Agarose vs Polyacrylamide
Agarose dan Polyacrylamide keduanya merupakan polimer yang larut dalam air tetapi, di antara keduanya, banyak perbedaan yang dapat dilihat, mulai dari asalnya. Baik Agarose dan Polyacrylamide memiliki kesamaan dalam kemampuannya untuk membentuk matriks gel berpori. Meskipun demikian, ada sejumlah perbedaan yang jelas antara keduanya. Perbedaan utama antara kedua polimer ini terletak pada sifat asalnya, struktur kimianya, kegunaannya yang berbeda, dan kinerjanya dalam hal elektroforesis gel.
Apa itu Agarose?
Agarosa adalah polimer linier alami yang diturunkan dari polimer kompleks yang disebut agar yang ditemukan dalam rumput laut. Agarosa diekstraksi dari agar dengan menghilangkan komponen proteinnya yang disebut agaropektin. Agarose inilah yang memberi agar-agar kemampuannya untuk membentuk gel.
Penggunaan utama agarosa adalah dalam studi biologi mikrobiologi dan molekuler. Dalam studi mikrobiologi, agarosa, ketika dilengkapi dengan nutrisi yang sesuai, memberikan dasar yang kuat untuk menumbuhkan mikroorganisme seperti bakteri dan jamur. Ketika digunakan pada konsentrasi semi-padat, dapat berguna dalam menilai motilitas mikroorganisme ini. Dalam biologi molekuler, ini berfungsi sebagai alat penting untuk salah satu proses resolusi paling mendasar yang disebut 'elektroforesis gel' atau 'elektroforesis gel agarosa' (AGE). Elektroforesis gel adalah proses yang memungkinkan resolusi atau pemisahan asam nukleat atau protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Di sini, agarosa berfungsi sebagai gel seperti saringan berpori yang melaluinya pemisahan terjadi.
Struktur Agarosa
Apa itu Poliakrilamida?
Polyacrylamide adalah polimer sintetis dan digunakan di berbagai industri. Seperti disebutkan sebelumnya, penggunaannya bergantung pada kemampuannya untuk membentuk gel. Namun, selain itu, kemampuannya untuk menahan dan mengalirkan air pada konsentrasi yang berbeda juga dimanfaatkan di berbagai industri.
Penggunaan poliakrilamida yang paling luas dan umum adalah dalam pengolahan air limbah. Di sini, digunakan sebagai agen flokulasi untuk menghilangkan bahan organik tersuspensi; karenanya, meningkatkan kekeruhan dan menjernihkan air. Penggunaan lain dari poliakrilamida adalah dalam industri kertas. Di sini, digunakan untuk menahan atau mengalirkan air dari bubur kertas sesuai kebutuhan. Demikian pula dalam industri pertanian dan konstruksi, digunakan sebagai kondisioner tanah untuk mencegah erosi tanah dan meningkatkan kualitasnya.
Seperti agarosa, poliakrilamida juga digunakan dalam biologi molekuler sebagai alat resolusi penting dalam proses serupa yang disebut 'elektroforesis gel poliakrilamida' (PAGE). Selain semua ini, Poliakrilamida juga digunakan dalam pemrosesan bijih dan pembuatan zat pengflokulasi untuk menghilangkan bahan organik tersuspensi; karenanya, meningkatkan kekeruhan dan menjernihkan air. Penggunaan lain dari poliakrilamida adalah dalam industri kertas. Di sini, digunakan untuk menahan atau mengalirkan air dari bubur kertas sesuai kebutuhan. Demikian pula dalam industri pertanian dan konstruksi, digunakan sebagai kondisioner tanah untuk mencegah erosi tanah dan meningkatkan kualitasnya. Selain semua ini, Poliakrilamida juga digunakan dalam pembuatan bahan tambahan makanan, lensa kontak lunak, dan tekstil.
Struktur Poliakrilamida
Apa perbedaan antara Agarosa dan Poliakrilamida?
Asal Agarosa dan Poliakrilamida:
Agarose: Agarose adalah polimer yang berasal dari alam. Ini berasal dari rumput laut.
Polyacrylamide: Polyacrylamide berasal dari sintetis dan tidak ditemukan dalam keadaan alami apa pun.
Rumus Molekul Agarosa dan Poliakrilamida:
Agarosa: Rumus molekul agarosa adalah C24H38O19.
Poliakrilamida: Rumus molekul poliakrilamida adalah (C 3H5NO)n.
Struktur Kimia Agarosa dan Poliakrilamida:
Agarosa: Agarosa adalah polisakarida linier. Ini terdiri dari unit disakarida berulang yang disebut agrobiosa yang disatukan oleh ikatan hidrogen.
Poliakrilamida: Poliakrilamida adalah polimer ikatan silang secara kimia. Ini terdiri dari monomer akrilamida dan zat pengikat silang N, N'-metilenbisakrilamida.
Toksisitas Agarosa dan Poliakrilamida:
Agarosa: Baik agarosa dan unit monomernya agrobiosa tidak beracun di alam.
Poliakrilamida: Unit monomer poliakrilamida, akrilamida, diduga karsinogen dan dikenal sebagai neurotoksin, sedangkan bentuk polimerisasinya tidak beracun.
Karakteristik Gel Agarosa dan Poliakrilamida:
AGE dan HALAMAN:
Agarose: Persiapan gel agarosa untuk AGE lebih sedikit memakan waktu, mudah dan sederhana, dan tidak memerlukan inisiator atau katalis polimerisasi.
Poliakrilamida: Persiapan gel poliakrilamida untuk PAGE memakan waktu dan melelahkan dan juga membutuhkan inisiator (amonium persulfat) dan katalis polimerisasi (N, N, N', N'-tetramethylethylendiamine – TEMED).
Alam:
Gel poliakrilamida secara kimiawi lebih stabil daripada gel agarosa.
Ukuran Pori:
Dengan konsentrasi yang sama, matriks gel poliakrilamida cenderung memiliki ukuran pori yang lebih kecil dibandingkan matriks gel agarosa.
Mengubah Ukuran Pori:
Ukuran pori gel poliakrilamida dapat diubah dengan cara yang lebih terkontrol daripada gel agarosa.
Kekuatan Menyelesaikan:
Gel poliakrilamida memiliki daya pisah yang tinggi sedangkan gel agarosa memiliki daya pisah yang rendah.
Menampung Asam Nukleat:
Gel poliakrilamida dapat menampung asam nukleat dalam jumlah yang lebih besar daripada gel agarosa untuk sarana resolusi.
