Perbedaan utama antara elemen transposabel kelas I dan kelas II adalah bahwa elemen transposabel kelas I adalah retrotransposon, sedangkan elemen transposabel kelas II adalah transposon DNA.
Sebuah elemen transposable adalah urutan DNA yang dapat mengubah posisinya dalam genom. Terkadang ia menciptakan dan membalikkan mutasi. Itu juga dapat mengubah identitas genetik dan ukuran genom sel. Proses ini sering mengakibatkan duplikasi materi genetik yang sama. Unsur transposable pertama kali ditemukan oleh Barbara McClintock, dan dia memenangkan hadiah Nobel untuk penemuannya pada tahun 1983. Elemen transposable dapat dikategorikan menjadi dua kelas berdasarkan mekanisme transposisinya: elemen transposable kelas I dan kelas II.
Apa itu Elemen Transposable Kelas I?
Elemen transposable Kelas I adalah retrotransposon. Retrotransposon adalah jenis komponen genetik yang menyalin dan menempelkan dirinya ke lokasi genom yang berbeda dengan mengubah RNA kembali menjadi DNA melalui proses yang disebut transkripsi balik. Proses ini dikatalisis oleh enzim reverse transcriptase. Retrotransposon biasanya menggunakan perantara transposisi RNA. Elemen transposable Kelas I biasanya disalin dalam dua tahap. Pertama, mereka ditranskripsi dari DNA ke RNA. Kemudian RNA yang dihasilkan kemudian ditranskripsikan menjadi DNA. Kemudian, DNA yang disalin ini dimasukkan kembali ke dalam genom pada posisi baru. Karakteristik retrotransposon sangat mirip dengan retrovirus seperti HIV.
Gambar 01: Elemen Transposable Kelas I
Retrotransposon dapat dibagi menjadi tiga jenis.
- Retrotransposon dengan pengulangan terminal panjang (LTR), yang mengkode untuk transkriptase balik,
- Retrotransposon dengan long interspersed nuclear elements (LINE) yang mengkode untuk reverse transcriptase tetapi tidak memiliki LTR dan ditranskripsi oleh RNA polimerase II,
- Retrotransposon dengan short interspersed nuclear elements (SINEs) yang tidak mengkode untuk reverse transcriptase dan ditranskripsi oleh RNA polimerase III.
Selain itu, karena mekanisme yang mirip dengan retrotransposon, retrovirus juga dapat dianggap sebagai elemen yang dapat ditransposkan.
Apa itu Elemen Transposable Kelas II?
Elemen transposabel Kelas II adalah transposon DNA. Elemen transposable kelas II memiliki mekanisme transposisi cut and paste yang tidak melibatkan perantara RNA. Transposisi dikatalisis oleh beberapa enzim transposase. Enzim-enzim ini dapat secara spesifik atau non spesifik mengikat DNA. Transposase membuat potongan terhuyung-huyung di situs target DNA yang menghasilkan ujung lengket. Kemudian ini memotong DNA transposon ligates ke situs target lainnya.
Gambar 02: Elemen Transposable Kelas II
Biasanya, DNA polimerase mengisi celah yang dihasilkan dari ujung lengket, dan DNA ligase menutup tulang punggung gula-fosfat. Selain itu, transposisi ini menghasilkan duplikasi situs target. Tempat penyisipan transposon DNA dapat diidentifikasi dengan pengulangan singkat dan langsung diikuti oleh pengulangan terbalik. Tetapi tidak semua transposon DNA menunjukkan mekanisme transposisi cut and paste. Misalnya, beberapa transposon menunjukkan transposisi replikatif di mana transposon mereplikasi dirinya ke situs target baru.
Persamaan Antara Elemen Transposable Kelas I dan Kelas II
- Elemen transposabel Kelas I dan Kelas II adalah elemen genetika bergerak atau gen lompat.
- Keduanya dapat mengubah posisinya dalam genom.
- Mereka terdiri dari urutan DNA.
- Mereka adalah elemen genetik yang egois.
- Mereka sangat penting dalam fungsi genom dan evolusi.
Perbedaan Antara Elemen Transposable Kelas I dan Kelas II
Elemen transposabel kelas I adalah retrotransposon, sedangkan elemen transposabel kelas II adalah transposon DNA. Jadi, inilah perbedaan utama antara elemen transposable kelas I dan kelas II. Selanjutnya, elemen transposable kelas I menggunakan intermediet RNA dalam mekanisme transposisi. Di sisi lain, elemen transposabel kelas II menggunakan intermediet DNA dalam mekanisme transposisi.
Infografik berikut mengkompilasi perbedaan antara elemen transposable kelas I dan kelas II dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Elemen Transposable Kelas I vs Kelas II
Elemen yang dapat dipindahkan dikenal sebagai elemen genetik bergerak atau gen lompat. Mereka adalah urutan DNA. Elemen transposable dikategorikan menjadi dua kelas berdasarkan mekanisme transposisi mereka sebagai elemen transposable kelas I dan kelas II. Elemen transposabel kelas I adalah retrotransposon, sedangkan elemen transposabel kelas II adalah transposon DNA. Jadi, inilah perbedaan utama antara elemen transposable kelas I dan kelas II.
