Perbedaan utama antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah bahwa elektroforesis gel agarosa menggunakan gel agarosa yang dituangkan secara horizontal untuk memisahkan fragmen DNA yang relatif lebih besar, sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida menggunakan gel poliakrilamida yang dituangkan secara vertikal untuk memisahkan fragmen asam nukleat yang lebih pendek.
Elektroforesis adalah jenis teknik yang menggunakan medan listrik yang diterapkan melintasi matriks gel untuk memisahkan biomolekul seperti DNA, RNA, dan protein. Pemisahan biomolekul seperti DNA, RNA, dan protein melalui elektroforesis didasarkan pada muatan dan ukuran. Sampel dimasukkan ke dalam sumur gel. Kemudian, medan listrik diterapkan di seluruh gel. Medan menyebabkan molekul bermuatan negatif bergerak menuju elektroda positif. Matriks gel bertindak sebagai saringan molekuler di mana molekul terkecil lewat atau bergerak dengan cepat sementara molekul yang lebih besar bergerak perlahan. Hal ini memungkinkan pemisahan molekul berdasarkan muatan dan ukuran. Oleh karena itu, elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah dua jenis teknik elektroforesis gel yang terutama membantu memisahkan molekul berdasarkan ukuran dan muatannya.
Apa itu Elektroforesis Gel Agarosa?
Elektroforesis gel agarosa adalah teknik yang menggunakan gel agarosa untuk memisahkan biomolekul seperti DNA dan RNA. Ini adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan asam nukleat terutama berdasarkan ukuran. Senyawa utama yang disebut agarosa yang digunakan dalam teknik ini adalah polisakarida. Itu berasal dari rumput laut. Agarosa dapat dilarutkan dalam buffer mendidih dan kemudian dapat dituangkan ke dalam nampan yang disimpan secara horizontal. Di baki, itu menjadi padat ketika mendingin untuk membentuk lempengan. Gel agarosa dituangkan dengan sisir di tempat untuk membuat sumur di mana asam nukleat seperti DNA atau RNA dimuat setelah gel mengeras.
Gambar 01: Elektroforesis Gel Agarosa
Gel kemudian direndam dalam buffer yang sesuai, dan arus dialirkan ke seluruh gel. DNA memiliki muatan negatif seragam yang tidak tergantung pada komposisi urutan molekul. Oleh karena itu, molekul DNA akan bermigrasi dari katoda (-) menuju anoda (+). Laju migrasi secara langsung tergantung pada ukuran molekul. Makromolekul terbesar memiliki waktu yang paling sulit untuk menavigasi melalui gel. Di sisi lain, makromolekul yang lebih kecil menyelinap melalui gel dengan cepat dan cukup mudah.
Apa itu Elektroforesis Gel Poliakrilamida?
Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) adalah teknik yang menggunakan gel poliakrilamida untuk memisahkan biomolekul. Ini adalah teknik yang banyak digunakan untuk memisahkan makromolekul biologis, biasanya protein dan asam nukleat, menurut mobilitas elektroforesisnya. Hidrasi akrilonitril menghasilkan pembentukan molekul akrilamida oleh nitril hidratase. Akrilamida larut dalam air, dan pada penambahan inisiator radikal bebas, akrilamida berpolimerisasi, menghasilkan pembentukan gel poliakrilamida. Biasanya, peningkatan konsentrasi akrilamida menyebabkan penurunan ukuran pori dalam gel. Gel poliakrilamida dituangkan secara vertikal, tidak seperti gel agarosa.
Gambar 02: Elektroforesis Gel Poliakrilamida
Dalam elektroforesis gel poliakrilamida, molekul dapat berjalan dalam keadaan aslinya, mempertahankan struktur molekul tingkat tinggi. Metode ini disebut PAGE asli. Atau, denaturan kimia juga dapat ditambahkan untuk menghilangkan struktur tingkat tinggi dan mengubah molekul menjadi molekul tidak terstruktur yang mobilitasnya hanya bergantung pada panjangnya. Jenis ini disebut SDS-PAGE.
Apa Persamaan Antara Elektroforesis Gel Agarosa dan Poliakrilamida?
- Elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah dua jenis teknik elektroforesis gel.
- Sebenarnya, itu adalah teknik biologi molekuler.
- Kedua teknik tersebut digunakan untuk mendeteksi makromolekul biologis seperti DNA dan protein.
- Teknik ini dilakukan oleh teknisi atau peneliti yang ahli.
- Dalam kedua teknik, pemisahan makromolekul didasarkan pada muatan dan ukurannya.
- Kedua teknik memungkinkan pemisahan asam nukleat seperti DNA dan RNA.
Apa Perbedaan Elektroforesis Gel Agarosa dan Gel Poliakrilamida?
Elektroforesis gel agarosa adalah teknik yang menggunakan gel agarosa yang dituangkan secara horizontal untuk memisahkan biomolekul, sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida adalah teknik yang menggunakan gel poliakrilamida yang dituangkan secara vertikal untuk memisahkan biomolekul. Ini adalah perbedaan utama antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida. Selanjutnya elektroforesis gel agarosa digunakan untuk pemisahan DNA dan RNA, sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida digunakan untuk pemisahan asam nukleat seperti DNA, RNA, atau protein.
Tabel berikut merangkum perbedaan antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida.
Ringkasan – Agarose vs Elektroforesis Gel Poliakrilamida
Elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida adalah dua jenis teknik elektroforesis gel yang digunakan di laboratorium biologi molekuler. Elektroforesis gel agarosa menggunakan gel agarosa untuk memisahkan biomolekul. Agarosa umumnya tidak beracun bagi manusia, sedangkan poliakrilamida beracun bagi manusia. Selain itu, elektroforesis gel agarosa menunjukkan resolusi yang rendah sedangkan elektroforesis gel poliakrilamida menunjukkan resolusi yang lebih tinggi. Elektroforesis gel poliakrilamida menggunakan gel poliakrilamida untuk memisahkan biomolekul. Ini merangkum perbedaan antara elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida
