Perbedaan utama antara urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah bahwa urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom pada RNA messenger bakteri dan archaeal, sedangkan urutan Kozak adalah situs inisiasi translasi protein di sebagian besar RNA messenger eukariotik.
Urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah dua urutan konsensus yang sangat penting untuk inisiasi terjemahan. Dalam biologi molekuler, translasi adalah proses dimana ribosom dalam sitoplasma mensintesis protein setelah proses transkripsi. Dalam terjemahan, mRNA (messenger RNA) didekodekan dalam ribosom untuk menghasilkan rantai asam amino tertentu di luar nukleus. Biasanya, ribosom menginduksi proses decoding dengan memfasilitasi pengikatan urutan antikodon tRNA komplementer ke kodon mRNA. Translasi berlangsung dalam tiga tahap: inisiasi, elongasi dan terminasi.
Apa itu Shine Dalgarno Sequence?
Urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom pada RNA messenger bakteri dan archaeal. Hal ini umumnya terletak sekitar 8 basis hulu dari kodon awal AUG. Urutan RNA ini membantu dalam merekrut ribosom ke RNA pembawa pesan dengan menyelaraskan ribosom dengan kodon awal mRNA. Dengan demikian, ia memulai sintesis protein. Setelah perekrutan, tRNA dapat menambahkan asam amino secara berurutan seperti yang ditentukan oleh kodon mRNA. Urutan khusus ini umum pada bakteri tetapi lebih jarang di archaea. Selain itu, ia juga hadir dalam transkrip kloroplas dan mitokondria. Urutan Shine Dalgarno pertama kali diusulkan oleh ilmuwan Australia John Shine dan Lynn Dalgarno. Enam urutan konsensus dasar adalah AGGAGG. Misalnya, pada Escherichia coli urutannya adalah AGGAGGU.
Gambar 01: Urutan Bersinar Dalgarno
Pemilihan situs inisiasi (AUG) tergantung pada interaksi antara subunit 30S ribosom dan template mRNA. Wilayah kaya pirimidin pada komponen 16srRNA dari subunit 30S berikatan dengan wilayah kaya purin yang dikenal sebagai urutan Shine Dalgarno di hulu kodon inisiasi AUG dalam mRNA. Selanjutnya, selama pembentukan kompleks inisiasi, urutan nukleotida komplementer ini berpasangan untuk membentuk struktur RNA untai ganda. Ini memfasilitasi pengikatan mRNA ke ribosom sedemikian rupa sehingga kodon inisiasi ditempatkan di situs P ribosom.
Apa Urutan Kozak?
Urutan Kozak adalah situs inisiasi translasi protein di sebagian besar mRNA eukariotik. Urutan ini juga disebut urutan konsensus Kozak. Urutan Kozak adalah urutan optimal untuk memulai translasi pada eukariota. Urutan ini merupakan aspek integral dari regulasi protein. Ini juga sangat penting untuk kesehatan seluler secara keseluruhan. Ini membantu mengoreksi terjemahan protein dari pesan genetik dengan memediasi perakitan ribosom dan inisiasi terjemahan.
Gambar 02: Urutan Kozak
Urutan ini dinamai menurut ilmuwan yang menemukannya, Marilyn Kozak. Dia menemukannya melalui analisis rinci urutan genom DNA. Barisan Kozak adalah 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. Huruf besar menunjukkan basis yang dipertahankan, sedangkan huruf kecil menunjukkan basis variabel umum. R menunjukkan purin (adenin atau guanin) yang selalu diposisikan di lokasi ini.
Apa Persamaan Antara Shine Dalgarno dan Urutan Kozak?
- Urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah dua urutan konsensus yang sangat penting dalam inisiasi terjemahan.
- Keduanya adalah urutan RNA.
- Subunit ribosom yang lebih kecil mengikat kedua urutan.
- Kedua urutan memediasi perakitan ribosom yang tepat dan inisiasi translasi.
- Mereka adalah aspek integral dari regulasi protein dan kesehatan seluler secara keseluruhan.
Apa Perbedaan Urutan Shine Dalgarno dan Kozak?
Urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom yang ditemukan pada RNA messenger bakteri dan archaeal, sedangkan urutan Kozak adalah situs inisiasi translasi protein yang ditemukan di sebagian besar RNA messenger eukariotik. Jadi, inilah perbedaan utama antara urutan Shine Dalgarno dan Kozak. Selanjutnya, barisan Shine Dalgarno adalah 5’AGGAGGU3’ sedangkan barisan Kozak adalah 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’.
Infografik berikut mencantumkan perbedaan antara deret Shine Dalgarno dan Kozak dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Shine Dalgarno vs Urutan Kozak
Urutan Shine Dalgarno dan Kozak adalah dua urutan RNA konsensus yang sangat penting untuk perakitan ribosom dan inisiasi translasi. Urutan Shine Dalgarno adalah situs pengikatan ribosom di RNA bakteri dan archaeal, sedangkan urutan Kozak adalah situs inisiasi translasi protein di sebagian besar RNA messenger eukariotik. Jadi, ini merangkum perbedaan antara Shine Dalgarno dan urutan Kozak.
