Perbedaan utama antara faktor sigma dan faktor rho adalah bahwa faktor sigma adalah protein yang dibutuhkan untuk inisiasi transkripsi pada bakteri sedangkan faktor rho adalah protein yang dibutuhkan untuk penghentian transkripsi pada bakteri.
Faktor sigma dan faktor rho adalah dua faktor penting untuk transkripsi bakteri. Transkripsi bakteri adalah proses di mana sepotong DNA bakteri disalin ke dalam untaian mRNA (messenger RNA) yang baru dibuat. Proses ini dikatalisis oleh enzim yang dikenal sebagai RNA polimerase. Bakteri sangat bergantung pada transkripsi dan translasi untuk merespon lingkungan mereka dengan baik. RNA polimerase bakteri terdiri dari inti dan struktur holoenzim. Inti mengandung subunit,, dan 2ω sedangkan holoenzim mengandung faktor sigma. Selain itu, faktor pendukung RNA polimerase yang dikenal sebagai faktor rho juga sangat penting untuk transkripsi bakteri.
Apa itu Faktor Sigma?
Sigma factor atau faktor spesifisitas adalah protein yang dibutuhkan untuk inisiasi transkripsi pada bakteri. Ini adalah faktor inisiasi transkripsi bakteri. Faktor ini memungkinkan pengikatan enzim RNA polimerase ke wilayah spesifik DNA yang disebut wilayah promotor selama transkripsi. Faktor sigma biasanya homolog dengan faktor transkripsi archaeal B dan faktor transkripsi eukariotik TF11B. Selain itu, faktor sigma spesifik dari gen tertentu bervariasi tergantung pada gen dan sinyal lingkungan. Promotor dipilih oleh RNA polimerase tergantung pada faktor sigma yang terkait dengannya.
Gambar 01: Faktor Sigma
Faktor sigma juga dapat ditemukan di kloroplas tanaman sebagai bagian dari plastid-encoded polymerase (PEP). Faktor sigma dan RNA polimerase sama sekali dikenal sebagai RNA polimerase holoenzim. Berat molekul faktor sigma adalah sekitar 70 kDa. Setelah inisiasi transkripsi, faktor sigma terdisosiasi dari kompleks. Kemudian RNA polimerase melanjutkan pemanjangan sampai transkripsi berakhir.
Apa itu Faktor Rho?
Faktor Rho adalah protein prokariotik yang terlibat dalam penghentian transkripsi. Faktor Rho biasanya berikatan dengan situs jeda terminator transkripsi. Situs ini adalah wilayah terbuka dari RNA untai tunggal di dekat kerangka baca terbuka pada urutan miskin guanin kaya sitosin. Ini adalah protein transkripsi penting dalam prokariota. Dalam Escherichia coli, faktor rho adalah sekitar 274,6 kDa heksamer dari subunit yang identik. Setiap subunit memiliki domain pengikatan RNA dan domain hidrolisis ATP. Selain itu, fungsi dari faktor rho adalah aktivitas helikase.
Gambar 02: Faktor Rho
Faktor Rho mengikat molekul RNA dan kemudian menggunakan aktivitas ATPasenya untuk menyediakan energi untuk mentranslokasi molekul RNA. Faktor Rho melakukan translokasi hingga mencapai daerah heliks RNA-DNA, di mana ia melepaskan struktur dupleks hibrida (RNA-DNA). Proses ini menghentikan RNA polimerase di tempat terminasi yang mengakhiri proses transkripsi.
Apa Persamaan Antara Sigma Factor dan Rho Factor?
- Faktor sigma dan faktor rho adalah dua faktor penting untuk transkripsi bakteri.
- Keduanya hanya ada pada prokariota.
- Mereka adalah protein yang terdiri dari asam amino.
- Keduanya adalah protein pengikat asam nukleat.
- Prokariota sangat bergantung pada faktor-faktor ini untuk menghasilkan mRNA yang dapat membuat protein khusus dan membantu mereka merespons lingkungan mereka secara spesifik.
Apa Perbedaan Antara Faktor Sigma dan Faktor Rho?
Sigma factor adalah protein yang dibutuhkan untuk inisiasi transkripsi pada bakteri, sedangkan faktor rho adalah protein yang dibutuhkan untuk terminasi transkripsi pada bakteri. Jadi, inilah perbedaan utama antara faktor sigma dan faktor rho. Selanjutnya, faktor sigma adalah protein pengikat DNA, sedangkan faktor rho adalah protein pengikat RNA.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara faktor sigma dan faktor rho dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Faktor Sigma vs Faktor Rho
Transkripsi adalah proses di mana informasi dalam DNA disalin ke dalam molekul baru yang disebut mRNA (messenger RNA). M-RNA ini akhirnya terlibat dalam memproduksi protein tertentu. Faktor sigma dan faktor rho adalah dua faktor penting untuk transkripsi bakteri. Mereka adalah protein. Faktor sigma berpartisipasi dalam inisiasi transkripsi pada bakteri. Faktor Rho bertanggung jawab atas penghentian transkripsi pada bakteri. Jadi, ini adalah ringkasan perbedaan antara faktor sigma dan faktor rho.
