Perbedaan utama antara QTL dan GWAS bergantung pada jenis urutan yang digunakan dalam analisis. QTL menggunakan lokus gen tautan untuk menganalisis sifat fenotipik yang terkait dengan pewarisan poligenik, sedangkan GWAS menggunakan sekuens genom utuh untuk menganalisis polimorfisme nukleotida tunggal pada kondisi tertentu.
Peta QTL dan GWAS memainkan peran penting dalam analisis genetik untuk sifat yang berbeda. Selanjutnya, mereka penting dalam menganalisis berbagai kondisi penyakit dengan etiologi yang tidak diketahui. Selain itu, urutan memainkan peran kunci dalam kedua teknik. Teknik ini selanjutnya dapat digabungkan dengan teknik throughput tinggi lainnya untuk meningkatkan akurasi dan presisi.
Apa itu QTL?
QTL adalah singkatan dari Quantitative Trait Locus. Ini adalah wilayah DNA yang terkait dengan sifat fenotipik. Umumnya, QTL menimbulkan efek poligenik. Distribusi QTL bervariasi, dan jumlah QTL menunjukkan tingkat variasi sifat fenotipik tertentu. Selain itu, mereka biasanya mengkodekan sifat-sifat yang mendasari dan bukan sifat-sifat diskrit.
Setelah mengidentifikasi daerah QTL, penting untuk mengurutkan daerah QTL tertentu. Selain itu, untuk memudahkan penyelidikan dan penelitian, pengurutan dan penyimpanan data urutan wilayah QTL umum dilakukan dengan melibatkan bioinformatika. Kami menyebutnya teknik pemetaan QTL. Selanjutnya, database dibangun dengan urutan wilayah QTL.
Gambar 01: Pemindaian QTL
Selanjutnya, aplikasi sekuens QTL terutama bergantung pada alat BLAST, di mana kesamaan urutan dapat ditentukan. Hal ini penting dalam menyimpulkan hubungan antara organisme. Selanjutnya, penting dalam menentukan kompleksitas fenotipe poligenik tertentu. Ini juga menentukan evolusi sifat tertentu.
Saat ini, analisis QTL digabungkan dengan teknik throughput tinggi lainnya seperti microarray DNA. Ini penting dalam analisis ekspresi fenotipe. Saat ini, para ilmuwan sangat tertarik untuk mengembangkan database QTL karena wilayah QTL bertanggung jawab atas banyak sifat penting dari spesies yang berbeda.
Apa itu GWAS?
GWAS adalah singkatan dari Genome Wide Association Study. Ini juga mengacu pada seluruh studi asosiasi genom. Studi-studi ini fokus terutama pada studi observasional. Ini menganalisis varian genetik individu yang berbeda biasanya terkait dengan sifat tertentu. Selain itu, seluruh genom penting untuk analisis GWAS.
Gambar 02: GWAS
GWAS adalah alat penting dalam analisis polimorfisme nukleotida tunggal yang terkait dengan berbagai kondisi penyakit. Ini juga merupakan studi perbandingan polimorfisme nukleotida tunggal yang berbeda di seluruh populasi yang luas. Selain itu, sampel penelitian GWAS sangat tinggi; Oleh karena itu, dibutuhkan juga format studi kohort cross-sectional.
Selanjutnya, studi GWAS pertama dilakukan berkaitan dengan infark miokard dan menganalisis gen yang terkait dengan infark miokard. Saat ini, GWAS memainkan peran penting dalam menentukan latar belakang genetik penyakit kompleks dengan etiologi yang tidak diketahui.
Apa Persamaan Antara QTL dan GWAS?
- Mereka mengandalkan data sekuens DNA untuk analisis.
- Keduanya terkait dengan latar belakang genetik berbagai karakter.
- Selanjutnya, mereka membutuhkan alat bioinformatika untuk menyimpulkan dan menginterpretasikan hasil.
- Mereka dilakukan pada populasi besar.
Apa Perbedaan Antara QTL dan GWAS?
QTL menganalisis sifat-sifat fenotipik yang terkait dengan pewarisan poligenik menggunakan lokus gen terkait sementara GWAS menganalisis polimorfisme nukleotida tunggal dari kondisi tertentu menggunakan seluruh urutan genom. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara QTL dan GWAS. Pemetaan QTL relatif merupakan teknik yang kurang kompleks daripada GWAS karena memerlukan sekuensing seluruh genom.
Infografik di bawah ini merangkum perbedaan antara QTL dan GWAS dalam bentuk tabel.
Ringkasan – QTL vs GWAS
Pemetaan QTL dan GWAS memainkan peran utama dalam menentukan latar belakang genetik berbagai sifat fenotipik. Mereka juga membantu dalam menganalisis latar belakang genetik berbagai penyakit. Pemetaan QTL memetakan gen tautan yang bertanggung jawab atas sifat berkelanjutan, dan juga melibatkan pemetaan gen pewarisan poligenik. GWAS, di sisi lain, terjadi dengan analisis seluruh genom untuk polimorfisme nukleotida tunggal. Selain itu, ini terjadi di populasi yang lebih besar. Demikian ringkasan perbedaan QTL dan GWAS.
