Perbedaan Kunci – Enzim Pembatasan Tipe I vs Tipe II
Enzim restriksi, lebih sering disebut sebagai endonuklease restriksi, memiliki kemampuan untuk membelah molekul DNA menjadi fragmen-fragmen kecil. Proses pembelahan ini terjadi di dekat atau di tempat pengenalan khusus molekul DNA yang disebut situs restriksi. Situs pengenalan biasanya terdiri dari 4-8 pasangan basa. Tergantung pada lokasi pembelahan, enzim restriksi dapat terdiri dari empat jenis yang berbeda; Tipe I, Tipe II, Tipe III dan Tipe IV. Selain lokasi pembelahan, faktor-faktor seperti komposisi, kebutuhan kofaktor dan kondisi urutan target juga dipertimbangkan ketika membedakan enzim restriksi menjadi empat kelompok. Selama pembelahan molekul DNA, situs pembelahan dapat berada di situs restriksi itu sendiri atau pada jarak dari situs restriksi. Selama proses pembelahan DNA, enzim restriksi membuat dua sayatan melalui masing-masing tulang punggung gula fosfat dalam heliks ganda DNA. Enzim restriksi terutama ditemukan pada Achaea dan bakteri. Mereka memanfaatkan enzim ini sebagai mekanisme pertahanan melawan virus yang menyerang. Enzim restriksi membelah DNA asing (patogen), tetapi bukan DNAnya sendiri. DNA-nya sendiri dilindungi oleh enzim yang dikenal sebagai methyltransferase yang membuat modifikasi pada DNA inang dan mencegah pembelahan. Enzim restriksi tipe I memiliki situs pembelahan yang jauh dari situs pengenalan. Enzim restriksi tipe II membelah di dalam situs pengenalan itu sendiri atau pada jarak yang lebih dekat dengannya. Inilah perbedaan utama antara enzim restriksi Tipe I dan Tipe II.
Apa itu Enzim Pembatasan Tipe I?
Enzim restriksi tipe I adalah protein pentamerik yang terdiri dari tiga subunit multi: subunit restriksi, subunit metilasi, dan subunit pengenalan urutan DNA. Subunit ini tidak identik. Mereka awalnya diidentifikasi dalam dua bentuk Escherichia coli yang berbeda. Tempat pembelahan enzim restriksi ini terdapat pada titik acak yang berbeda, biasanya 1000 pasangan basa jauhnya dari tempat pengenalan. Enzim restriksi ini membutuhkan ATP, Mg2+ dan S-adenosil-L-metionin untuk aktivasinya. Enzim restriksi tipe I memiliki aktivitas metilase dan restriksi. Bakteri menggunakan enzim restriksi sebagai mekanisme pertahanan seluler dari serangan virus. Enzim restriksi membelah DNA virus dan menghancurkannya. Tetapi untuk mencegah pembelahan DNA inangnya sendiri, enzim restriksi tipe I memberikan perlindungan metilasi. Ini memodifikasi DNA inang dan mencegah pembelahan. Meskipun enzim restriksi ini penting secara biokimia, mereka tidak digunakan secara luas karena tidak menyediakan fragmen restriksi diskrit atau pola pengikatan gel.
Apa itu Enzim Pembatasan Tipe II?
Enzim restriksi Tipe II mengandung dua subunit identik dalam strukturnya. Homodimer dibentuk oleh enzim restriksi tipe II dengan situs pengenalan. Situs pengenalan biasanya palindromik dan tidak terbagi. Memiliki panjang 4-8 pasangan basa. Tidak seperti tipe I, situs pembelahan enzim restriksi Tipe II hadir di situs pengenalan atau ada pada jarak dekat ke situs pengenalan.
Gambar 02: Enzim Pembatasan Tipe II
Enzim restriksi ini secara biokimia penting dan tersedia secara luas secara komersial. Untuk aktivasinya hanya membutuhkan Mg2+ Tidak memiliki aktivitas metilasi dan hanya menyediakan fungsi aktivitas restriksi. Enzim restriksi ini mengikat molekul DNA sebagai homodimer dan memiliki kemampuan untuk mengenali urutan DNA simetris serta urutan asimetris.
Apa Persamaan Antara Enzim Restriksi Tipe I dan Tipe II?
- Enzim restriksi Tipe I dan Tipe II merupakan jenis enzim yang merupakan endonuklease restriksi yang berperan dalam pemecahan molekul DNA menjadi fragmen-fragmen yang lebih kecil.
- Keduanya berguna dalam teknik biologi molekuler.
Apa Perbedaan Enzim Restriksi Tipe I dan Tipe II?
Enzim Pembatasan Tipe I vs Tipe II |
|
| Enzim restriksi tipe I adalah enzim restriksi DNA yang memotong DNA pada tempat acak yang jauh dari tempat pengenalannya. | Enzim restriksi tipe II adalah enzim restriksi DNA yang memotong DNA pada posisi tertentu dekat atau di dalam situs pengenalan. |
| Komposisi | |
| Enzim restriksi tipe I adalah enzim kompleks yang terdiri dari tiga (03) sub unit yang tidak identik. | Enzim restriksi Tipe II adalah enzim sederhana yang terdiri dari dua subunit yang identik. |
| Berat Molekul | |
| Enzim restriksi tipe I memiliki berat 400.000 d alton. | Enzim restriksi tipe II memiliki kisaran berat 20.000 – 100.000 d alton. |
| Urutan Pembelahan | |
| Urutan pembelahan tidak spesifik pada enzim restriksi tipe I. | Enzim restriksi tipe II memiliki urutan pembelahan yang spesifik. |
| Situs belahan dada | |
| Tempat pembelahan berjarak 1000 nukleotida dari tempat pengenalan pada enzim restriksi tipe I. | Tempat pembelahan terdapat pada tempat pengenalan atau dalam jarak pendek dari tempat pengenalan pada enzim restriksi tipe II. |
| Kofaktor untuk Aktivasi | |
| Enzim restriksi tipe I membutuhkan ATP, Mg2+ dan S-adenosyl-L-methionine untuk aktivasinya. | Hanya Mg2+ yang diperlukan untuk mengaktifkan enzim restriksi tipe II. |
| Aktivitas Metilasi | |
| Enzim tipe I memberikan perlindungan pada DNA dengan metilasi. | Tidak ada aktivitas metilasi pada enzim restriksi Tipe II. |
| Aktivitas Enzim | |
| Enzim restriksi tipe I menyediakan aktivitas endonuklease (restriksi) dan metilasi. | Enzim restriksi tipe II hanya memberikan aktivitas restriksi. |
| Contoh | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Ringkasan – Enzim Pembatasan Tipe I vs Tipe II
Enzim restriksi disebut sebagai gunting biologis yang memecah molekul DNA menjadi zat yang lebih kecil. Enzim restriksi dibedakan menjadi 04 kategori yang berbeda sesuai dengan lokasi situs pembelahan sehubungan dengan situs pengenalan, faktor-faktor yang ada, komposisi dan kondisi urutan target. Untuk aktivasinya, enzim restriksi Tipe I membutuhkan ATP, Mg2+, dan S-adenosyl-L-methionine. Tempat pembelahan enzim restriksi tipe I biasanya terdapat 1000 pasangan basa jauhnya dari tempat pengenalan dan memberikan perlindungan metilase pada DNA. Enzim restriksi tipe II hanya membutuhkan Mg2+ untuk aktivasinya. Situs pembelahan hadir di situs pengenalan atau dekat dengannya. Itu tidak memiliki aktivitas metilasi dan tersedia secara komersial. Inilah perbedaan antara enzim restriksi tipe I dan enzim restriksi tipe II.
Unduh Versi PDF Enzim Pembatasan Tipe I vs Tipe II
Anda dapat mengunduh versi PDF dari artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan offline sesuai catatan kutipan. Silakan unduh versi PDF di sini Perbedaan Antara Enzim Pembatasan Tipe I dan Tipe II.
