Perbedaan utama antara serin dan tirosin rekombinase adalah bahwa dalam serin rekombinase, serin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi, sedangkan pada tirosin rekombinase, tirosin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi.
Rekombinasi situs-spesifik (rekombinasi situs-spesifik konservatif) adalah jenis teknik rekombinasi genetik di mana pertukaran untai DNA terjadi antara segmen yang memiliki tingkat homologi urutan tertentu. Rekombinasi spesifik lokasi mengatur proses rekombinasi spesifik lokasi. Enzim-enzim ini dikelompokkan menjadi dua keluarga sebagai keluarga serin rekombinase dan keluarga tirosin rekombinase. Nama-nama tersebut berasal dari residu asam amino nukleofilik yang terdapat dalam dua kelas rekombinasi di atas yang digunakan untuk menyerang DNA dan yang menjadi terikat secara kovalen selama pertukaran untai dalam rekombinasi spesifik lokasi.
Apa itu Serine Recombinase?
Dalam metode rekombinasi spesifik lokasi, dua sekuens DNA pendek ('situs target') dipotong pada titik-titik tertentu di kedua untai, dan ujung yang dipotong digabungkan kembali ke pasangan baru. Teknologi rekombinasi spesifik lokasi adalah alat genomik dalam rekayasa genetika yang bergantung pada enzim rekombinase untuk menggantikan bagian target DNA. Banyak sistem rekombinasi spesifik lokasi telah ditemukan untuk melakukan penataan ulang DNA ini untuk tujuan yang berbeda. Tetapi semua enzim rekombinase ini termasuk dalam dua keluarga. Serin rekombinase adalah salah satunya. Mereka dapat memediasi hingga tiga jenis penataan ulang DNA: integrasi, eksisi, dan inversi.
Gambar 01: Serine Recombinase
Rekombinase spesifik situs seperti serin rekombinase melakukan penataan ulang DNA dengan mengenali dan mengikat urutan DNA pendek (situs target), di mana mereka membelah tulang punggung DNA. Kemudian, pertukaran dua heliks DNA terjadi dan penggabungan kembali untaian DNA terjadi. Dalam serin rekombinase, serin adalah asam amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Selama pembelahan DNA, ikatan protein-DNA terbentuk melalui reaksi transesterifikasi. Ikatan fosfodiester digantikan oleh ikatan fosfoserin antara gugus 5'fosfat di situs pembelahan dan gugus hidroksil dari residu serin yang dilestarikan. Ikatan baru menyimpan energi yang digunakan untuk membelah DNA di situs target. Energi ini kemudian digunakan untuk menggabungkan kembali DNA ke gugus hidroksil deoksiribosa yang sesuai di situs lain. Contoh serin rekombinase adalah serin resolvases/invertase dan serin integrase.
Apa itu Tirosin Rekombinase?
Tirosin rekombinase adalah kelas enzim lain yang mengatur rekombinasi spesifik lokasi konservatif. Seperti dijelaskan sebelumnya, tirosin rekombinase juga melakukan penataan ulang DNA dengan cara yang sama dengan mengenali dan mengikat urutan DNA pendek (situs target), di mana mereka membelah tulang punggung DNA. Kemudian terjadi pertukaran dua heliks DNA dan penyatuan kembali untai DNA.
Gambar 02: Tirosin Rekombinase
Tetapi dalam tirosin rekombinase, tirosin adalah asam amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Fitur umum dari kelas ini adalah residu tirosin nukleofilik yang dilestarikan yang menyerang DNA-fosfat scissile untuk membentuk hubungan 3′-fosfotirosin. Tirosin rekombinase (A1) dan tirosin integrase (A2) adalah kelompok enzim yang menonjol dalam keluarga enzim tirosin rekombinase.
Apa Persamaan Antara Serin dan Tirosin Rekombinase?
- Mereka adalah kelas enzim rekombinase.
- Keduanya mengatur rekombinasi khusus situs.
- Mereka adalah protein.
- Reaksi kimia dasarnya sama untuk keduanya.
- Keduanya mengkatalisis reaksi transesterifikasi.
Apa Perbedaan Serin dan Tirosin Rekombinase?
Dalam serin rekombinase, serin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Di sisi lain, dalam tirosin rekombinase, tirosin adalah asam amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA selama rekombinasi spesifik lokasi. Jadi, inilah perbedaan utama antara serin dan tirosin rekombinase. Ciri umum serin rekombinase adalah ia membentuk ikatan fosfoserin dengan DNA, sedangkan tirosin rekombinase membentuk ikatan fosfotirosin dengan DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi.
Infografis di bawah ini mencantumkan perbedaan antara serin dan tirosin rekombinase dalam bentuk tabel.
-
Perbedaan Antara Serin dan Tirosin Rekombinase dalam Bentuk Tabular
Ringkasan – Serin vs Tirosin Rekombinase
Rekombinasi dapat terjadi antara molekul DNA yang serupa seperti pada rekombinasi homolog atau molekul yang berbeda seperti pada rekombinasi non-homolog. Rekombinasi situs-spesifik adalah jenis rekombinasi genetik di mana pertukaran untai DNA terjadi antara segmen yang memiliki setidaknya tingkat homologi urutan tertentu. Ini dikatalisis oleh rekombinasi. Kebanyakan rekombinase dikelompokkan menjadi dua keluarga: serin rekombinase dan tirosin rekombinase. Serin rekombinase menggunakan serin sebagai asam amino nukleofilik untuk menyerang DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi. Tirosin rekombinase menggunakan tirosin sebagai asam amino nukleofilik untuk menyerang DNA selama proses rekombinasi spesifik lokasi. Oleh karena itu, inilah perbedaan utama antara serin dan tirosin rekombinase.
