Perbedaan Kunci – Elektroforesis Kapiler vs Elektroforesis Gel
Elektroforesis adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan biomolekul berdasarkan muatan partikel, ukuran partikel, dan bentuk partikel. Migrasi molekul, yang dikenal sebagai mobilitas elektroforesis, tergantung pada jenis polimer/gel yang digunakan, ukuran porinya, tegangan yang diberikan, waktu berjalan dan rasio permukaan terhadap volume. Ada berbagai jenis teknik elektroforesis berdasarkan jenis biomolekul yang digunakan. Jenis elektroforesis pertama yang ditemukan adalah elektroforesis kertas dimana kertas nitroselulosa digunakan sebagai media untuk pemisahan biomolekul. Prinsip elektroforesis gel di mana gel ukuran pori yang berbeda digunakan untuk memisahkan biomolekul, ditemukan kemudian. Teknik elektroforesis gel dimodifikasi lebih lanjut untuk meningkatkan akurasi teknik, dan salah satu modifikasi tersebut adalah elektroforesis kapiler. Perbedaan utama antara elektroforesis kapiler dan elektroforesis gel adalah elektroforesis gel dilakukan pada bidang vertikal atau horizontal menggunakan gel polimer dengan ukuran pori standar sedangkan elektroforesis kapiler dilakukan dalam tabung kapiler dengan cairan polimer atau gel.
Apa itu Elektroforesis Gel?
Gel elektroforesis adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan terutama asam nukleat, protein atau asam amino berdasarkan muatan, ukuran, dan bentuknya. Teknik ini menggunakan gel fisik, yang merupakan zat polimer, sebagai media pemisahan. Gel yang paling umum digunakan adalah Agarose (untuk pemisahan asam nukleat) dan Polyacrylamide (untuk pemisahan protein). Peralatan elektroforesis gel berisi baki pengecoran gel untuk menyiapkan gel, sisir tuang untuk menyiapkan sumur, tangki penyangga, elektroda – positif (anoda) dan negatif (katoda) dan unit suplai tegangan. Molekul seperti DNA atau RNA, yang bermuatan negatif, bergerak dari katoda ke anoda dan molekul yang bermuatan positif bergerak sebaliknya. Pembuatan gel dilakukan sesuai kebutuhan. Jika resolusi tinggi atau pemisahan molekul diperlukan, gel konsentrasi tinggi dengan ukuran pori yang lebih kecil harus disiapkan. Molekul yang dipisahkan pada matriks gel diamati setelah teknik pewarnaan. Molekul yang terpisah muncul sebagai pita pada matriks gel.
Gambar 01: Elektroforesis Gel
Gel elektroforesis digunakan dalam diagnostik molekuler seperti sidik jari DNA untuk menentukan keberadaan fragmen DNA/RNA tertentu atau protein. Elektroforesis gel juga menentukan kemurnian sampel biomolekul yang diekstraksi. Elektroforesis gel dilakukan sebagai langkah awal untuk in dan hibridisasi dan sebagai analisis konfirmasi setelah sekuensing.
Apa itu Elektroforesis Kapiler?
Elektroforesis kapiler adalah modifikasi dari elektroforesis gel yang menggunakan prinsip pemisahan yang sama berdasarkan muatan, ukuran molekul, tetapi dilakukan dalam tabung kapiler dengan zat gel atau polimer cair. Kapiler dibuat dari silika leburan, dan setiap tabung kapiler memiliki diameter dalam 50-100μm dan panjang 25-100cm. Sampel disuntikkan ke dalam tabung kapiler yang berisi bahan polimer dan dipisahkan jauh lebih cepat daripada elektroforesis gel konvensional. Sistem kapiler terlindung dengan baik di dalam jaket isolator yang melindungi sampel dari kontaminasi apa pun. Kapiler dapat diisi dengan polimer cair seperti hidroksietil selulosa atau gel resolusi tinggi seperti poliakrilamida. Elektroforesis kapiler memberikan resolusi yang lebih besar; maka pemisahan lebih akurat. Elektroforesis kapiler menggunakan sistem detektor otomatis melalui analisis spektrofotometri. Ini karena rasio luas permukaan terhadap volume yang lebih tinggi.
Gambar 02: Elektroforesis Kapiler
Elektroforesis kapiler digunakan dalam situasi seperti dalam forensik di mana akurasi yang lebih tinggi diperlukan dan tidak umum digunakan karena merupakan teknik yang mahal.
Apa Persamaan Antara Elektroforesis Kapiler dan Elektroforesis Gel?
- Pemisahan molekul pada kedua teknik didasarkan pada muatan dan ukuran molekul.
- Kedua teknik dapat digunakan untuk memisahkan asam nukleat dan protein.
- Volume sampel kedua teknik sama.
- Kedua teknik menggunakan buffer untuk memfasilitasi pemisahan.
Apa Perbedaan Elektroforesis Kapiler dan Elektroforesis Gel?
Elektroforesis Kapiler vs Elektroforesis Gel |
|
Elektroforesis kapiler adalah teknik pemisahan biomolekul pada tabung kapiler menggunakan media polimer cair atau gel. | Gel elektroforesis adalah teknik pemisahan biomolekul pada bidang vertikal atau horizontal menggunakan media gel polimer. |
Pemisahan | |
Dalam elektroforesis kapiler, pemisahan dilakukan di dalam tabung kapiler. | Dalam elektroforesis gel, pemisahan dilakukan pada bidang vertikal atau horizontal. |
Media Pemisahan | |
Polimer cair seperti hidroksietilselulosa digunakan dalam elektroforesis kapiler. | Gel, baik agarosa atau poliakrilamida, digunakan sebagai media dalam elektroforesis gel. |
Cross Linkage | |
Resolusi tinggi dapat diperoleh dari elektroforesis kapiler. | Resolusi rendah dalam elektroforesis gel. |
Rasio Luas Permukaan terhadap Volume | |
Rasio permukaan terhadap volume tinggi dalam elektroforesis kapiler. | Rasio permukaan terhadap volume rendah dalam elektroforesis gel. |
Teknik Deteksi | |
Deteksi dilakukan melalui detektor otomatis spektrofotometri dalam elektroforesis kapiler. | Pewarnaan dan pengamatan melalui UV transilluminator dilakukan sebagai teknik deteksi dalam elektroforesis gel. |
Ringkasan – Elektroforesis Kapiler vs Elektroforesis Gel
Diagnosis molekuler memainkan peran utama dalam dunia ilmiah. Identifikasi dan pemurnian DNA, RNA, dan Protein merupakan langkah penting dalam prosedur diagnostik. Elektroforesis adalah teknik yang memisahkan dan mengidentifikasi biomolekul dalam elektroforesis gel dan elektroforesis gel kapiler yang jauh lebih maju. Elektroforesis gel dilakukan dalam bidang vertikal atau horizontal menggunakan gel polimer dengan ukuran pori standar sedangkan elektroforesis kapiler dilakukan dalam tabung kapiler dengan cairan polimer atau gel. Inilah perbedaan antara elektroforesis kapiler dan elektroforesis gel. Setelah menyelesaikan teknik elektroforesis, biomolekul diproses lebih lanjut untuk mendapatkan informasi tingkat yang lebih tinggi melalui hibridisasi atau melalui teknik seperti sidik jari.
Download Versi PDF Elektroforesis Kapiler vs Elektroforesis Gel
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara Elektroforesis Gel dan Elektroforesis Kapiler.