Perbedaan Kunci – Genotipe vs Urutan
Genotipe dan sekuensing adalah dua teknik yang dilakukan untuk memperoleh informasi tentang asam nukleat, terutama DNA suatu organisme. Perbedaan utama antara genotipe dan sekuensing adalah bahwa genotipe adalah proses menentukan varian genetik mana yang dimiliki individu menggunakan penanda sedangkan sekuensing adalah penentuan urutan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen DNA yang diberikan.
Apa itu Genotipe?
Genotipe adalah penentuan susunan genetik suatu individu menggunakan urutan DNA dan penanda serta perbandingan dan identifikasi pewarisannya. Genotipe penting dalam biologi evolusioner, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetika organisme. Ini dapat dilakukan dengan berbagai teknik termasuk sekuensing DNA, reaksi berantai polimerase, polimorfisme panjang fragmen restriksi (RFLP), deteksi polimorfik amplifikasi acak, polimorfisme panjang fragmen amplifikasi (AFLP), microarray DNA, dll.
Genotyping melibatkan pengurutan fragmen kecil tertentu dari sekuens DNA dan menemukan keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain menggunakan penanda genetik. Ini menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNPs) di antara individu atau alel tertentu. Genotipe berlaku untuk berbagai organisme termasuk manusia. Hal ini juga berlaku untuk mikroorganisme seperti virus, jamur dll dan dapat digunakan untuk menentukan varian genetik mereka dengan profil referensi. Dalam epidemiologi molekuler dan mikrobiologi forensik, pengendalian patogen, terutama mikroorganisme, dilakukan dengan informasi yang diperoleh dari genotipe. Genotyping sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia genotipe untuk mengkonfirmasi ibu dan ayah. Genotipe akan mengungkapkan alel gen dominan dan resesif yang menentukan sifat tertentu.
Gambar_1: Genotipe RFLP
Apa itu Sequencing?
Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen DNA atau RNA tertentu. Hampir semua informasi yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan suatu organisme dikodekan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk memproduksi dan memisahkan beberapa ratus nukleotida fragmen asam nukleat panjang menyebabkan pengembangan prosedur untuk menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Berbagai jenis metode pengurutan tersedia saat ini. Metode pengurutan ini, bersama dengan teknologi untuk pembangunan perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom suatu organisme, memfasilitasi pengurutan seluruh genom organisme itu, membuat analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, daerah pengatur gen, dll.
Total genom dari banyak virus, beberapa bakteri, archaebacteria, ragi dan beberapa organisme lain telah diurutkan dan dipetakan. Proyek genom manusia telah memungkinkan untuk mengurutkan dan memetakan seluruh genom manusia dan menerbitkan draf pertamanya pada tahun 2003. Ini merupakan tonggak utama dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia sekarang digunakan di sektor medis untuk mengidentifikasi penyebab genetik untuk penyakit langka, menyaring risiko penyakit pada bayi baru lahir, mengidentifikasi detail genetik berbagai kanker, mengembangkan terapi baru, dan mengembangkan alat diagnostik baru, dll.
Di dunia tumbuhan, genom padi dan genom Arabidopsis telah diurutkan. Pengetahuan tentang urutan ini tidak diragukan lagi akan merevolusi pemahaman kita tentang bagaimana sel dan organisme berfungsi.
Gambar_2: Autoradiograf sekuensing sanger
Apa perbedaan antara Genotyping dan Sequencing?
Genotyping vs Sequencing |
|
| Genotyping adalah proses penentuan komposisi genetik suatu individu dan pengecekan kelompok atau taksonomi organisme tersebut. | Sekuensing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA tertentu. |
| Teknik | |
| RFLP, Sequencing gen, PCR, DNA microarrays, AFLP dll. | Pengurutan Sanger, Pengurutan Gilbert, Pengurutan Pyrose, Pengurutan Generasi Berikutnya, Pengurutan Shotgun, dll. |
| Kekhawatiran Utama | |
| Ini lebih mementingkan apakah perbedaan genotipe memberikan perbedaan fenotipe yang sebenarnya. | Ini lebih mementingkan urutan nukleotida dan perbedaannya serta perubahannya dengan organisme lain. |
Ringkasan – Genotip vs Urutan
Genotipe dan sekuensing berguna untuk mempelajari informasi genetik organisme. Genotipe adalah proses menentukan variasi genotipe antar individu dan menemukan kategorinya. Sekuensing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen yang tertarik atau wilayah DNA. Kedua teknik memberikan informasi penting tentang gen dan genom.
