Perbedaan utama antara situs aktif dan situs pengikatan adalah bahwa situs aktif membantu katalisis reaksi kimia sedangkan situs pengikatan membantu pengikatan ligan ke molekul besar.
Situs pengikatan adalah daerah pada protein, DNA atau RNA, tempat ligan dapat mengikat. Enzim adalah protein. Situs aktif adalah daerah pada enzim yang substrat dapat mengikat untuk menjalani reaksi kimia. Wilayah spesifik ini juga memiliki situs pengikatan bersama dengan situs katalitik. Oleh karena itu, situs pengikatan hanya membantu pengikatan ligan ke molekul besar sedangkan situs aktif membantu pengikatan ligan ke molekul besar sambil membiarkannya menjalani reaksi kimia yang dikatalisis.
Apa itu Situs Aktif?
Situs aktif adalah wilayah pada enzim tempat substrat reaksi kimia terikat untuk menjalani reaksi kimia yang dikatalisis. wilayah ini terdiri dari dua sub-wilayah sebagai situs pengikatan dan situs katalitik. Situs pengikatan mengandung beberapa residu yang dapat membantu pengikatan substrat (reaktan) pada enzim. Situs katalitik membantu dalam mengkatalisis reaksi kimia. Terlebih lagi, wilayah ini sangat kecil jika dibandingkan dengan seluruh volume enzim; sekitar 10-20% dari seluruh volume enzim.
Gambar 01: Situs Pengikat dan Situs Katalitik dari Situs Aktif
Biasanya, situs aktif mengandung 3-4 asam amino. sisa asam amino dalam enzim yang terlibat dalam mempertahankan struktur tersier enzim. Lebih penting lagi, situs aktif memiliki desain khusus yang sesuai dengan substrat tertentu. Oleh karena itu, enzim ini bereaksi hanya dengan substrat tertentu. Tetapi terkadang, enzim membutuhkan kofaktor untuk fungsinya. Fungsi utama situs aktif adalah untuk mengurangi energi aktivasi reaksi kimia, sehingga meningkatkan laju reaksi.
Apa itu Situs Binding?
Situs pengikatan adalah wilayah pada protein, DNA atau RNA yang dapat diikat oleh ligan. Di sana, ligan dapat membentuk ikatan kimia dengan situs ini. Daerah ini menunjukkan kekhususan; ligan tertentu akan mengikat ke situs pengikatan tertentu. Oleh karena itu, situs ini merupakan ukuran jenis ligan yang dapat berikatan dengan molekul.
Selanjutnya, kita sering menggunakan wilayah ini untuk karakterisasi fungsional biomolekul. Misalnya, kita dapat mengkarakterisasi fungsionalitas situs aktif melalui situs pengikatannya. Selain itu, dalam kasus DNA, jenis situs pengikatan spesifik adalah situs pengikatan faktor transkripsi yang ada pada DNA.
Apa Perbedaan Situs Aktif dan Situs Binding?
Situs aktif adalah wilayah pada enzim tempat substrat reaksi kimia terikat untuk menjalani reaksi kimia yang dikatalisis sedangkan situs pengikatan adalah wilayah pada protein, DNA atau RNA, tempat ligan dapat mengikat. Ini adalah perbedaan utama antara situs aktif dan situs pengikatan. Selain itu, situs aktif ada pada enzim, dan mereka membantu meningkatkan laju reaksi reaksi kimia tertentu melalui penurunan penghalang energi aktivasi dari reaksi tersebut. Situs pengikatan, di sisi lain, bertanggung jawab atas pengikatan ligan tertentu dengan molekul tertentu.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara situs aktif dan situs pengikatan dalam bentuk tabel.
Ringkasan – Situs Aktif vs Situs Binding
Situs aktif adalah daerah pada enzim yang dapat meningkatkan laju reaksi reaksi kimia melalui pengurangan penghalang energi aktivasi dari reaksi tersebut. Situs pengikatan adalah setiap wilayah tempat ligan dapat mengikat. Situs aktif juga berisi situs pengikatan. Perbedaan antara situs aktif dan situs pengikatan terletak pada keberadaan dan fungsionalitasnya. Oleh karena itu, perbedaan utama antara situs aktif dan situs pengikatan adalah bahwa situs aktif membantu katalisis reaksi kimia sedangkan situs pengikatan membantu pengikatan ligan ke molekul besar.
