Perbedaan utama antara gen kandidat dan GWAS adalah bahwa pendekatan gen kandidat menyelidiki variasi genetik dalam sejumlah kecil gen yang telah ditentukan sebelumnya sementara GWAS menyelidiki seluruh genom untuk variasi genetik umum di balik kondisi penyakit tertentu.
Pendekatan gen kandidat dan studi asosiasi genome-wide (GWAS) adalah dua metode yang penting untuk mendeteksi kerentanan genetik terhadap penyakit. Pendekatan gen kandidat didasarkan pada sejumlah kecil gen yang telah ditentukan sebelumnya sementara GWAS didasarkan pada pengujian seluruh genom. Oleh karena itu, pendekatan gen kandidat memerlukan pengetahuan sebelumnya tentang gen yang relevan dengan penyakit, tidak seperti GWAS.
Apa itu Gen Kandidat?
Pendekatan gen kandidat adalah salah satu teknik yang menyelidiki hubungan antara variasi genetik dalam gen minat yang ditentukan sebelumnya dan fenotipe atau keadaan penyakit. Dalam pendekatan ini, penting untuk memiliki pengetahuan sebelumnya tentang dampak fungsional biologis gen pada sifat atau penyakit yang bersangkutan. Berdasarkan pengetahuan ini, sejumlah kecil gen dipilih dan dianalisis untuk variasi genetik.
Gambar 01: Pendekatan Gen Kandidat
Pemilihan gen dilakukan berdasarkan relevansi biologis, fisiologis, dan fungsional terhadap penyakit yang dimaksud dalam pendekatan ini. Pendekatan ini sering dirancang sebagai studi kasus-kontrol.
Apa itu GWAS?
GWAS adalah singkatan dari Genome-Wide Association Study. Ini juga mengacu pada studi asosiasi seluruh genom. Studi-studi ini fokus terutama pada studi observasional. Mereka menganalisis varian genetik dari individu yang berbeda biasanya terkait dengan sifat tertentu. Seluruh genom penting untuk analisis GWAS.
GWAS adalah alat penting dalam analisis polimorfisme nukleotida tunggal yang terkait dengan berbagai kondisi penyakit. Ini adalah studi perbandingan polimorfisme nukleotida tunggal yang berbeda di seluruh populasi yang luas. Sampel penelitian GWAS sangat tinggi; Oleh karena itu, dibutuhkan juga format studi kohort cross-sectional.
Gambar 02: GWAS
Studi GWAS pertama dilakukan berkaitan dengan infark miokard dan menganalisis gen yang terkait dengan infark miokard. Saat ini, GWAS memainkan peran penting dalam menentukan latar belakang genetik penyakit kompleks dengan etiologi yang tidak diketahui.
Apa Persamaan Antara Gen Kandidat dan GWAS?
- Baik pendekatan gen kandidat maupun GWAS adalah teknik yang menganalisis hubungan genetik antara genotipe dan fenotipe penyakit.
- Kedua pendekatan membantu untuk memahami dasar genetik kerentanan terhadap penyakit.
Apa Perbedaan Gen Kandidat dan GWAS?
Pendekatan gen kandidat didasarkan pada gen kandidat atau gen yang ditentukan sebelumnya, sedangkan GWAS didasarkan pada seluruh genom. Jadi, inilah perbedaan utama antara gen kandidat dan GWAS. Juga, dalam pendekatan gen kandidat, pemilihan gen diperlukan sementara tidak diperlukan di GWAS.
Selain itu, pendekatan gen kandidat membutuhkan pengetahuan sebelumnya tentang gen yang relevan dengan penyakit, sementara itu tidak diperlukan untuk GWAS.
Infografik berikut memberikan perbandingan lebih detail terkait perbedaan antara gen kandidat dan GWAS.
Ringkasan – Gen Kandidat vs GWAS
Gen kandidat dan GWAS adalah dua studi asosiasi gen. Pendekatan gen kandidat berfokus pada variasi genetik yang terkait dengan penyakit dalam sejumlah kecil gen yang telah ditentukan sebelumnya. Sebaliknya, GWAS menyelidiki variasi genetik yang terkait dengan penyakit dalam seluruh genom. Jadi, inilah perbedaan utama antara gen kandidat dan GWAS. Kedua metode tersebut penting dalam memahami dasar genetik kerentanan terhadap penyakit.
