Perbedaan utama antara elektroforesis gel 1D dan 2D adalah sifat yang digunakan untuk pemisahan protein pada elektroforesis gel. Elektroforesis gel 1D hanya memisahkan protein berdasarkan berat molekulnya sedangkan elektroforesis gel 2D memisahkan protein berdasarkan titik isoelektrik dan berat molekulnya.
Pemisahan protein dengan elektroforesis gel merupakan teknik penting untuk mengkarakterisasi protein. Protein memiliki sifat yang bervariasi; Oleh karena itu, pemisahan lebih kompleks dibandingkan dengan pemisahan DNA dengan elektroforesis gel Agarosa.
Apa itu Elektroforesis Gel 1D?
1D Gel Elektroforesis, juga dikenal sebagai elektroforesis gel satu dimensi, adalah metode pemisahan protein berdasarkan berat molekul. Pemisahan protein terutama terjadi menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida. Berdasarkan konsep elektroforesis gel, molekul terpisah berdasarkan berat molekul dan muatannya.
Oleh karena itu, untuk memberikan muatan yang seragam pada protein, perlakuan Sodium dodesil sulfat (SDS) dilakukan sebelum elektroforesis gel. SDS mendenaturasi protein dan memberikan muatan negatif yang seragam pada protein; ketika penerapan medan listrik terjadi, protein bermigrasi ke terminal positif berdasarkan berat molekulnya. Jadi, dalam pemisahan, hanya satu properti yang dipertimbangkan. Inilah sebabnya mengapa metode ini disebut sebagai elektroforesis gel 1D.
Gambar 01: Elektroforesis Gel 1D
Selama elektroforesis gel 1D, protein dipisahkan berdasarkan berat molekulnya. Dalam hal ini, molekul dengan berat lebih rendah bermigrasi lebih cepat dalam gel dibandingkan dengan protein dengan berat molekul tinggi. Dengan demikian, protein berbobot tinggi tetap dekat dengan sumur.
Apa itu Elektroforesis Gel 2D?
2D gel elektroforesis atau elektroforesis gel dua dimensi memisahkan protein berdasarkan dua sifat. Kedua sifat tersebut adalah titik isoelektrik protein dan berat molekul. Metode pemisahan protein ini meningkatkan resolusi pemisahan protein. Titik iso-listrik protein tergantung pada pH di mana protein netral.
Gambar 02: Elektroforesis Gel 2D
Jadi, dalam elektroforesis gel 2D, protein dibiarkan berjalan pada gradien pH tetap di dimensi pertama. Pada dimensi kedua, protein dipisahkan menggunakan elektroforesis gel poliakrilamida vertikal atau horizontal. Dengan demikian, protein terpisah menurut berat molekulnya di dimensi kedua.
Selain itu, metode elektroforesis gel ini meningkatkan resolusi pemisahan protein. Oleh karena itu, protein yang dipisahkan lebih murni. Namun, biaya teknik ini jauh lebih tinggi daripada elektroforesis gel satu dimensi.
Apa Persamaan Elektroforesis Gel 1D dan 2D?
- Kedua teknik memisahkan protein.
- Oleh karena itu, mereka penting dalam mengkarakterisasi protein.
Apa Perbedaan Elektroforesis Gel 1D dan 2D?
Perbedaan utama antara elektroforesis gel 1D dan 2D adalah bahwa elektroforesis gel 1D memisahkan protein hanya berdasarkan berat molekul sedangkan elektroforesis gel 2D memisahkan protein berdasarkan titik iso-listrik dan berat molekul. Karena perbedaan mendasar antara elektroforesis gel 1D dan 2D ini, resolusi pemisahan protein dan biaya kedua teknik juga bervariasi. Elektroforesis gel 2D menunjukkan resolusi yang lebih tinggi daripada elektroforesis gel 1D. Namun, elektroforesis gel 2D lebih mahal daripada elektroforesis gel 1D.
Di bawah infografis merangkum perbedaan antara elektroforesis gel 1D dan 2D.
Ringkasan – Elektroforesis Gel 1D vs 2D
Pemisahan protein bergantung pada banyak faktor. Elektroforesis gel 1D memisahkan protein hanya berdasarkan berat molekul. Namun, elektroforesis gel dua dimensi atau 2D meningkatkan resolusi pemisahan protein. Selanjutnya, elektroforesis gel 2D memisahkan protein berdasarkan titik isoelektrik dan berat molekul. Oleh karena itu, data ini penting untuk pemrosesan hilir protein dan di bidang proteomik. Demikian ringkasan perbedaan elektroforesis gel 1D dan 2D.
