Perbedaan utama antara transposon DNA dan retrotransposon adalah bahwa transposon DNA adalah elemen genetik bergerak yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme potong dan tempel, sedangkan retrotransposon adalah elemen genetik bergerak yang berpindah dari satu tempat ke yang lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme salin dan tempel.
Elemen genetik seluler (MGE) adalah segmen DNA yang mengkodekan enzim dan protein spesifik yang memediasi pergerakannya di dalam genom, atau yang dapat ditransfer dari satu spesies ke spesies lain. Mereka juga dikenal sebagai elemen genetik egois. Elemen transposabel mewakili salah satu dari beberapa jenis elemen genetik bergerak. Ada dua jenis utama elemen transposabel: transposon DNA dan retrotransposon. Oleh karena itu, transposon DNA dan retrotransposon adalah elemen genetik bergerak yang dapat berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom.
Apa itu Transposon DNA?
Transposon DNA adalah elemen genetik bergerak yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme potong dan tempel. Mereka termasuk elemen transposabel kelas II yang bergerak melalui perantara DNA. Ini bertentangan dengan elemen transposabel kelas I (retrotransposon) yang bergerak melalui perantara RNA. Biasanya, transposon DNA bergerak di dalam genom dengan menggunakan metode potong dan tempel. Metode ini membutuhkan enzim transposase yang mengkatalisis pergerakan DNA dari lokasi saat ini dalam genom dan penyisipan di lokasi baru.
Gambar 01: Transposon DNA
Transposisi ini membutuhkan tiga situs DNA pada transposon (dua di setiap ujung transposon disebut terminal inverted repeats dan satu di situs target). Enzim transposase akan berikatan dengan terminal ulangan terbalik dari transposon dan memediasi sinapsis dari ujung transposon. Kemudian enzim transposase memutuskan elemen dari DNA mengapit situs donor asli dan menengahi bergabungnya transposon ke situs penyisipan baru dalam genom. Penambahan transposon ke lokasi baru menyebabkan celah pendek di kedua sisi segmen yang disisipkan. Sistem host memperbaiki celah ini, menghasilkan target sequence duplication (TSD), yang merupakan karakteristik dari transposisi.
Apa itu Retrotransposon?
Retrotransposon adalah elemen genetik bergerak yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme salin dan tempel. Mereka termasuk dalam elemen transposable kelas I. Elemen transposable kelas I (retrotransposon) bergerak melalui perantara RNA dalam genom. Mereka adalah jenis komponen genetik yang menyalin dan menempelkan diri ke lokasi genom yang berbeda.
Gambar 02: Retrotransposon
Pertama, mereka ditranskripsi dari DNA ke RNA. Kemudian RNA yang dihasilkan ditranskripsikan secara terbalik menjadi DNA. DNA yang disalin ini kemudian dimasukkan kembali ke dalam genom di lokasi baru. Transkripsi terbalik dikatalisis oleh reverse transcriptase. Reverse transcriptase sering dikodekan oleh retrotransposon itu sendiri. Integrasi dilakukan oleh enzim yang disebut integrase. Selanjutnya, umumnya tiga jenis: pengulangan terminal panjang (LTR), elemen nuklir diselingi panjang (LINE), dan elemen nuklir diselingi pendek (SINE).
Apa Persamaan Antara Transposon DNA dan Retrotransposon?
- Transposon DNA dan retrotransposon adalah elemen genetik bergerak.
- Keduanya diklasifikasikan di bawah elemen transposable.
- Keduanya dikenal sebagai gen pelompat.
- Mereka dapat berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom.
- Mereka sangat penting secara evolusi.
Apa Perbedaan Transposon DNA dan Retrotransposon?
Transposon DNA adalah elemen genetik bergerak yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme potong dan tempel, sedangkan retrotransposon adalah elemen genetik bergerak yang berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan salinan dan mekanisme pasta. Jadi, ini adalah perbedaan utama antara transposon DNA dan retrotransposon. Lebih lanjut, transposon DNA termasuk dalam elemen transposabel kelas II, sedangkan retrotransposon termasuk dalam elemen transposabel kelas I.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – DNA Transposon vs Retrotransposon
Transposon DNA dan retrotransposon adalah elemen genetik bergerak. Transposon DNA berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme cut paste. Retrotransposon berpindah dari satu tempat ke tempat lain dalam genom dengan menggunakan mekanisme salin dan tempel. Jadi, ini merangkum perbedaan antara transposon DNA dan retrotransposon.
