Perbedaan utama antara CDS dan cDNA adalah bahwa CDS atau urutan pengkodean adalah bagian dari transkrip yang sebenarnya diterjemahkan menjadi protein sedangkan urutan cDNA adalah urutan DNA yang diturunkan dari mRNA dengan transkripsi terbalik.
Gen adalah urutan nukleotida yang mengkode protein. Ini terdiri dari daerah yang berbeda sebagai daerah promotor, situs inisiasi transkripsi, ekson, kodon start, intron dan kodon stop. Oleh karena itu, gen memiliki urutan pengkodean dan nonkode. Urutan pengkodean atau CDS mengacu pada ekson dan dua kodon, yaitu kodon start dan kodon stop. Ini adalah urutan yang sebenarnya diterjemahkan menjadi protein. Sebaliknya, cDNA adalah urutan DNA yang diturunkan dari mRNA melalui transkripsi balik.
Apa itu CDS?
CDS atau coding sequence adalah bagian dari gen yang sebenarnya diterjemahkan menjadi protein. Ini terdiri dari ekson dan dua kodon sebagai kodon AUG dan kodon stop. Tidak seperti cDNA, CDS tidak mengandung dua daerah yang tidak diterjemahkan: 5’ UTR dan 3” UTR. Selain itu, intron tidak termasuk dalam CDS.
Gambar 01: Urutan Pengkodean
Jika dibandingkan dengan seluruh genom dan satu individu, urutan pengkodean adalah sebagian kecil. Urutan pengkodean terdiri dari urutan nukleotida yang diperlukan untuk membuat urutan asam amino protein.
Apa itu cDNA?
cDNA atau DNA komplementer adalah urutan DNA yang dihasilkan dari urutan mRNA. Ini disintesis oleh proses yang disebut transkripsi terbalik. Enzim reverse transcriptase mengkatalisis sintesis cDNA, dan urutan mRNA bertindak sebagai cetakan untuk sintesis cDNA. Pada dasarnya, mRNA sel eukariotik dapat diekstraksi dan dimurnikan untuk membuat cDNA. Setelah membangun cDNA dari mRNA, mereka kemudian dapat dikloning ke dalam sel bakteri untuk membuat perpustakaan cDNA. Pustaka cDNA penting untuk analisis daerah pengkodean, fungsi gen dan ekspresi gen, dll.
Gambar 02: cDNA
Tidak seperti urutan pengkodean, cDNA berisi dua UTR, yaitu 3' UTR dan 5' UTR. Mirip dengan urutan pengkodean, cDNA tidak mengandung intron.
Apa Persamaan Antara CDS dan cDNA?
- CDS dan cDNA adalah asam nukleat.
- Mereka terbuat dari deoksiribonukleotida.
- Baik CDS dan CDNA tidak mengandung intron, yang merupakan daerah noncoding.
- Keduanya mengandung kode atau informasi genetik untuk menghasilkan protein.
Apa Perbedaan CDS dan cDNA?
CDS atau coding sequence adalah bagian dari gen yang sebenarnya diterjemahkan menjadi protein. Di sisi lain, urutan cDNA adalah urutan DNA yang berasal dari mRNA dengan transkripsi terbalik. Jadi, inilah perbedaan utama antara CDS dan cDNA. Selain itu, CDS terdiri dari ekson dan dua kodon, yaitu kodon start dan kodon stop. Sebaliknya, cDNA terdiri dari urutan mRNA lengkap dan dua UTR.
Selain itu, sintesis cDNA dilakukan secara artifisial dari mRNA dengan transkripsi terbalik sedangkan CDS ditemukan dalam DNA genom.
Infografik di bawah ini menunjukkan lebih banyak perbandingan untuk membedakan antara CDS dan cDNA.
Ringkasan – CDS vs cDNA
Urutan pengkodean dan cDNA adalah dua jenis urutan nukleotida. Urutan pengkodean terletak di dalam gen sementara cDNA disintesis secara artifisial. Urutan pengkodean memiliki ekson dan dua kodon sedangkan cDNA memiliki urutan mRNA dan dua UTR. Baik CDS dan cDNA hanya memiliki urutan nukleotida yang benar-benar diterjemahkan menjadi protein. Mereka tidak mengandung intron. Tidak seperti CDS, proses sintesis cDNA membutuhkan enzim reverse transcriptase. Juga, cDNA dapat dikonversi menjadi perpustakaan cDNA. Jadi, ini merangkum perbedaan antara CDS dan cDNA.
