Perbedaan Kunci – VNTR vs STR
Studi DNA memiliki kegunaan yang sangat besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik, dan memetakan genom organisme. Beberapa teknik yang terkait dengan analisis DNA digunakan untuk identifikasi gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenal sebagai penanda genetik. Penanda genetik digunakan dalam biologi molekuler untuk mengidentifikasi variasi genetik antara individu dan spesies. Variable number tandem repeat (VNTR) dan short tandem repeat (STR) adalah dua jenis penanda genetik yang menunjukkan polimorfisme antar individu. Kedua jenis tersebut adalah DNA berulang noncoding yang merupakan pengulangan tandem. Mereka diatur dalam mode kepala ke ekor dalam kromosom. VNTR adalah bagian dari genom di mana urutan nukleotida pendek diulang beberapa kali. STR adalah bagian lain dari DNA dalam genom yang diatur sebagai unit berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas nukleotida dalam ratusan kali. Perbedaan utama antara VNTR dan STR adalah jumlah nukleotida dalam urutan berulang. Unit berulang VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida sedangkan unit berulang STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. VNTR dan STR digunakan secara luas dalam studi forensik.
Apa itu VNTR?
Tandem repeat adalah urutan pendek DNA yang diulang secara head to tail pada lokus kromosom tertentu. Tidak ada urutan atau nukleotida lain dalam pengulangan tandem. Ada beberapa jenis pengulangan tandem dalam genom. VNTR adalah jenis pengulangan tandem di antara mereka yang memiliki unit berulang yang terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. VNTR adalah jenis satelit mini. Pengulangan tandem ini dapat ditemukan di banyak kromosom. Mereka diselingi dalam genom manusia dan terletak terutama di daerah subtelomer kromosom.
VNTR menunjukkan polimorfisme pengulangan tandem antar individu. Panjang VNTR di lokasi tertentu dari kromosom sangat bervariasi di antara individu karena variasi jumlah unit berulang yang diatur dalam bagian DNA tersebut. Oleh karena itu, VNTR dapat digunakan sebagai alat yang ampuh dalam identifikasi individu dan analisis VNTR digunakan di banyak bidang termasuk genetika, penelitian biologi, forensik dan sidik jari DNA. VNTR adalah penanda genetik pertama yang digunakan untuk mengukur pencangkokan transplantasi sumsum tulang. VNTR juga merupakan penanda polimorfik pertama yang digunakan dalam pembuatan profil DNA dalam forensik.
Gambar 01: Variasi VNTR pada enam individu
Analisis VNTR dilakukan melalui polimorfisme panjang fragmen restriksi diikuti oleh hibridisasi selatan. Oleh karena itu, dibutuhkan sampel DNA yang relatif besar. Interpretasi profil VNTR juga bermasalah. Karena keterbatasan ini, penggunaan VNTR dalam genetika forensik telah dibatasi dan digantikan oleh analisis STR.
Apa itu STR?
STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang disusun secara tandem. STR mirip dengan VNTR. Tapi itu bervariasi dari VNTR dari jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan jumlah pengulangan. STR adalah jenis mikrosatelit.
Analisis STR terlibat dalam mengukur jumlah pasti unit berulang. STR sangat bervariasi antar individu, mirip dengan VNT. Profil STR berbeda dari orang ke orang. Oleh karena itu, analisis STR digunakan dalam biologi molekuler untuk membandingkan lokus spesifik pada DNA dari dua atau lebih sampel. Oleh karena itu STR dianggap sebagai penanda genetik yang kuat dalam biologi molekuler. Ini menyediakan alat yang sangat baik untuk identifikasi individu karena tingkat polimorfisme yang tinggi dan panjang yang relatif pendek.
Saat ini, STR adalah alat analisis polimorfisme genetik yang paling umum digunakan dalam genetika forensik. Kebanyakan kasus forensik melibatkan analisis polimorfik STR. Lokus STR tersebar di seluruh genom. Ada ribuan STR yang terletak di kromosom yang dapat digunakan dalam analisis forensik. Analisis STR tidak melibatkan polimorfisme panjang restriksi seperti analisis VNTR. Analisis STR tidak memotong DNA dengan enzim restriksi. Probe khusus digunakan untuk menempelkan daerah yang diinginkan pada DNA dan menggunakan teknik PCR, panjang STR ditentukan.
Gambar 02: Variasi STR antar sampel
Apa Persamaan Antara VNTR dan STR?
- VNTR dan STR adalah DNA noncoding.
- Keduanya adalah pengulangan tandem.
- Keduanya menunjukkan polimorfisme antar individu karena perbedaan panjang bagian DNA.
- Keduanya digunakan sebagai penanda genetik yang kuat dalam sidik jari DNA dan dalam studi forensik.
Apa Perbedaan VNTR dan STR?
VNTR vs STR |
|
| VNTR adalah DNA berulang noncoding yang memiliki urutan nukleotida pendek yang berulang secara tandem. | STR adalah bagian DNA yang sangat berulang yang terdiri dari dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang disusun secara tandem. |
| Ukuran | |
| VNTR lebih besar dari STR. | STR lebih kecil dari VNTR. |
| Jumlah Nukleotida dalam Urutan Berulang | |
| Unit berulang VNTR terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. | Unit berulang STR terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. |
Ringkasan – VNTR vs STR
VNTR dan STR adalah dua penanda genetik kuat yang digunakan dalam biologi molekuler, terutama di bidang genetika forensik. VNTR adalah jenis satelit mini dan STR adalah satelit mikro. VNTR dan STR adalah noncoding, DNA yang sangat berulang. Mereka adalah pengulangan tandem. Struktur umum VNTR dan STR adalah sama. Namun, jumlah nukleotida dalam urutan berulang dan panjangnya berbeda. VNTR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 10 hingga 100 nukleotida. STR memiliki urutan berulang yang terdiri dari 2 hingga 13 nukleotida. Inilah perbedaan antara VNTR dan STR.
Unduh Versi PDF VNTR vs STR
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai dengan catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara VNTR dan STR.
