Perbedaan utama antara penyambungan cis dan trans adalah bahwa penyambungan cis adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menggabungkan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sedangkan penyambungan trans adalah mekanisme antarmolekul yang menghilangkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama.
RNA splicing adalah bentuk pemrosesan RNA sebelum sintesis protein. Dalam proses ini, transkrip RNA pra-messenger yang baru dibuat diubah menjadi RNA messenger yang matang. RNA utusan matang membantu untuk menghasilkan molekul protein. Selama penyambungan RNA, intron (daerah non-coding) dihilangkan, dan ekson (daerah pengkodean) bergabung bersama untuk membuat mRNA matang. Penyambungan cis dan trans adalah dua jenis mekanisme penyambungan RNA.
Apa itu Penyambungan Cis?
Cis splicing adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menggabungkan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama. Penyambungan cis normal memproses satu molekul RNA. Penyambungan cis adalah proses penyambungan khas pra mRNA yang dilakukan oleh spliceosom. Di intron, situs donor (ujung 5' intron), situs cabang (dekat ujung 3' intron) dan situs akseptor (ujung 3' intron) sangat penting untuk penyambungan. Situs donor sambatan mencakup GU urutan invarian di ujung 5' intron. Situs akseptor sambungan di ujung 3' intron memiliki urutan AG yang invarian. Hulu dari urutan AG, ada wilayah yang disebut wilayah pirimidin (traktus polipirimidin). Lebih jauh ke hulu dari saluran polipirimidin, ada titik cabang yang mencakup nukleotida adenosin. Nukleotida ini terlibat dalam pembentukan lariat.
Gambar 01: Penyambungan Cis dan Trans
Spliceosom utama adalah U1, U2, U4, U5 dan U6. Di antara mereka, U1 dan U2 sangat penting. Dalam penyambungan cis, U1 mengikat ke situs sambungan 5', dan U2 mengikat ke titik cabang di dekat situs sambungan 3'. U5/U4/U6 mengikat ekson di situs 5', dengan U6 mengikat U2. Kemudian, U1 dirilis. U5 bergeser dari ekson ke intron, dan U6 berikatan di tempat sambungan 5’. Selanjutnya, U4 juga dirilis. U6/U2 mengkatalisis transesterifikasi, membuat ujung 5’ dari ligat intron menjadi nukleotida A pada intron. Ini memicu pembentukan lariat. Dalam pembentukan lariat, U5 mengikat ekson di tempat sambungan 3’, dan tempat 5’ dibelah. Pada tahap akhir penyambungan, U2/U5/U6 tetap terikat pada lariat, dan tempat 3’ dibelah. Selain itu, ekson diligasi menggunakan hidrolisis ATP pada fase ini.
Apa itu Penyambungan Trans?
Trans splicing adalah mekanisme antarmolekul yang menghilangkan intron atau outron dan menggabungkan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Dalam trans-splicing, tidak ada situs splice 5' pada molekul pra mRNA untuk mengikat protein U1. Sebagai gantinya, RNA capped splice leader (SL) ditrans-splicing ke urutan di bagian luar.
Gambar 02: Penyambungan Trans
Outron adalah wilayah pra mRNA antara tutup 5' dan situs trans splice. Namun, protein U2 biasanya berikatan dengan situs sambungan 3’. Setelah mengeluarkan outron, ekson splice leader (SL) disambungkan ke ekson pertama pada pra mRNA. Lebih lanjut, trans-splicing adalah mekanisme yang diamati pada mikroorganisme tertentu seperti protista kelas Kinetoplastae untuk mengekspresikan gen.
Apa Persamaan Antara Penyambungan Cis dan Trans?
- Penyambungan Cis dan trans adalah dua jenis mekanisme penyambungan RNA.
- Dalam kedua mekanisme, intron dihilangkan.
- Juga, dalam kedua mekanisme, ekson bergabung untuk membentuk mRNA matang.
- Kedua mekanisme ditemukan pada eukariota.
- Mekanisme ini tidak ada pada prokariota.
Apa Perbedaan Antara Penyambungan Cis dan Trans?
Cis splicing adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menggabungkan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sedangkan trans-splicing adalah mekanisme antarmolekul yang menghilangkan intron atau outron dan menggabungkan ekson yang tidak berada dalam RNA yang sama salinan. Jadi, inilah perbedaan utama antara splicing cis dan trans. Selanjutnya, dalam splicing cis, intron dikeluarkan untuk membentuk mRNA matang. Di sisi lain, dalam trans splicing intron atau outron dihilangkan untuk membentuk mRNA matang.
Infografik berikut mencantumkan perbedaan antara splicing cis dan trans dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – Penyambungan Cis vs Trans
RNA splicing adalah bentuk pemrosesan RNA sebelum proses sintesis protein. Penyambungan cis dan trans adalah dua jenis mekanisme penyambungan RNA yang ditemukan pada eukariota. Cis splicing adalah mekanisme intramolekul yang menghilangkan intron dan menggabungkan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, sedangkan trans-splicing adalah mekanisme antarmolekul yang menghilangkan intron atau outron dan menggabungkan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Demikian pembahasan mengenai perbedaan cis dan trans splicing.
