Perbedaan utama antara ORF dan ekson adalah bahwa ORF atau kerangka baca terbuka adalah rangkaian urutan DNA yang dimulai dengan situs inisiasi translasi (kodon start) dan diakhiri dengan situs terminasi translasi (kodon stop) sedangkan ekson urutan nukleotida dalam gen yang mengkode asam amino.
Bingkai baca terbuka adalah bagian dari kerangka baca. Bingkai bacaan dibaca oleh ribosom untuk membuat protein. ORF adalah bentangan kodon yang terus menerus yang memberikan protein yang berfungsi penuh. Dimulai dengan kodon start dan diakhiri dengan kodon stop. Di dalam ORF, tidak ada kodon stop yang mengganggu urutan pengkodean. Penerjemahan dimulai pada kodon start dan berakhir pada kodon stop. Ekson adalah urutan nukleotida dari suatu gen. Ini mengkodekan asam amino dari protein. Oleh karena itu, ekson merupakan daerah pengkodean suatu gen.
Apa itu ORF?
Open reading frame atau ORF adalah bentangan kontinu urutan nukleotida yang dimulai dengan kodon start dan diakhiri dengan kodon stop. Dengan kata sederhana, ORF mengacu pada wilayah urutan nukleotida yang terletak di antara kodon start dan stop. Di antaranya, tidak ada kodon stop yang menginterupsi ORF. Urutan nukleotida antara kodon start dan stop mengkode asam amino. Umumnya kodon start adalah ATG sedangkan kodon stop adalah TAG, TAA, dan TGA. ORF memberikan protein fungsional ketika ditranskripsi dan diterjemahkan. Oleh karena itu, ORF mencakup kodon start, beberapa kodon di wilayah tengah dan kodon stop. Menariknya, ORF memiliki panjang yang bisa dibagi tiga.
Gambar 01: ORF
Dalam prokariota, karena tidak ada intron, ORF adalah daerah pengkodean gen yang mentranskripsi langsung ke mRNA. Pada eukariota, karena ada intron, ORF adalah urutan kodon yang dihasilkan setelah pemrosesan atau penyambungan RNA. ORF adalah bukti yang membantu prediksi gen karena ORF yang panjang kemungkinan besar merupakan bagian dari gen.
Apa itu Exon?
Exon adalah urutan nukleotida pengkode dari gen yang diterjemahkan menjadi protein. Mereka berada di kedua sisi intron. Setelah menghapus urutan non-coding dari mRNA pra, molekul mRNA matang hanya terdiri dari urutan ekson. Kemudian urutan nukleotida dari molekul RNA akhir (mRNA matang) diubah menjadi urutan asam amino dari protein tertentu.
Gambar 02: Ekson
Hampir semua gen memiliki urutan nukleotida awal yang membedakannya sebagai gen dari untai DNA atau RNA utama, yang dikenal sebagai Open Reading Frame (ORF. Pada beberapa gen, dua ORF menandai seluruh gen dan ekson terletak di dalam urutan pengkodean. Meskipun terdengar bahwa ekson selalu diekspresikan dalam gen, ada beberapa contoh di mana urutan intron campur tangan dengan ekson menyebabkan mutasi, dan proses ini dikenal sebagai eksonisasi.
Apa Persamaan Antara ORF dan Exon?
- Baik ORF dan ekson adalah urutan nukleotida.
- ORF panjang dan ekson adalah bagian dari gen.
- Keduanya memiliki urutan pengkodean.
Apa Perbedaan Antara ORF dan Exon?
ORF dan ekson adalah urutan nukleotida. ORF mengacu pada setiap rangkaian urutan DNA yang terletak di antara kodon start dan kodon stop. Sebaliknya, ekson adalah urutan nukleotida pengkode dari gen yang mengkode asam amino. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara ORF dan ekson. Ekson adalah bagian dari gen sementara ORF yang panjang cenderung menjadi bagian dari gen. Selain itu, ada intron di kedua sisi ekson sedangkan ORF tidak termasuk intron.
Infografik berikut merangkum perbedaan antara ORF dan ekson dalam bentuk tabel.
Ringkasan – ORF vs Exon
Rangka baca terbuka (ORF) adalah bagian dari kerangka baca. Ini adalah rangkaian DNA yang terus menerus yang dimulai dengan kodon start dan diakhiri dengan kodon stop. Ekson adalah urutan nukleotida dari suatu gen. Ini mengkodekan untuk bagian dari urutan mRNA. Oleh karena itu, ekson adalah bagian dari urutan gen yang diekspresikan dalam protein. Jadi, ini merangkum perbedaan antara ORF dan ekson.