Perbedaan utama antara primer dan promotor adalah primer adalah sekuens DNA pendek yang disintesis secara komersial yang digunakan dalam PCR untuk amplifikasi sekuens DNA target sementara promotor adalah sekuens DNA spesifik yang menyediakan situs pengikatan awal yang aman untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi untuk memulai transkripsi.
Primer dan promotor adalah dua jenis sekuens DNA. Primer adalah fragmen kecil DNA yang diperlukan untuk reaksi berantai polimerase (PCR). Ini memiliki urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung mengapit untai DNA. Ada dua jenis primer, dan mereka bekerja sebagai titik awal untuk sintesis untai DNA baru. Sebaliknya, promotor adalah urutan DNA spesifik yang terletak di hulu ke situs inisiasi transkripsi gen. Ini secara langsung berinteraksi dengan komponen mekanisme transkripsi seperti RNA polimerase dan faktor transkripsi untuk mengontrol transkripsi DNA. Oleh karena itu, RNA polimerase dan faktor transkripsi lainnya mengikat urutan promotor dan memulai transkripsi.
Apa itu Primer?
Primer adalah sekuens DNA pendek yang dirancang untuk amplifikasi sekuens DNA target. Secara struktural, mereka memiliki urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung mengapit untai ganda DNA. Panjangnya biasanya sekitar 20 nukleotida. Selama PCR, Taq polimerase mengkatalisis penambahan nukleotida ke dalam urutan nukleotida yang sudah ada sebelumnya. Oleh karena itu, primer berfungsi sebagai titik awal untuk sintesis untaian baru. Taq polymerase hanya bekerja pada arah 5’ sampai 3’. Oleh karena itu, sintesis DNA juga terjadi dalam arah 5 'ke 3' yang sama. Karena DNA beruntai ganda, dua jenis primer diperlukan dalam PCR. Mereka dikenal sebagai primer maju dan primer mundur, berdasarkan arah pemanjangan primer selama sintesis DNA.
Gambar 01: Primer
Meneruskan anil primer dengan untai DNA antisense dan memulai sintesis untai + gen ke arah 5' ke 3'. Ini memiliki urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung mengapit 3 'dari untai antisense. Membalikkan anil primer dengan untai indra dan memulai sintesis untai komplementer dari untai pengkode, yaitu – untai gen ke arah 5'ke 3'. Dengan demikian, primer terbalik dirancang untuk melengkapi ujung 3 'dari untai pengkodean. Kedua primer terbalik dan maju penting untuk produksi jutaan hingga miliaran salinan daerah tertentu DNA yang ditargetkan atau tertarik.
Apa itu Promotor?
Promotor adalah urutan DNA yang terletak di hulu atau di ujung 5′ dari situs inisiasi transkripsi gen. Ini menyediakan situs pengikatan untuk RNA polimerase dan elemen pengatur tertentu untuk memulai transkripsi gen. Ini adalah urutan pengaturan yang diperlukan untuk menghidupkan atau mematikan gen. Ada urutan nukleotida tertentu dalam promotor. Ini dapat memiliki 100–1000 pasangan basa. Promotor menunjukkan arah transkripsi. Selain itu, ini menunjukkan untaian indra yang harus ditranskripsi.
Gambar 02: Promotor Gen
Ada tiga jenis elemen promotor sebagai promotor inti, promotor proksimal, dan promotor distal. Promotor inti adalah bagian minimal dari promotor yang diperlukan untuk memulai transkripsi. Letaknya paling proksimal dari kodon start. Kotak TATA adalah wilayah yang dilestarikan yang ditemukan di banyak promotor inti eukariotik. Ditemukan 25 hingga 35 pasangan basa di hulu situs awal transkripsi. Promotor proksimal ditemukan lebih hulu ke promotor inti. Umumnya, terletak 250 pasangan basa hulu ke kodon awal dan mengandung elemen pengatur utama. Promotor distal ditemukan di hulu ke promotor proksimal, dan mengandung elemen pengatur tambahan. Promotor bakteri memiliki dua elemen urutan pendek dalam promotornya. TATAAT adalah urutan konsensus yang terletak di -10 dari promotor bakteri sedangkan TTGACA adalah urutan konsensus di -35. Mereka dikenal sebagai elemen -10 dan elemen -35.
Apa Persamaan Antara Primer dan Promotor?
- Primer dan promotor adalah dua jenis sekuens DNA.
- Mereka terdiri dari urutan nukleotida.
- Baik primer dan promotor penting untuk ekspresi gen.
Apa Perbedaan Primer dan Promotor?
Primer adalah urutan nukleotida pendek yang dirancang untuk amplifikasi DNA target. Sebaliknya, promotor adalah urutan DNA pengatur spesifik yang ditemukan di hulu ke situs inisiasi transkripsi gen. Jadi, inilah perbedaan utama antara primer dan promotor. Primer memiliki panjang sekitar 20 pasangan basa sementara promotor dapat memiliki 100 -1000 pasangan basa. Secara fungsional, primer berfungsi sebagai urutan awal untuk sintesis untai baru sementara promotor mengontrol transkripsi gen dengan menyediakan situs pengikatan untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi lainnya.
Selain itu, promotor didefinisikan sebagai arah transkripsi dan menunjukkan untai indera gen. Secara struktural, primer adalah sekuens DNA beruntai tunggal pendek sedangkan promotor adalah sekuens DNA beruntai ganda yang panjang.
Info-grafik di bawah ini memuat lebih banyak perbandingan terkait perbedaan antara primer dan promotor.
Ringkasan – Primer vs Promotor
Primer adalah urutan nukleotida pendek yang melengkapi ujung mengapit untai ganda DNA target. Dua jenis primer digunakan dalam PCR. Mereka berfungsi sebagai urutan awal untuk sintesis untaian baru. Primer dirancang secara komersial, dan mereka adalah urutan stabil suhu. Di sisi lain, promotor adalah urutan pengaturan gen yang terletak di hulu ke situs inisiasi transkripsi. Promotor mengontrol transkripsi gen. Mereka menyediakan situs pengikatan untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi untuk memulai transkripsi. Jadi, ini adalah ringkasan perbedaan antara primer dan promotor.
