Perbedaan utama antara pembuatan profil polisom dan pembuatan profil ribosom adalah bahwa pembuatan profil polisom menganalisis perilaku ribosom menggunakan ribosom dan mRNA (polisom) selama translasi, sedangkan pembuatan profil ribosom menganalisis perilaku ribosom hanya menggunakan urutan mRNA selama terjemahan.
Translasi adalah fase kedua dari sintesis protein yang mengubah informasi dalam mRNA menjadi urutan asam amino. Translatomics adalah studi tentang ORF (bingkai bacaan terbuka) yang secara aktif diterjemahkan dalam sel organisme. Teknik profil polisom dan ribosom adalah dua jenis teknik di bidang biologi molekuler untuk menilai dan menyimpulkan parameter yang berbeda dalam konteks menganalisis translatome.
Apa itu Profil Polisom?
Polysome profiling adalah teknik yang menyimpulkan status terjemahan mRNA tertentu dengan menganalisis perilaku ribosom dan mRNA (polisom). Dengan kata lain, teknik ini memberikan data dan kesimpulan tentang hubungan mRNA dengan ribosom. Polisom mengacu pada kelompok ribosom yang terikat pada mRNA yang ada selama fase elongasi translasi.
Gambar 01: Pembuatan Profil Polisom
Profil polisom membutuhkan lisat sel, yang kemudian disentrifugasi. Sampel yang disentrifugasi kemudian dipisahkan berdasarkan kepadatannya untuk mengkarakterisasi subunit kecil dan besar ribosom dan mRNA terkait yang terlibat dalam pembentukan polisom. Selanjutnya, proses ini juga melibatkan pengukuran kerapatan optik. Para ahli diperlukan untuk melakukan polysome profiling.
Teknik pembuatan profil Polysome adalah alat penting untuk banyak aplikasi. Para ilmuwan menggunakan teknik ini untuk mempelajari tingkat translasi dalam sel. Lebih khusus lagi, ini adalah alat untuk memberikan informasi yang akurat tentang studi protein individu dan mRNA spesifiknya. Dalam konteks mempelajari tingkat terjemahan mRNA tertentu, teknik profil polisom sangat penting. Di sini, urutan 3' dan 5' dari mRNA dapat diselidiki dengan mengacu pada efeknya pada jumlah mRNA yang diproduksi dan tingkat terjemahan.
Apa itu Pembuatan Profil Ribosom?
Ribosom profiling adalah teknik yang menganalisis perilaku ribosom sehubungan dengan mRNA-nya selama translasi. Teknik ini ditemukan dan dikembangkan oleh Joan Steitz dan Marilyn Kozak. Kemudian teknologi ini dikembangkan lebih lanjut oleh dua ilmuwan, Nicholas dan Jonathan, dalam kombinasi dengan pengurutan generasi berikutnya, yang mengarah pada pengembangan teknik terkait yang berbeda seperti metodologi Translating Ribosom Affinity Purification (TRAP).
Gambar 02: Urutan Ribosom
Prosedur pembuatan profil ribosom melibatkan isolasi mRNA, pembuangan RNA yang tidak terikat pada ribosom, dan pemisahan mRNA yang terikat pada ribosom. Mengikuti prosedur ini, isolat mRNA ditranskripsi balik, dan sintesis cDNA berlangsung. Akhirnya, data urutan dapat disejajarkan dengan profil translasi untuk menyimpulkan karakteristik perilaku ribosom sehubungan dengan mRNA.
Ribosom profiling membantu banyak peneliti untuk mengidentifikasi dan menyimpulkan lokasi situs awal terjemahan, pelengkap dari kerangka bacaan terbuka (ORF) yang diterjemahkan dalam sel atau jaringan, distribusi ribosom pada mRNA, dan kecepatan menerjemahkan ribosom. Pembuatan profil ribosom juga dikenal sebagai footprinting ribosom atau Ribo Seq.
Apa Persamaan Antara Pembuatan Profil Polisom dan Pembuatan Profil Ribosom?
- Profil polisom dan ribosom adalah teknik biologi molekuler yang penting dalam penelitian.
- Mereka memberikan informasi tentang proses penerjemahan.
- Kedua proses pembuatan profil menyediakan data melalui analisis terjemahan.
- Pakar profesional diperlukan untuk melakukan kedua teknik untuk hasil yang akurat.
- Alat bioinformatika memainkan peran penting dalam kedua teknik tersebut.
Apa Perbedaan Antara Pembuatan Profil Polisom dan Pembuatan Profil Ribosom?
Polysome profiling menganalisis perilaku ribosom menggunakan ribosom dan mRNA (polisom) selama translasi, sedangkan profil ribosom menganalisis perilaku ribosom hanya menggunakan urutan mRNA selama translasi. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara profil polisom dan profil ribosom. Selain itu, profil polisom melibatkan teknik seperti sentrifugasi gradien densitas dan pengukuran densitas optik, sedangkan profil ribosom melibatkan ekstraksi mRNA dan teknik pengurutan. Juga, pembuatan profil ribosom lebih akurat daripada pembuatan profil polisom.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara profil polisom dan ribosom dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Pembuatan Profil Polisom vs Pembuatan Profil Ribosom
Translation adalah fase kedua dari sintesis protein yang melibatkan pengubahan informasi pada urutan mRNA menjadi urutan asam amino. Proses ini membutuhkan template mRNA, ribosom, asam amino, tRNA, dan faktor lainnya. Profil polisom dan ribosom adalah dua teknik molekuler. Profil polisom menganalisis perilaku ribosom menggunakan ribosom dan mRNA (polisom) selama translasi, sedangkan profil ribosom menganalisis perilaku ribosom hanya menggunakan urutan mRNA selama translasi. Pembuatan profil polisom melibatkan teknik seperti sentrifugasi gradien densitas dan pengukuran densitas optik. Pembuatan profil ribosom melibatkan teknik seperti ekstraksi mRNA, sintesis cDNA, dan pengurutan. Jadi, ini merangkum perbedaan antara profil polisom dan profil ribosom.
