Perbedaan utama antara subunit protein dan domain adalah bahwa subunit protein adalah rantai polipeptida terpisah dari protein yang berkumpul dengan rantai polipeptida lain untuk membentuk kompleks protein, sedangkan domain protein adalah wilayah yang berdekatan dari rantai polipeptida dari protein yang sering terlipat secara independen menjadi unit yang kompak, lokal, dan semi-independen.
Subunit dan domain protein adalah bagian yang sangat penting dari protein multimerik. Protein adalah polimer yang terbuat dari polipeptida. Setiap rantai polipeptida terbentuk dari monomer yang dikenal sebagai asam amino. Protein kompleks mengandung unit struktural yang berbeda seperti subunit, domain, motif, dan lipatan. Unit struktural dari protein kompleks ini sangat penting untuk strukturnya dan pada akhirnya untuk fungsinya.
Apa itu Subunit Protein?
Suatu subunit protein adalah rantai polipeptida terpisah dari protein yang berkumpul dengan rantai polipeptida lain untuk membentuk kompleks protein. Dalam biologi struktural, subunit protein adalah molekul protein tunggal yang bergabung dengan molekul protein lain untuk membentuk kompleks protein. Protein alami memiliki jumlah subunit yang relatif kecil, seperti hemoglobin dan DNA polimerase. Oleh karena itu, mereka disebut oligomer. Protein lain terdiri dari sejumlah besar subunit, sehingga mereka digambarkan sebagai multimerik. Misalnya, mikrotubulus dan protein sitoskeleton lainnya bersifat multimer. Subunit protein multimerik mungkin identik (homolog) atau sama sekali berbeda (heterolog).
Gambar 01: Subunit Protein
Pada beberapa protein multimerik, satu subunit mungkin merupakan subunit katalitik. Di sisi lain, yang lain adalah subunit pengatur. Fungsi subunit katalitik adalah mengkatalisis reaksi enzimatik sedangkan, fungsi subunit pengatur memfasilitasi atau menghambat aktivitasnya. Enzim yang terdiri dari subunit katalitik dan regulasi ketika dirakit biasanya disebut sebagai holoenzim. Misalnya, enzim kelas I phosphoinositide 3-kinase memiliki subunit katalitik p110 dan subunit regulator p85. Selain itu, protein harus memiliki satu gen untuk setiap subunit. Ini karena subunit terdiri dari rantai polipeptida terpisah yang memiliki satu gen pengkode.
Apa itu Domain Protein?
Sebuah domain protein adalah wilayah yang berdekatan dari rantai polipeptida protein yang sering kali terlipat secara independen menjadi unit yang kompak, lokal, dan semi-independen. Domain protein juga dikenal sebagai wilayah rantai polipeptida protein yang menstabilkan diri dan melipat secara independen dari yang lain. Mereka adalah unit struktural dan fungsional yang berbeda dalam protein. Biasanya, domain bertanggung jawab untuk fungsi tertentu atau interaksi yang berkontribusi pada peran keseluruhan protein. Misalnya, domain SH3 adalah sekitar 50 residu asam amino. Mereka terjadi dalam berbagai macam protein, termasuk protein adaptor, fosfatidilinositol3-kinase, fosfolipase, dan miosin. Domain SH3 ini terlibat dalam interaksi protein-protein.
Gambar 02: Domain Protein
Domain memiliki panjang yang bervariasi dari 50 asam amino hingga 250 asam amino. Domain terpendek, seperti jari seng, distabilkan oleh ion logam dan jembatan disulfida. Sebuah domain sering menghasilkan unit fungsional seperti domain EF-hand calmodulin yang mengikat kalsium. Selanjutnya, domain dapat ditukar melalui rekayasa genetika antara satu protein dengan protein lain untuk membuat protein chimeric.
Apa Persamaan Antara Subunit Protein dan Domain?
- Subunit dan domain protein adalah unit struktural protein multimerik.
- Keduanya terdiri dari asam amino.
- Mereka terhubung dengan istilah "rantai polipeptida".
- Selain itu, keduanya sangat penting untuk fungsi protein secara keseluruhan.
Apa Perbedaan Antara Subunit Protein dan Domain?
Suatu subunit protein adalah rantai polipeptida terpisah dari protein yang berkumpul dengan rantai polipeptida lain untuk membentuk kompleks protein. Di sisi lain, domain protein adalah wilayah yang berdekatan dari rantai polipeptida protein yang sering kali terlipat secara independen menjadi unit yang kompak, lokal, dan semi-independen. Jadi, inilah perbedaan utama antara subunit protein dan domain. Selain itu, ukuran subunit protein lebih besar daripada domain protein.
Tabel berikut merangkum perbedaan antara subunit protein dan domain dalam bentuk tabel.
Ringkasan – Subunit Protein vs Domain
Blok penyusun protein adalah asam amino. Protein dibentuk oleh kondensasi asam amino. Struktur protein berkisar dalam ukuran dari puluhan hingga beberapa ribu asam amino. Struktur protein distabilkan oleh interaksi non-kovalen seperti ikatan hidrogen, ikatan ionik, gaya Van der Waals, ikatan hidrofobik, dan interaksi kovalen seperti ikatan disulfida. Protein kompleks mengandung unit struktural yang berbeda seperti subunit, domain, motif, dan lipatan. Subunit protein adalah rantai polipeptida terpisah dari protein yang berkumpul dengan rantai polipeptida lain untuk membentuk kompleks protein. Di sisi lain, domain protein adalah wilayah rantai polipeptida protein yang menstabilkan diri dan melipat secara independen dari yang lain. Jadi, inilah ringkasan perbedaan antara subunit protein dan domain.
