA dupleks.
- Mereka memiliki kegunaan yang luas dalam eksperimen biologi molekuler seperti teknologi DNA rekombinan.
Apa Perbedaan Antara T4 DNA Ligase dan E Coli DNA Ligase?
T4 DNA ligase adalah enzim yang diisolasi dari bakteriofag T4 sedangkan DNA ligase E. coli adalah enzim yang diisolasi dari bakteri E. coli. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara ligase DNA T4 dan ligase DNA E. coli. Selanjutnya, sumber energi untuk T4 DNA ligase adalah ATP. Sedangkan sumber energi untuk DNA ligase E. coli adalah NAD.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara DNA ligase T4 dan DNA ligase E coli dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase adalah dua enzim yang mengkatalisis pembentukan ikatan fosfodiester antara 5' fosfat yang disandingkan dan 3' hidroksil termini dalam DNA dupleks. T4 ligase merupakan enzim yang diisolasi dari bakteriofag T4 sedangkan E. coli DNA ligase merupakan enzim yang diisolasi dari bakteri E. coli. Jadi, inilah perbedaan utama antara T4 DNA ligase dan E coli DNA ligase.
