Perbedaan utama antara intron grup I dan grup II adalah bahwa pada intron grup I, reaksi penyambungan diprakarsai oleh kofaktor guanosin, sedangkan pada intron grup II, reaksi penyambungan diprakarsai oleh adenosin internal.
Pre-mRNA adalah transkrip utama yang memiliki intron dan ekson. Pra-mRNA harus diubah menjadi mRNA sebelum diterjemahkan. Penyambungan RNA atau penyambungan pra-mRNA adalah salah satu modifikasi pasca-transkripsi. Dalam penyambungan RNA, intron dikeluarkan dari molekul pra-mRNA, dan ekson bergabung bersama. Intron Grup I dan Grup II adalah intron self-splicing. Mereka berpisah dari molekul pra-mRNA tanpa bantuan enzim lain. Oleh karena itu, mereka adalah enzim RNA atau ribozim yang mengkatalisis penyambungan mereka sendiri dari pra-mRNA. Selain itu, mereka memiliki kemampuan untuk berfungsi sebagai elemen seluler. Selama penyambungan, serangkaian reaksi trans-esterifikasi berlangsung untuk memotong intron dan mengikat ekson. Ribozymes ini hadir di ketiga domain, termasuk bakteri, archaea dan eukariota.
Apa itu Intron Grup I?
Intron kelompok I adalah jenis ribozim penyambungan sendiri yang ditemukan pada bakteri, bakteriofag, dan eukariota (genom organel dan inti). Mereka ditemukan dalam gen esensial. Mereka mampu mengkatalisis penyambungan mereka sendiri dari molekul pra-mRNA. Intron kelompok I mungkin memiliki beberapa ratus hingga tiga ribu nukleotida. Selain itu, mereka menunjukkan sedikit kesamaan urutan di seluruh organisme.
Gambar 01: Intron Grup I
Struktur sekunder sangat terpelihara di empat wilayah pendek. Ada dua langkah reaksi transesterifikasi penyambungan. Intron golongan I memulai mekanisme penyambungan dengan serangan nukleofilik dari 3' hidroksil dari kofaktor Guanosine di situs sambungan 5P.
Apa itu Intron Grup II?
Intron kelompok II adalah jenis intron penyambungan diri yang ditemukan pada organisme yang termasuk dalam ketiga domain. Mereka adalah ribozim yang mengkatalisis reaksi penyambungan mereka sendiri dari pra-mRNA. Mereka ditemukan di rRNA, tRNA dan gen penyandi protein. Tetapi mereka tidak ditemukan dalam genom nuklir, tidak seperti intron kelompok I.
Gambar 02: Intron Grup II
Intron kelompok II mengkatalisis penyambungan melalui dua langkah transesterifikasi yang mirip dengan intron kelompok I. Enzim-enzim ini memulai reaksi penyambungan dengan serangan nukleofilik 2′ OH dari adenosin situs cabang pada sambungan sambungan 5′. Selama reaksi penyambungan, intron kelompok II membentuk struktur seperti lariat. Selain itu, penyambungan intron terjadi tanpa adanya GTP.
Apa Persamaan Antara Intron Grup I dan Grup II?
- Intron kelompok I dan kelompok II adalah dua jenis enzim RNA, ribozim yang mengkatalisis penyambungan mereka sendiri dengan mekanisme yang berbeda.
- Mereka adalah ribozim besar.
- Keduanya ditemukan di ketiga domain.
- Mereka adalah elemen seluler.
- Selain itu, mereka ditemukan di rRNA, tRNA dan gen penyandi protein.
- Kedua enzim digunakan sebagai alat dalam bioteknologi dan kedokteran molekuler untuk sistem knock-out/knock-down gen yang ditargetkan, pengiriman gen atau sistem terapi gen.
Apa Perbedaan Antara Intron Grup I dan Grup II?
Intron kelompok I adalah ribozim yang ditemukan pada bakteri, bakteriofag, dan genom organel dan inti eukariotik. Intron kelompok II adalah ribozim yang ditemukan pada bakteri, archaea, dan organel eukariotik. Selain itu, intron kelompok I memulai reaksi penyambungan dengan serangan nukleofilik dari 3′ hidroksil dari kofaktor guanosin di situs sambungan 5P sementara intron kelompok II memulai reaksi penyambungan dengan serangan nukleofilik dari 2′ OH dari situs cabang adenosin pada sambungan sambungan 5′. Jadi, inilah perbedaan utama antara intron grup I dan grup II.
Selanjutnya, intron kelompok II membentuk struktur seperti lariat selama penyambungan sedangkan intron kelompok I tidak terbentuk. Jadi, ini adalah perbedaan signifikan lainnya antara intron grup I dan grup II. Selain itu, intron kelompok I ditemukan pada genom nuklir eukariotik sedangkan intron kelompok II tidak ditemukan pada genom nuklir eukariotik.
Di bawah infografis daftar perbedaan antara intron grup I dan grup II dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Grup I vs Grup II Intron
Intron kelompok I dan II adalah ribozim besar yang mengkatalisis reaksi transesterifikasi untuk memisahkan intron dari transkrip primer. Mereka ditemukan di ketiga domain. Mereka berdua adalah elemen genetik seluler. Selain itu, mereka digunakan sebagai alat dalam bioteknologi dan kedokteran molekuler. Namun, intron kelompok I memulai reaksi penyambungan dengan serangan nukleofilik dari 3′ OH dari kofaktor guanosin di situs sambungan 5P. Tetapi, intron kelompok II memulai reaksi penyambungan dengan serangan nukleofilik 2′ OH dari adenosin situs cabang pada sambungan sambungan 5′. Selain itu, intron grup II membentuk struktur seperti lariat selama penyambungan sementara intron grup I tidak membentuk struktur seperti lariat. Demikian ringkasan perbedaan intron golongan I dan golongan II.
