Perbedaan utama antara NAAT dan PCR adalah bahwa NAAT adalah yang mengamplifikasi materi genetik menggunakan beberapa cara, termasuk reaksi berantai polimerase, perpindahan untai, atau amplifikasi yang dimediasi transkripsi, sedangkan PCR adalah metode yang mengamplifikasi materi genetik hanya dengan menggunakan siklus termal.
Patogen terutama diidentifikasi oleh amplifikasi materi genetik mereka. Sebagian besar teknik di bidang ini berfokus pada deteksi materi genetik patogen dengan memperkuat urutan spesifik secara real-time. Oleh karena itu, hasil yang dihasilkan sangat cepat dalam konteks diagnostik. NAAT, PCR, biosensor, dan LCR adalah beberapa teknik yang digunakan di laboratorium untuk mengamplifikasi materi genetik patogen.
Apa itu NAAT?
Uji amplifikasi asam nukleat (NAAT) adalah metode dalam biologi molekuler yang mengamplifikasi materi genetik menggunakan beberapa cara seperti reaksi berantai polimerase, amplifikasi perpindahan untai, atau amplifikasi yang dimediasi transkripsi. Amplifikasi materi genetik juga dapat dilakukan melalui teknik seperti reaksi berantai ligasi dan reaksi DNA bercabang (quantiplex b DNA) dalam prosedur NAAT. NAAT menggunakan kekhususan pasangan basa Watson-Crick. Dalam prosedur NAAT, probe beruntai tunggal atau molekul primer dihibridisasi dengan molekul DNA atau RNA target. Oleh karena itu, desain untaian probe sangat penting untuk meningkatkan sensitivitas dan spesifisitas deteksi. Kemudian, langkah selanjutnya dari NAAT adalah mengamplifikasi materi genetik dengan membuat banyak salinannya untuk dideteksi.
Gambar 01: NAAT
NAAT saat ini diterapkan untuk mendeteksi beberapa patogen seperti Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis, dan SARS-COV2. Selain itu, tes NAAT dikembangkan untuk mempersingkat periode jendela. Periode jendela adalah periode waktu antara saat pasien terinfeksi dan saat mereka menunjukkan hasil positif melalui tes antibodi. Selanjutnya, metode penyaringan NAAT pertama kali disetujui pada tahun 1999 oleh FDA. NAAT memiliki banyak keunggulan antara lain, deteksi kadar DNA atau RNA rendah, sensitivitas tinggi, dan spesifisitas tinggi.
Apa itu PCR?
PCR adalah metode dalam biologi molekuler yang mengamplifikasi materi genetik hanya dengan menggunakan siklus termal. PCR adalah singkatan dari reaksi berantai polimerase. Ini adalah tes untuk mendeteksi materi genetik dari organisme tertentu seperti bakteri, jamur, dan virus. Dalam diagnosis penyakit, PCR mendeteksi keberadaan patogen jika orang tersebut memiliki patogen pada saat tes. Dalam diagnosis penyakit, protokol PCR memiliki beberapa tahapan, antara lain pengambilan sampel, ekstraksi DNA, PCR, dan sequencing. Dalam pengujian patogen, sampel yang dikumpulkan digunakan untuk mengekstrak materi genetik (DNA atau RNA). Prosedur PCR membutuhkan bahan kimia, primer, dan enzim khusus untuk menghasilkan jutaan salinan materi genetik di dalam mesin PCR yang disebut thermal cycler. Setelah diamplifikasi dari produk PCR, patogen dapat dideteksi. Ilmuwan menggunakan perangkat lunak khusus untuk menginterpretasikan hasilnya.
Gambar 02: PCR
Selanjutnya, ada berbagai jenis PCR yang saat ini digunakan dalam penelitian. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD, dan Nested PCR adalah beberapa di antaranya. PCR berguna terutama dalam mendeteksi faringitis (Streptococcl pharyngitis), pneumonia atipikal (Chlymydia pneumoniae), campak (Morbillivirus), hepatitis (HBV), dan infeksi urogenital ulseratif (Haemophilus ducreyi).
Apa Persamaan Antara NAAT dan PCR?
- NAAT dan PCR adalah dua metode biologi molekuler penting yang digunakan untuk mengamplifikasi materi genetik.
- Asam nukleat (DNA atau RNA) diperkuat dengan kedua teknik.
- Mereka adalah teknik yang cepat dan cepat.
- Kedua teknik saat ini digunakan untuk diagnosis penyakit.
- Mereka lebih mahal daripada metode konvensional.
Apa Perbedaan NAAT dan PCR?
NAAT adalah metode dalam biologi molekuler yang mengamplifikasi materi genetik menggunakan beberapa metode, sedangkan PCR adalah metode dalam biologi molekuler yang mengamplifikasi materi genetik hanya dengan siklus termal. NAAT menggunakan teknik amplifikasi materi genetik yang berbeda seperti reaksi berantai polimerase, amplifikasi perpindahan untai, amplifikasi yang dimediasi transkripsi, reaksi berantai ligasi, dan reaksi DNA bercabang (quantiplex b DNA). Di sisi lain, PCR menggunakan teknik amplifikasi materi genetik yang berbeda seperti RT-PCR. Multipleks PCR, RAPD, PCR Bersarang. Jadi, inilah perbedaan utama antara NAAT dan PCR.
Infografik di bawah ini menyajikan perbedaan antara NAAT dan PCR dalam bentuk tabel untuk perbandingan berdampingan.
Ringkasan – NAAT vs PCR
Ada berbagai alat biologi molekuler yang digunakan di laboratorium untuk mengamplifikasi materi genetik. NAAT, PCR, biosensor, dan LCR adalah beberapa teknik tersebut. NAAT adalah teknik biologi molekuler yang mengamplifikasi materi genetik menggunakan beberapa cara seperti reaksi berantai polimerase, perpindahan untai, atau amplifikasi yang dimediasi transkripsi. PCR adalah metode dalam biologi molekuler yang mengamplifikasi materi genetik menggunakan siklus termal. Jadi, inilah perbedaan utama antara NAAT dan PCR.
